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實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)技術(shù)作為分子生物學(xué)領(lǐng)域中重要的實(shí)驗(yàn)室儀器,,已廣泛應(yīng)用于各類生物學(xué)研究,。然而,由于操作不當(dāng),,許多研究人員在實(shí)驗(yàn)中遇到了數(shù)據(jù)精度不高,、重復(fù)性差、可信度差等問題,。本文針對(duì)這些問題,,從引物操作技巧、反應(yīng)體系配制技巧,、陰性對(duì)照技巧以及結(jié)果分析技巧四個(gè)方面,,詳細(xì)介紹了使用熒光定量PCR儀時(shí)如何優(yōu)化qPCR實(shí)驗(yàn)操作和數(shù)據(jù)分析,以提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性,。
一,、引物的操作技巧
使用熒光定量PCR儀在進(jìn)行qPCR實(shí)驗(yàn)時(shí),引物的設(shè)計(jì)至關(guān)重要,。使用引物設(shè)計(jì)軟件進(jìn)行設(shè)計(jì)時(shí),,需在操作界面上設(shè)定相應(yīng)的參數(shù),擴(kuò)增子參數(shù)一般設(shè)定范圍為80~200bp,。擴(kuò)增子長(zhǎng)度越短,,擴(kuò)增效率越高,可選擇設(shè)定在110bp,。引物一般由試劑公司合成,,為干粉狀態(tài),在溶解前,,最好用高速離心機(jī)低溫快速離心30s,,使得引物干粉匯聚到管底,避免損失引物,。收到引物后,,需要先摸索引物的退火溫度和終濃度,以達(dá)到較理想的qPCR擴(kuò)增效果,,其次測(cè)定引物的擴(kuò)增效率,。
二、反應(yīng)體系配制技巧
正式實(shí)驗(yàn)時(shí),,每個(gè)樣本至少3個(gè)重復(fù),,為了消除各重復(fù)之間的系統(tǒng)誤差,將所需的所有試劑和模板加在同一個(gè)PCR管中,,充分渦旋混勻后,,再分裝到3個(gè)重復(fù)孔中,這樣可有效減小系統(tǒng)誤差,。另外,,建議使用20μL以上的反應(yīng)體積,,以消除由于加樣不準(zhǔn)造成的系統(tǒng)誤差。
三,、陰性對(duì)照的技巧
陰性對(duì)照一般是指用水代替模板的反應(yīng)孔,,體系中除了模板,包括了其他的反應(yīng)組分,。由于qPCR的高靈敏性,,陰性對(duì)照有出現(xiàn)擴(kuò)增信號(hào)的情況,那么在針對(duì)這類問題時(shí),,我們需要判斷其原因所在,。使用染料法進(jìn)行qPCR實(shí)驗(yàn)時(shí),首先查看陰性對(duì)照的溶解曲線主峰是否跟陽性孔的主峰位置一致,。如果不一致,,則可能是引物性能不好,無模板或使用低濃度模板下會(huì)出現(xiàn)引物二聚體,,這種情況則需要考慮更換引物,,保證引物特異性以及擴(kuò)增效率。
四,、結(jié)果分析的技巧
使用熒光定量PCR儀進(jìn)行相對(duì)定量分析時(shí),,常用到的是2-ΔΔCq法,但是這種方法比較粗放,,因?yàn)樗那疤崾羌俣ㄋ幸锏臄U(kuò)增效率都為100%,。更為準(zhǔn)確的定量則需要考慮不同引物擴(kuò)增效率的差別??上扔锰荻认♂尩哪0鍦y(cè)試各引物的擴(kuò)增效率E,,獲得實(shí)際擴(kuò)增效率之后,后續(xù)實(shí)驗(yàn)只需要在軟件中直接輸入擴(kuò)增效率E值,,即可計(jì)算更精準(zhǔn)的相對(duì)定量值,。
通過對(duì)qPCR技術(shù)中引物操作技巧、反應(yīng)體系配制技巧,、陰性對(duì)照技巧以及結(jié)果分析技巧的優(yōu)化,,可以在很大程度上提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。
Q2000B熒光定量PCR儀采用目前進(jìn)口半導(dǎo)體技術(shù)以及 MARLOW 半導(dǎo)體芯片制造商生產(chǎn)的半導(dǎo)體材料做為核心部件,,確保產(chǎn)品的擴(kuò)增速度,、分析結(jié)果及系統(tǒng)可靠性,成為目前PCR行業(yè)的主流設(shè)備,。它具備多項(xiàng)先進(jìn)功能,,其屏幕可90°調(diào)節(jié),適應(yīng)不同視角需求,,確保了操作的便利性,;同時(shí),,它通過同步熒光檢測(cè)減少了延時(shí)誤差,提高了數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性,。設(shè)備自帶10英寸全真彩觸控屏,,允許用戶直接在屏幕上編輯、查看和運(yùn)行定量PCR及普通PCR程序,,無需依賴電腦。采用新一代半導(dǎo)體升降溫技術(shù),,擁有高達(dá)6°C/SEC的變溫速率和100萬次循環(huán)的使用壽命,。頂部檢測(cè)技術(shù)有效屏蔽背景干擾,提高熒光信號(hào)靈敏度和信噪比,,兼容白管和透明管,,確保結(jié)果的準(zhǔn)確。此外,,該還溫度梯度功能,,便于優(yōu)化反應(yīng)條件,并支持遠(yuǎn)程操控,,實(shí)時(shí)查看實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)及分析結(jié)果,。另外,采用SSLPTM短光程靜態(tài)熒光CCD成像技術(shù),,保證了熒光信號(hào)的穩(wěn)定性和靈敏度,。更多實(shí)驗(yàn)室儀器請(qǐng)進(jìn)入蘇州阿爾法生物實(shí)驗(yàn)器材有限公司網(wǎng)站咨詢。
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