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貨物所在地:北京北京市
更新時間:2024-05-27 17:07:20
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植物通用(被子開花植物)rRNA去除試劑盒
RNA測序是一種高度準確且靈敏的轉(zhuǎn)錄組追蹤工具。然而,,一些豐度很高的RNA種類卻影響了NGS文庫制備,,浪費了寶貴的測序資源。
在提取到的總RNA中,,核糖體RNA(rRNA)占95%左右,,mRNA占2-3%,還有2-3%是非編碼RNA,,如Long non-coding RNA,、tRNA、microRNA等,。所以,,在RNA測序的過程當中,首先要解決的問題,,是如何去除核糖體RNA(rRNA),。
riboPOOL是來自德國的核糖體RNA去除產(chǎn)品,,能夠高效去除與研究無關(guān)的RNA,讓研究人員更高效地利用測序資源,。
Pan-Plant riboPOOL植物通用型核糖體RNA去除試劑盒,,通用高效去除開花植物(被子植物)核糖體RNA.
1、高效的rRNA去除試劑
2,、廣泛覆蓋開花植物
3,、適合葉片、種子和根等各種組織部位
4,、可去除28S, 18S, 5.8S & 5S rRNAü
5,、可去除線粒體 rRNA
6、可去除質(zhì)體rRNA(包括葉綠體)
7,、高豐度的核糖體 RNA (rRNA)限制了轉(zhuǎn)錄組測序中目的RNA的檢測,。植物通用型 riboPOOL 為您提供特異性去除開花植物rRNA的通用解決方案,適合葉片,、種子和根等各種組織部位,,可去除細胞質(zhì)(28S、18S,、5.8S和5S),、質(zhì)體和線粒體rRNA。
植物通用型 riboPOOL覆蓋物種廣泛
植物通用型 riboPOOL由生.物.素標記的DNA探針組成,,可以覆蓋開花植物的主要門類,。
植物通用型 riboPOOL 可去除的植物物種包括30多個目(見下圖)
常見物種,如下:
水稻,、麻瘋樹,、大豆、土豆 ,、棉花,、咖啡、胡蘿卜,、洋薊,、橄欖、擬南芥,、玉米,、翠菊,、小麥,、蘋果、橙子,、蕎麥及其他,。
如果您感興趣的物種不屬于這些門類,,請咨詢我們的定制型 riboPOOL產(chǎn)品。
植物通用型 riboPOOL的測試結(jié)果不同門類中rRNA去除效率都很高,;
植物通用型核糖體RNA去除試劑的β測試(客戶測試)結(jié)果如下:開花植物的去除效率大于91%,,測試物種為被子植物的蝶形花科、刺蓮花科,、蕓苔屬和薔薇科的六種植物,。值得注意的是,原始藻類綠藻在測試中的rRNA去除效率為80%,,表明植物通用型riboPOOL可以應(yīng)用于被子植物以外的植物門類,。
測試數(shù)據(jù)由馬克斯·普朗克基因組中心的Dr. Bruno Huettel和Dr. Christian W?hle提供。用QIAgen RNeasy提取總RNA(1 μg,,RIN ~8),,用Pan-Plant riboPOOL法去除rRNA,然后用RNA XPClean (Beckman Coulter)純化,。分別使用NEB試劑盒(modified)和Illumina HiSeq3000進行文庫制備和測序,。
更多信息:
無酶去除法
非Poly-A捕獲
實驗時間約70分鐘
適宜的RNA起始量為100 ng - 3 μg
與各種RNA純化方法和RNA建庫試劑盒兼容
可以與其他物種的RiboPOOL混合使用,用于組成復(fù)雜的樣本,。例如:植物通用型與原核通用型riboPOOL混合使用,,可用于植物微生物群研究。
植物通用(被子開花植物)rRNA去除試劑盒產(chǎn)品形式: