SDS-PAGE電泳的常見問題解析

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1.關(guān)于凝膠的一些問題

膠的凝結(jié)不好,，例如有花紋特別是濃度高的膠在冬天溫度較低的情況下，在分離膠的下部有波浪樣的花紋,，凝膠不均勻,。解決方法：加大TEMED和過硫酸胺的量，使其凝結(jié)速度加快,。同時洗干凈玻璃板,，防止有殘留的膠干結(jié)在玻璃板上。

膠不凝,，解決方法：溫度較低時加大TEMED和過硫酸胺的量,，過硫酸胺必須新鮮配制。如若還是不行重新配制一下緩沖溶液,。

膠易碎,，例如濃度較高的膠在染色和脫色過程以及掃描過程中破裂。解決方法：首先在上述過程中一定要動作輕緩,，其次在室溫較高的情況下可以適當(dāng)減少TEMED和過硫酸胺的量,。

電泳完后膠上有很多長條紋的雜帶，解決方法：建議電泳緩沖液不要回收利用,。配制膠的溶液一定要純,。

2.凝膠時間不對

通常膠在30分鐘到1小時內(nèi)凝。如果凝的太慢,，可能是TEMED,，AP劑量不夠。如果凝的太快,，可能是AP和TEMED用量過多,，此時膠太硬易裂,，電泳時易燒膠,。

3.濃縮膠與分離膠斷裂,、板間有氣泡對電泳的影響

前者主要原因是拔梳子用力不均勻或過猛所致；后者是由于在解除制膠的夾子后,，板未壓緊而致空氣進(jìn)入引起的,，一般對電泳結(jié)果不會有太大的影響。

4.樣品的處理

根據(jù)樣品分離目的不同,，主要有三種處理方法：還原SDS處理,、非還原SDS處理,、帶有烷基化作用的還原SDS處理。

還原SDS處理：在上樣buffer中加入SDS和DTT（或Beta巰基乙醇）后,，形成SDS與蛋白相結(jié)合的分子,。

帶有烷基化作用的還原SDS處理：碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的保護(hù)SH基團(tuán)，得到較窄的譜帶,；另碘乙酸胺可捕集過量的DTT,，而防止紋理現(xiàn)象的產(chǎn)生。100uL樣品緩沖液中加入10uL20%的碘乙酸胺,，并在25℃下保藏30min,。

非還原SDS處理：生理體液、血清,、尿素等樣品,，一般只用1%SDS沸水中煮3min，未加還原劑,，因而蛋白折疊未被破壞,，不可作為測定分子量來使用。

5.條帶兩邊翹起中間凹下的原因（︶）

在較厚的凝膠中,，由于凝膠不均勻冷卻,，中間部分凝固不好,。

電泳系統(tǒng)溫度偏高,。

處理辦法：待其充分凝固再作后續(xù)實驗。

6.條帶兩邊向下中間鼓起的原因（︵）

一般原因是兩板之間的底部間隙氣泡未排除干凈,，或聚合不*,。

處理辦法：可在兩板間加入適量緩沖液，以排除氣泡,。

7.條帶偏斜

原因：電極不平衡或者加樣位置偏斜,。

8.條帶兩邊擴(kuò)散

原因：加樣量過多。

9.電泳的條帶過粗

電泳中條帶很粗是常見的事,，主要是濃縮膠的原因,。

處理辦法：適當(dāng)增加濃縮膠的長度；保證濃縮膠貯液的pH正確,；適當(dāng)降低電壓,。

10.目的蛋白質(zhì)條帶模糊

電泳凝膠濃度選擇不當(dāng)。

低于10Kd的小分子蛋白質(zhì)要用Tricine膠,。

靠近前沿的電泳帶分辨率不佳,。根據(jù)分子量與凝膠孔徑的關(guān)系，選擇適當(dāng)濃度的凝膠,。

蛋白質(zhì)樣品水解,。注意除去蛋白質(zhì)樣品的內(nèi)源性的水解酶,，不要反復(fù)凍融。

電泳時間過長或過短,。溴酚藍(lán)達(dá)到分離膠的底部即應(yīng)該關(guān)閉電泳電源,。

緩沖溶液、SDS都要新鮮配制,。

避免加樣過多,，提高分辨率。小體積樣品可給出窄帶,，加樣體積根據(jù)樣品濃度和凝膠厚度靈活掌握,。一般上樣體積為10-15uL（即2-10ug蛋白質(zhì)）。

加熱變性后的蛋白質(zhì)樣品要放置到室溫即電泳,，不要久放,，因為蛋白質(zhì)的二硫鍵在高溫下可能是會斷開，但是暴露于空氣中溫度降低會重新形成二硫鍵,，而且可能在過久放置過程中蛋白質(zhì)可能會再折疊,，更不要扔到冰箱里保存。

11.“鬼帶"的出現(xiàn)及處理

“鬼帶"就是在跑構(gòu)象復(fù)雜的蛋白質(zhì)大分子時,，在泳道頂端出現(xiàn)一些未知條帶或在加樣孔底部生成沉淀,，這主要是因為還原劑在加熱的過程中被氧化失活，使解離的蛋白質(zhì)分子重新折疊和亞基重新締合,，由于其分子量通常要比目標(biāo)條帶大,，所以會生成未知條帶或沉淀。

處理辦法：在加熱煮沸后,，再添加適量的DTT或Beta巰基乙醇,，以補(bǔ)充不足的還原劑；或可加適量EDTA來阻止還原劑的氧化,。

12.拖尾現(xiàn)象

主要是樣品溶解效果不佳或分離膠濃度過大引起的,。

處理辦法：加樣前離心；選擇適當(dāng)?shù)臉悠肪彌_液,，加適量樣品促溶劑,；電泳緩沖液時間過長，重新配制,；降低凝膠濃度,。

13.紋理現(xiàn)象

主要是樣品不溶性顆粒引起的。

處理辦法：加樣前離心,；加適量樣品促溶劑,。

14.溴酚藍(lán)不能起到指示作用

我們在實驗中有時會出現(xiàn)溴酚藍(lán)已跑出板底，但蛋白質(zhì)卻還未跑下來的現(xiàn)象,。

主要原因：緩沖液和分離膠的濃度過高,。

處理辦法：更換正確pH值的Buffer,；降低分離膠的濃度。

15.甘氨酸在電極緩沖液中的作用

SDS-PAGE中樣品液和濃縮膠選TRIS/HCL緩沖液,，電極液選TRIS/甘氨酸,，電泳開始后，HCL解離成氯離子,，甘氨酸解離出少量的甘氨酸根離子,。蛋白質(zhì)帶負(fù)電荷，因此一起向正極移動,，其中氯離子最快,，甘氨酸根離子最慢，蛋白居中,。電泳開始時氯離子泳動率最大,，超過蛋白，因此在后面形成低電導(dǎo)區(qū),，而電場強(qiáng)度與低電導(dǎo)區(qū)成反比,，因而產(chǎn)生較高的電場強(qiáng)度，使蛋白和甘氨酸根離子迅速移動,，形成以穩(wěn)定的界面,，使蛋白聚集在移動界面附近，濃縮成一中間層,。

16.電泳電壓很高但電流很低

現(xiàn)象：電壓50v以上,，可電流卻在5mA以下。

主要原因：電泳槽沒有正確裝配,，電流未形成通路,。包括：內(nèi)外槽裝反；外槽液過少等,。

處理辦法：正確裝配電泳槽即可。

17.如何提高SDS-PAGE電泳分辨率

使聚丙烯酰胺的充分聚合,，可以提高凝膠的分辨率,。

建議做法：待凝膠在室溫凝固后，可在室溫下放置一段時間使用,。忌即配即用或冰箱放置,，前者易導(dǎo)致凝固不充分，后者可導(dǎo)致SDS結(jié)晶,。

18.電泳時間比正常要長

可能是因為凝膠緩沖系統(tǒng)和電級緩沖系統(tǒng)地PH選擇錯誤,，即緩沖系統(tǒng)地PH和被分離物質(zhì)的等電點(diǎn)差別太小，或緩沖系統(tǒng)的離子強(qiáng)度太高,。

19.配膠緩沖液系統(tǒng)在電泳中的影響

緩沖液在電泳過程中的主要作用是維持合適的pH,。電泳時正極與負(fù)極都會發(fā)生電解反應(yīng),，正極發(fā)生的是氧化反應(yīng)，負(fù)極發(fā)生的是還原反應(yīng),，長時間的電泳將使正極變酸,，負(fù)極變堿。緩沖液可以維持溶液兩極的pH保持基本不變,。在濃縮膠中,，pH環(huán)境呈弱酸性，因此甘氨酸解離很少,，泳動效率低,；而CL離子卻很高，兩者之間形成導(dǎo)電性較低的區(qū)帶,，蛋白分子就介于二者之間泳動并聚集到一起,，濃縮為一狹窄的區(qū)帶。所以,，pH對整個反應(yīng)體系的影響是至關(guān)重要的,，實驗中在排除其他因素之后仍不能很好解決問題的情況，應(yīng)首要考慮該因素,。

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