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NuSmart^®在FFPE（福爾馬林固定石蠟包埋）鑒定中應(yīng)用

——無(wú)需脫蠟,、一片即結(jié)果

 

FFPE是"福爾馬林固定,、石蠟包埋"(Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded)的縮寫，是一種常見的組織樣本保存方法,。在醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中,，F(xiàn)FPE可用于組織學(xué)檢查、病理診斷和分子分析,。而FFPE在分子分析中的應(yīng)用主要包括：

1,、癌癥研究：FFPE樣本常用于癌癥基因組學(xué)研究，包括突變分析,、拷貝數(shù)變異檢測(cè)等,。

2、基因表達(dá)分析：FFPE樣本中的RNA可用于基因表達(dá)分析,，了解疾病相關(guān)基因的表達(dá)模式,。

3、DNA甲基化分析：FFPE樣本可用于研究DNA甲基化狀態(tài),，探索與疾病相關(guān)的表觀遺傳學(xué)改變,。

4、miRNA分析：FFPE樣本中的miRNA可用于研究其在疾病發(fā)生發(fā)展中的作用,。

5,、生物銀行和歷史樣本研究：利用存儲(chǔ)的歷史FFPE樣本進(jìn)行生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證研究。

愿望是美好的,，現(xiàn)實(shí)是提取FFPE中DNA存在很多“痛處",，例如

1、DNA損傷和化學(xué)修飾：福爾馬林固定導(dǎo)致DNA發(fā)生化學(xué)修飾,，如堿基脫嘌呤,、鏈間交聯(lián)等。

2,、DNA片段化：FFPE樣本中的DNA通常已部分降解,，形成較小的片段，這可能影響某些需要較長(zhǎng)DNA片段的實(shí)驗(yàn),。

3,、DNA與蛋白質(zhì)的交聯(lián)：DNA可能與組蛋白等蛋白質(zhì)緊密交聯(lián)，增加了提取和純化的難度,。

4,、樣品質(zhì)量控制：組織脫水,、固定延遲或時(shí)間過長(zhǎng)等因素都會(huì)損害標(biāo)本質(zhì)量。

5,、DNA提取效率：目前市場(chǎng)的FFPE提取試劑盒性能差異很大,，提取時(shí)間和提取效率都有很大不同。

6,、PCR抑制劑：FFPE樣本中可能存在PCR抑制劑,，影響后續(xù)的PCR擴(kuò)增反應(yīng)。

NuSmart^®技術(shù)wan美解決以上痛點(diǎn),，NuSmart^®FFPE樣本PCR試劑盒提供了FFPE Buffer用于將切片中組織DNA釋放出來(lái),，高耐受力的2× FFPE Smart Mix能夠抑制常見干擾劑?？偨Y(jié)來(lái)看有以下特點(diǎn)：

—1-2片切片就有結(jié)果

—操作簡(jiǎn)單,，無(wú)需脫蠟

—操作便捷，僅需要10分鐘

—僅需要加熱處理

—無(wú)需配備昂貴設(shè)備

 

操作流程

 

 

 

案例 不同組織切片擴(kuò)增8對(duì)引物

 

1,、肝 2,、肺 3、胃

 

使用NuSmart^®FFPE樣本PCR試劑盒（貨號(hào)Nu-FFPE0101）處理肝,、肺,、胃三組切片，使用2× FFPE Smart Mix擴(kuò)8對(duì)引物,。