常見的修飾是熒光標記,、熒光猝滅劑和其他報告基團,。可以使用活化酯連接炔烴和疊氮基,,以使生物分子適應點擊化學,。
尤其常見的是蛋白質(zhì)和肽的修飾,因為它們幾乎總是含有氨基,。其他例子是氨基寡核苷酸的修飾,、氨基修飾的DNA和含氨基的糖。
NHS 酯與氨基的反應強烈依賴于 pH 值:在低 pH 值下,,氨基被質(zhì)子化,,并且不會發(fā)生修飾。在高于最佳 pH 值時,,NHS 酯的水解速度很快,,并且修飾分子的產(chǎn)率會降低。改性的最佳pH值為8.3-8.5,。
水是用于溶解 NHS 酯以進行生物分子標記的常用溶劑,。如果NHS酯難溶于水溶液,,可首先將其溶解在 二甲基亞砜(DMSO)或二甲基甲酰胺(DMF)中,,然后添加到pH 8.3-8.5緩沖液中的蛋白質(zhì)溶液中。請注意,,DMF 可以降解為二甲胺,,二甲胺具有魚腥味,并且能夠與活化酯發(fā)生反應,。因此,,標記生物分子時,使用不含二甲胺,、無魚腥味的高質(zhì)量DMF非常重要,。
使用下面的公式或我們的蛋白質(zhì)標記計算器計算所需的 NHS 酯量:
NHS_酯_重量 [mg] = 8 × 氨基_化合物_重量 [mg] × NHS_酯_摩爾_重量 [Da] / 氨基_化合物_摩爾_重量 [Da]。
8是摩爾過量的NHS酯,。它是單標記的經(jīng)驗值,,適用于許多常見的蛋白質(zhì)和肽,。然而,在某些情況下,,使用更少或更多的 NHS 酯可以增加修飾生物分子的產(chǎn)量,。它取決于蛋白質(zhì)結構、標記所用試劑及其溶解度,。 Lumiprobe 產(chǎn)品的摩爾重量可以在相應的產(chǎn)品頁面上找到,。
例如,要使用 Cy5 NHS 酯(摩爾量 616 道爾頓)標記 3 mg BSA(摩爾量 66500 道爾頓),,并獲得單標記產(chǎn)物的最大產(chǎn)量,,應使用 8 × 3 mg × 616 Da / 66500 Da = 0.22 毫克 Cy5 染料 NHS 酯。
計算反應混合物的體積,。標記反應中的最佳生物分子濃度為1-10 mg/mL,。標記可以在任何規(guī)模上進行,從納摩爾到幾十克,。如果標記少量生物分子,,請將反應混合物的體積保持在低水平 (10-20 uL)。
將 NHS 酯溶解在 1/10 反應體積的水,、DMF 或 DMSO 中,。不含二甲胺的DMF或水是優(yōu)選的溶劑。溶解在 DMF 中的 NHS 酯可在 -20°C 下在溶液中保存 1-2 個月,。 NHS酯的水溶液配制后應立即使用,。
將生物分子溶解在 9/10 反應體積的 pH 8.3-8.5 緩沖液中。
0.1 M 碳酸氫鈉溶液具有適當?shù)?pH 值,。另一種選擇是 0.1 M 磷酸鹽緩沖液,。請注意,pH 值是成功用 NHS 酯標記生物分子的最重要因素,。避免使用含有胺的緩沖液(有時可以使用基于 Tris 的緩沖液,,但不推薦使用。Tris 含有氨基,,但對活化酯的親和力較低),。
在進行大規(guī)模標記(使用數(shù)百毫克 NHS 酯)時,請注意,,由于 NHS 酯的水解,,混合物會隨著時間的推移而酸化。監(jiān)測 pH 值,,或使用濃度更高的緩沖液,。
將 NHS 酯溶液添加到生物分子溶液中,并充分渦旋,。在冰上放置過夜,,或在室溫下放置 1 至 4 小時,。
使用適當?shù)姆椒兓Y合物:大分子凝膠過濾是最常見的。色譜法是另一種選擇,。對于蛋白質(zhì)和核酸,,可以使用乙醇或丙酮沉淀。有機雜質(zhì)(如 N-羥基琥珀酰亞胺,、NHS 酯和水解產(chǎn)生的酸)幾乎總是可以通過這些方法輕松分離,。
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