目錄:上海牧榮生物科技有限公司>>實驗試劑>>其他試劑>> M3029.0100含紅色染料的 RedMasterMix (2x) Taq PCR MasterMix
供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 貨號 | M3029 |
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè),制藥/生物制藥 |
輕松跟蹤移液步驟
穩(wěn)健的性能 – 高度穩(wěn)定的 PCR 預(yù)混液
菌落篩選 – 針對快速篩選進(jìn)行了優(yōu)化
無需額外步驟 – 已包含上樣緩沖液
方便的規(guī)格 – 1.5 mL 等分試樣大小,,易于作
含紅色染料的 PCR MasterMix,用于移液步驟的視覺控制:PCR 后,,無需添加電荷緩沖液即可進(jìn)行電泳,。這使得該 PCR 預(yù)混液 (2x) 節(jié)省了時間和成本,。含紅色染料的 PCR RedMasterMix (2x) 還具有高度特異性的特點,,可獲得最佳結(jié)果,。
PCR MasterMix (2x) 是以下成分的優(yōu)化(即用型)混合物:
- Taq DNA 聚合酶
- dNTP
- MgCl2
- 紅色染料
- 反應(yīng)緩沖液
用于使用 PCR 高效擴增 DNA 模板,。您所要做的就是添加引物和模板 DNA。同時,,PCR 預(yù)混液含有添加劑和紅色染料,,這使得無需添加電荷緩沖液即可進(jìn)行后續(xù)電泳。該 PCR RedMastermix 專為擴增子長度達(dá) 4 kb 的常規(guī) PCR 而開發(fā),。緩沖液的特殊成分保證了即使在反復(fù)解凍和冷凍循環(huán)后也能獲得可重復(fù)的結(jié)果,。
含 Red 染料的 PCR 預(yù)混液以 1.25 mL 的方便等分試樣運輸。
我們的 RedMastermix 也可用于 Sanger 測序,。為此,,請在 PCR 后以 1:8 的比例稀釋 PCR 混合物,或用離心柱純化,,然后應(yīng)用,。
規(guī)格:
用于 PCR 的 2 次即用型預(yù)混液,包括用于更好地觀察移液的紅色染料和凝膠上樣染料,。已包括 dNTP,、緩沖液和 DNA 聚合酶。
方便的等分試樣大?。?.25 mL。該預(yù)混液在 +2°C 至 +8°C 下可穩(wěn)定保存至少 8 個月,。
用于小鼠尾巴的可靠 PCR,。用于 Sanger 測序反應(yīng)。
One unit is defined as the amount of enzyme which will convert 10 nmoles of dNTPs to an acid-insoluble form in 30 min at 72°C under the assay conditions (25 mM TAPS (tris-(hydroxymethyl)-methyl-amino-propanesulfonic acid, sodium salt) pH 9.3 (25°C); 50 mM KCl; 2 mM MgCl2; 1 mM b-mercaptoethanol; and activated calf thymus DNA as substrate.
synthetic
eclass-Nr: 32-16-05-02
技巧
對于每個模板/引物對,,必須憑經(jīng)驗評估最佳反應(yīng)條件,,例如通過改變引物與模板的比例或離子強度(使用 MgSO4)和循環(huán)參數(shù)(時間和溫度)。
DNA 模板
GENAXXON Red 預(yù)混液特別適用于不太干凈的鼠尾 DNA
關(guān)于 10E4需要靶 DNA 的拷貝才能在 25-30 個循環(huán)后獲得可檢測的產(chǎn)物,。
使用 1pg–1ng 質(zhì)粒 DNA 或病毒 DNA,。
使用 1ng–1 μg 用于基因組 DNA。
較高的 DNA 濃度會降低擴增子特異性,,并導(dǎo)致額外的條帶,,尤其是當(dāng)使用大量循環(huán)時。
如果需要較少的循環(huán)次數(shù),,例如為了提高特異性,,可以使用更高的 DNA 濃度。
底漆
一般來說,,這些應(yīng)該有 20-30 個核苷酸的長度,。
理想的 GC 含量為 40-60%,。
GC 堿基應(yīng)盡可能均勻地分布在引物上。
引物對的兩種引物的熔解溫度相差不應(yīng)超過 5°C,。
避免引物內(nèi)的二級結(jié)構(gòu)(例如發(fā)夾)以及所用引物對之間潛在的二聚化區(qū)域,。
如果將轉(zhuǎn)基因位點(側(cè)面定向誘變)摻入引物中,那么最好在距離側(cè)面定向誘變位點 5' 處插入 4-6 個額外的堿基,,以便引物可以在正確的位置退火,。
每種引物的最終濃度應(yīng)在 0.05-1 μM 之間(0.05 μM 是下限),典型值在 0.1 至 0.5 μM 之間,。
較高的濃度會導(dǎo)致引物二聚化增加,,并“產(chǎn)生"或模擬假擴增產(chǎn)物。
在引物和探針的情況下,,可以假設(shè)隨著引物量的增加,,PCR 一開始當(dāng)然也會運行得更好(通常一開始會預(yù)期 Ct 值會更早)。然而,,隨著濃度的持續(xù)增加,,PCR 達(dá)到飽和。除了略低的 Ct 值外,,熒光信號通常也在開始時以較高的引物/探針濃度被放大,。
此外,可以添加一個或多個探針(應(yīng)始終充分測試必要的濃度),。我們建議在 50-500 nM 之間,。在這方面,應(yīng)測試不同的組合,。
鎂濃度
1.5-2.0 mM Mg2 + 是 Taq DNA 聚合酶作用的選擇,,但最佳 Mg2 + 濃度在很大程度上取決于模板、緩沖液組成,、DNA 量以及 dNTP,,因為后兩者尤其具有螯合鎂的高傾向,從而將其從 PCR 反應(yīng)中吸收,。
如果 [Mg2+] 太低:不可見 PCR 產(chǎn)物,。
如果 [Mg2+] 過高:可以看到不需要/不正確的 PCR 產(chǎn)物??赡苤荒芸吹酵科?。
脫氧核苷酸 (dNTPs >)
典型濃度為 200 μM 每個單獨的 dNTP。然而,,原則上,,200-400 μM 的 dNTP 是 PCR 的良好濃度。
50-100 μM 的較低濃度會增加特異性,,但在某些情況下會顯著降低產(chǎn)量,。
較高的濃度會增加產(chǎn)量,,尤其是對于長擴增子,但會顯著降低特異性,。
DNA 聚合酶
選擇正確的聚合酶取決于預(yù)期用途和所使用的模板(標(biāo)準(zhǔn) PCR:高準(zhǔn)確度的 Taq DNA 聚合酶 S >,,高產(chǎn)量的 Taq 聚合酶 E >;預(yù)混液:標(biāo)準(zhǔn) PCR MasterMix > 或 Red MasterMix >含紅色染料)。
對于多重 PCR,,有特殊的凍干多重 MasterMixe >,。
為了提高特異性或?qū)τ诶щy的模板,建議使用熱啟動應(yīng)用程序,。為此,,>有特殊的熱啟動聚合酶。
對于用于克隆或其他需要低錯誤率的方法的 PCR,,熱穩(wěn)定的高保真校正聚合酶,,如
Pfunds >、ExactRun >,、ReproFast > 或 ReproHot (KOD) 校正聚合酶>,。這些酶在擴增過程中的錯誤要少得多,并增加了無錯誤擴增子的機會,。
對于基因分型和其他需要高鑒別度的應(yīng)用,,有一種新型高選擇性 DNA 聚合酶 SNP Pol DNA 聚合酶 >。它特異性地區(qū)分錯配的引物模板復(fù)合物,,并特異性地僅提供具有*全匹配引物對的 PCR 產(chǎn)物,。
對于實時定量 PCR >,有高度專業(yè)化的 qPCR 預(yù)混液,。在這里,,選擇合適的預(yù)混液取決于所使用的 qPCR 設(shè)備。例如,,重要的是要注意 qPCR 預(yù)混液中是否應(yīng)包含 ROX 以及應(yīng)包含多少 ROX,以及它是帶有綠色熒光染料>的 Green qPCR Mastermix 還是不含熒光染料的 Probe qPCR MasterMix >,。也可提供在室溫下穩(wěn)定的微珠凍干 (LyoBalls >),。
PCR 反應(yīng)中使用的 DNA 聚合酶量會顯著影響 PCR 結(jié)果(對于 50 μL 方法,使用 1.25 - 1.5 單位 Taq 聚合酶>),。
退火
退火溫度應(yīng)通過溫度梯度進(jìn)行優(yōu)化,。退火期也會影響成功。確實,,使用不同的預(yù)混液或使用其他供應(yīng)商的反應(yīng)緩沖液會對退火溫度產(chǎn)生嚴(yán)重影響,。
引物對的兩種引物的熔解溫度相差不應(yīng)超過 5°C。
典型的退火溫度比所用引物的*低 Tm 低約 5°C,。溫度通常下降到 50-60°C 之間,。
如果存在非特異性條帶或潤滑,,則應(yīng)測試更高的退火溫度。
典型的退火時間在 15-30 秒范圍內(nèi),。
延伸溫度和時間
擴增子延伸通常在 68°C 下進(jìn)行,。
作為一般規(guī)則,可以假設(shè)每 1000 個堿基對的標(biāo)準(zhǔn) Taq 聚合酶在 68°C 下的延伸時間為 1 分鐘(或 2000 個堿基對為 2 分鐘,,或 3000 個堿基對為 3 分鐘),。
對于小于 1 kb 的 PCR 產(chǎn)物,可以采取 45-60 秒(如果不是接近 1 kb 的擴增子,,則更像是 45 秒),。
超過 3000 個堿基對的 PCR 產(chǎn)物和超過 30 個循環(huán)的 PCR 方案都可能需要更長的延伸時間。因此,,應(yīng)再次優(yōu)化更長的擴增子或更高的循環(huán)數(shù),。
擴增具有高 GC 含量、強二級結(jié)構(gòu),、低濃度或大于 5 kb 的擴增子的模板通常需要優(yōu)化 PCR 條件,。通常,在 PCR 過程中應(yīng)在 95°C 下進(jìn)行 15-30 秒的變性,。
上海牧榮生物科技有限公司 是一家專注于分子生物學(xué),、細(xì)胞生物學(xué)、細(xì)菌學(xué),、遺傳學(xué),、免疫學(xué)、生物化學(xué),、蛋白質(zhì)學(xué),、細(xì)胞治療、臨床應(yīng)用等領(lǐng)域,,以銷售為主的生物技術(shù)公司,。銷售的產(chǎn)品涉及,細(xì)胞株和菌株,、胎牛血清,、生化試劑、ELISA試劑盒,、抗體和抗原,、細(xì)胞因子、技術(shù)服務(wù),、實驗耗材和消耗品,、儀器設(shè)備等??蛻舯椴即髮W(xué),、研究所,、醫(yī)院、衛(wèi)生防疫,、商品檢驗檢疫,、制藥公司、生物技術(shù)公司和食品工業(yè)等單位,。
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