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riboPOOL適合任意物種的核糖體RNA去除方案

RNA測(cè)序是一種高度準(zhǔn)確且靈敏的轉(zhuǎn)錄組追蹤工具,。然而,，一些豐度很高的RNA種類卻影響了NGS文庫(kù)制備，浪費(fèi)了寶貴的測(cè)序資源,。

在提取到的總RNA中,，核糖體RNA（rRNA）占95%左右，mRNA占2-3%,，還有2-3%是非編碼RNA,，如Long non-coding RNA、tRNA,、microRNA等,。

所以，在RNA測(cè)序的過(guò)程當(dāng)中,，首先要解決的問(wèn)題,，是如何去除核糖體RNA（rRNA）。

riboPOOL是來(lái)自德國(guó)的核糖體RNA去除產(chǎn)品,，能夠高效去除與研究無(wú)關(guān)的RNA,，讓研究人員更高效地利用測(cè)序資源。

riboPOOL核糖體RNA去除方案，適合任意物種,，去除效率高且效果穩(wěn)定,，廣泛應(yīng)用于RNA-seq、芯片,、ribo-seq（ribosome profiling）等領(lǐng)域,，在歐洲*。

riboPOOL由精心設(shè)計(jì)的生.物.素標(biāo)記的DNA探針混合物構(gòu)成,，保證RNA完整的前提下,，比Ribo-Zero（Illumina）多去除約10%的rRNA。

riboPOOL主要優(yōu)勢(shì)

1,、任意物種

去除任意物種的rRNA或高豐度mRNA：豐富的成品型目錄可供選擇,，目錄持續(xù)更新中；目錄以外的物種的rRNA,，或者組織特異性的高豐度mRNA均可定制,。

2、去除不依賴poly-A結(jié)構(gòu)

適合非Ploy-A化的RNA（如snoRNA,、lncRNA,、組蛋白）的研究和原核生物。

3,、廣泛的起始量范圍

在100 ng到5 μg的RNA起始量之間都有很好的去除效率,。

ribPOOL特殊應(yīng)用

1、原核通用型riboPOOL與環(huán)境基因組學(xué)

原核通用型不僅可以廣泛應(yīng)用于各種原核生物樣本（細(xì)菌,、古生菌）,，還可以處理含有不同微生物的復(fù)雜樣本，如環(huán)境基因組樣本（如土壤,、污泥）,。

2、去除高豐度RNA

除rRNA之外, riboPOOL還可以去除組織特異性mRNA（如人血珠蛋白）或其他測(cè)序時(shí)出現(xiàn)的不相關(guān)的高豐度RNA,。

3,、可應(yīng)用于Ribosome profiling

riboPOOLs 可以應(yīng)用于ribosome profiling樣本，更多信息,，請(qǐng)聯(lián)系我們,。

4、復(fù)合型riboPOOL可以去除混合樣本中的rRNA

復(fù)合型riboPOOL可以去除含多個(gè)物種的混合樣本中的rRNA,?？蛻艨筛鶕?jù)樣本的組成比例混合2-4種成品型riboPOOL使用，如病原體感染的人體組織（人源+原核通用型）,、人血液樣本（人源+人血珠蛋白）,。

實(shí)驗(yàn)流程

實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)

人類樣本中，riboPOOL的去除效率是98.6%,，而Comp Z的去除效率是80.6%,。

小鼠樣本中，riboPOOL的去除效率是96.4%,，而Comp Z的去除效率是86.1%,。

2013年，siTOOLs Biotech公司由RNA領(lǐng)域的專家在慕尼黑和雷根斯堡成立,，團(tuán)隊(duì)涵蓋RNAi篩選,、RNA生產(chǎn)和生物信息學(xué)等方面具有長(zhǎng)期經(jīng)驗(yàn)的科學(xué)家，產(chǎn)品在歐洲得到研究院校和制藥企業(yè)的廣泛認(rèn)可,，在中國(guó)的總代理是藍(lán)景科信,。

siTOOLs Biotech主要產(chǎn)品線：

siPOOL—基因沉默工具（siRNA）

raPOOL—RNA捕獲工具

riboPOOL—核糖體RNA去除工具（riboPOOL適合任意物種的核糖體RNA去除方案）

實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定可重復(fù)，為您節(jié)約時(shí)間和成本,。我們還提供先進(jìn)的大數(shù)據(jù)分析工具(Phenovault)和研究服務(wù),，助力臨床前研究中的靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證。

核心技術(shù)

科學(xué)設(shè)計(jì),、集群效應(yīng),，保證高效特異的作用于靶基因。

類似狼群所展示的群體智慧,，我們利用集群的力量來(lái)實(shí)現(xiàn)具有挑戰(zhàn)性的目標(biāo),。基于此理念,，我們科學(xué)優(yōu)化設(shè)計(jì)siRNAs或生.物.素化探針混合物,，并反復(fù)被證明可以顯著減少脫靶效應(yīng)，實(shí)驗(yàn)效率高,，結(jié)果可靠且可重復(fù),。

核心文獻(xiàn)：

Hannus, M., et al.(2014) siPools: highly complex but accurately defined siRNA pools eliminate off-target effects. Nucleic Acids Res 42(12): 8049?8061.