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Biometra-PCR儀 - 技術(shù)原理,;
DNA的半保留復(fù)制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,,在DNA聚合酶與啟動子的參與下,,根據(jù)堿基互補配對原則復(fù)制成同樣的兩分子挎貝。在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)實驗中發(fā)現(xiàn),,DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈,,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,,通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,,并設(shè)計引物做啟動子,加入DNA聚合酶,、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制,。但是,DNA聚合酶在高溫時會失活,,因此,,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不僅操作煩瑣,,而且價格昂貴,,制約了PCR技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。發(fā)現(xiàn)耐熱DNA聚合同酶--Taq酶對于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,,不需要每個循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡捷,、同時也大大降低了成本,,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,,并逐步應(yīng)用于臨床。
1)內(nèi)參照法:在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成,。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記,。在模板擴增的同時,,內(nèi)標(biāo)也被擴增。在PCR產(chǎn)物中,,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高 效液相分離開來,分別測定其熒光強度,,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板,。
2)競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標(biāo)記),。擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,,而待測模板不被酶切,,可通過電泳或高 效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強度,,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù),。
3)PCR-ELISA法:利用或生物素等標(biāo)記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,,再加入抗或生物素酶標(biāo)抗體-辣根酶結(jié)合物,,最終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,,若加入內(nèi)標(biāo),,作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的,。
Biometra-內(nèi)標(biāo)在傳統(tǒng)定量中的作用;
由于傳統(tǒng)定量方法都是終點檢測,,即PCR到達平臺期后進行檢測,,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴增到達平臺期時,檢測重現(xiàn)性極差,。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復(fù)實驗,,所得結(jié)果有很大差異,因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量,。加入內(nèi)標(biāo)后,,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準(zhǔn)確性,。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量,、粗略定量的方法,。
制備和操作用于核酸提取的試劑時應(yīng)該采取預(yù)防措施:
⑴PCR產(chǎn)物和帶有要擴增序列的DNA克隆不能在這個房間操作。
⑵組織培養(yǎng)物,、組織標(biāo)本和血清樣品都帶進樣品準(zhǔn)備間處理,,以根據(jù)應(yīng)用的需要提取DNA或RNA。
⑶用于樣品處理的工具不能被用作普通分子克隆的工具,,也不能用作操作靶序列,。
⑷DNA樣品應(yīng)該用有專門的防護或正壓活塞式移液管操作,以防止在吸取樣品時有氣溶膠遺留,。
⑸大體積樣品應(yīng)該用單獨包裝的無菌一次性移液管吸取,。
⑹管子打開前都要簡短離心以減少氣溶膠的產(chǎn)生,而且管子不能用力崩開,,這樣會產(chǎn)生氣溶膠,。
⑺任何時候都應(yīng)該穿實驗服和帶手套,手套要經(jīng)常更換,,尤其在抽提過程中每一步之間都要更換,。實驗服要專門用于樣品準(zhǔn)備間,經(jīng)常清洗,。