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DNA 標記方案——點擊寡核苷酸和 DNA 的化學標記

閱讀:924      發(fā)布時間:2023-8-28
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點擊化學是一種多功能反應,,可用于合成各種綴合物,。事實上,任何生物分子都可以使用點擊化學方法輕松地用小分子標記,,例如熒光染料,、生物素等。

點擊化學反應發(fā)生在兩種組分之間: 疊氮化物炔烴(末端乙炔),。疊氮基和炔基在天然生物分子中幾乎從未遇到過,。因此,該反應具有高度生物正交性和特異性,。如果需要標記寡 核苷酸,,可以在許多定制寡核苷酸合成設(shè)施和公司訂購炔烴修飾的寡核苷酸。


  1. 使用下表計算點擊化學標記所需的試劑體積,。準備所需的儲備溶液(見附錄),。

    試劑混合物中的最終濃度原液濃度
    炔烴修飾寡核苷酸變化(20 — 200 uM)各不相同
    疊氮化物1.5 x(寡核苷酸濃度)10 mM DMSO 溶液
    二甲基亞砜50體積%
    抗壞血酸0.5毫米5 mM 水中
    銅-TBTA絡(luò)合物0.5毫米10 mM,溶于 55 vol% DMSO
  2. 將炔烴修飾的寡核苷酸或 DNA溶解在耐壓小瓶中的水中,。

  3. 添加2M 醋酸三乙銨緩沖液(pH 7.0)至終濃度 0.2 M,。

  4. 添加DMSO,,并渦旋。

  5. 添加疊氮化物儲備溶液(DMSO 中的 10 mM),,并渦旋,。

  6. 將所需體積的 5mM 抗壞血酸儲備溶液添加到混合物中,并短暫渦旋,。

  7. 通過向其中鼓泡惰性氣體 30 秒來對溶液進行脫氣,。可以使用氮氣,、氬氣或氦氣,。

  8. 將所需量的 10 mM 銅 (II)-TBTA 庫存在 55% DMSO 中添加到混合物中。用惰性氣體沖洗小瓶并蓋上蓋子,。

  9. 渦旋混合物,。如果觀察到明顯的疊氮化物沉淀,則將小瓶在 80°C 下加熱 3 分鐘,,然后渦旋,。

  10. 在室溫下保存過夜。

  11. 用丙酮(對于寡核苷酸)或乙醇(對于 DNA)沉淀結(jié)合物,。

    沉淀寡核苷酸綴合物:

    向混合物中添加至少 4 倍過量體積的 3% 高氯酸鋰丙酮溶液(如果混合物體積很大,,則分成幾個小瓶)。

    沉淀 DNA 綴合物:

    向混合物中添加乙酸鈉至終濃度0.3M,;

    添加 2.5 體積的乙醇(或 0.8 體積的異丙醇),。

    充分混合并在-20°C下保持20分鐘。

  12. 10000 rpm 離心 10 分鐘,。

  13. 丟棄上清液,。

  14. 用丙酮 (1 mL) 洗滌沉淀,以 10000 rpm 離心 10 分鐘,。

  15. 棄去上清液,,干燥沉淀,并通過 RP-HPLC 或 PAGE 純化綴合物,。


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