近年來(lái)，核酸藥物發(fā)展迅猛,，市場(chǎng)需求不斷增加,，上市審批迅速，涵蓋心血管與代謝疾病、肝病,、腫瘤等多個(gè)領(lǐng)域,。截至目前，全球已有10余種核酸藥物獲批上市,，不少核酸藥物正處于臨床試驗(yàn)階段,。核酸藥物有望成為繼小分子藥物、抗體藥物之后的第三類藥物（圖1）,。
越來(lái)越多經(jīng)批準(zhǔn)的核酸療法證明了通過(guò)靶向體內(nèi)致病基因來(lái)治療疾病的潛力,。通常，常規(guī)治療只產(chǎn)生短期治療效果,，因?yàn)樗鼈冡槍?duì)的是蛋白質(zhì)而不是疾病的根源,，而核酸藥物則直接作用于致病的靶基因或靶mRNA，在基因水平上發(fā)揮治療疾病的作用,。核酸藥物包括ASO,、siRNA、Aptamer,、miRNA,、mRNA、saRNA,、sgRNA,、U1 snRNA等。核酸藥物具有治療效率高,、毒性低,、特異性強(qiáng)、應(yīng)用領(lǐng)域廣泛等優(yōu)點(diǎn),，顯示出其重要的醫(yī)學(xué)價(jià)值,、生物科學(xué)等領(lǐng)域。
PROTAC（蛋白水解靶向嵌合體）是一種利用泛素-蛋白酶體系統(tǒng)（UPS）降解靶蛋白的藥物開(kāi)發(fā)技術(shù),。從結(jié)構(gòu)上看,， PROTAC由三部分組成：E3泛素連接酶配體和靶蛋白配體，兩個(gè)活性配體通過(guò)專門設(shè)計(jì)的“Linker"結(jié)構(gòu)連接在一起,，形成三元復(fù)合物,。 PROTAC的靶蛋白配體與靶蛋白結(jié)合，E3泛素連接酶配體與胞內(nèi)E3泛素連接酶的底物結(jié)合區(qū)結(jié)合,，從而通過(guò)泛素化靶蛋白,，將靶蛋白“拉"到E3泛素連接酶上，使 UPS 系統(tǒng)能夠降解目標(biāo)蛋白（圖 2）,。
過(guò)去20年來(lái),，研究人員基于肽和小分子設(shè)計(jì)了各種形式的PROTAC,。然而，基于肽的PROTAC存在活性低和免疫原性等問(wèn)題,，極大地限制了其臨床醫(yī)學(xué)應(yīng)用,。與多肽PROTAC相比，小分子PROTAC體積更小,，更容易被人體吸收,，成藥性更好，因此小分子PROTAC仍然是主流,。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展和進(jìn)步,，一些新型的PROTAC不斷出現(xiàn)，基于核酸的PROTAC應(yīng)運(yùn)而生,。
RNA 結(jié)合蛋白 (RBP) 的功能缺陷是許多疾病的根源,，而用常規(guī)藥物靶向 RBP 已被證明是困難的。 RBP 以動(dòng)態(tài),、協(xié)調(diào)和序列選擇性的方式與 RNA 結(jié)合,，形成核糖核蛋白 (RNP) 復(fù)合物，在 RNA 依賴性中發(fā)揮關(guān)鍵作用,。某些疾病是由 RBP 的基因變化引起的,，影響了 RBP 與 RNA 的結(jié)合。
RNA-PROTAC 的新型嵌合結(jié)構(gòu)來(lái)靶向 RBP,。 2021年,，Jonathan Hall研究小組提出基于RNA的PROTACs的設(shè)計(jì)理念，作者成功構(gòu)建了靶向 RBP（RNA 結(jié)合蛋白）的 RNA-PROTAC,。使用小 RNA 模擬物作為靶向基團(tuán),，它們可以特異性結(jié)合 RBP RNA 結(jié)合位點(diǎn)。 PROTAC 泛素化 RBP,，然后通過(guò)泛素蛋白酶體系統(tǒng)降解它們,。作者對(duì)兩種 RBP（干細(xì)胞因子 LIN28 和剪接因子 RBFOX1）的降解進(jìn)行了概念驗(yàn)證，并展示了它們?cè)诎┘?xì)胞系中的用途,。 RNA-PROTACs靶向Lin28蛋白,，這是一種干細(xì)胞因子和癌蛋白，是多種疾病的潛在藥物靶點(diǎn),，具有很高的研究?jī)r(jià)值,。
轉(zhuǎn)錄因子（TF）是治療包括癌癥在內(nèi)的疾病的一類重要治療靶點(diǎn)。由于TFS缺乏激酶或其他酶中常見(jiàn)的活性或變構(gòu)位點(diǎn),，傳統(tǒng)的小分子抑制劑很難與其結(jié)合。因此,，轉(zhuǎn)錄因子一度被認(rèn)為是“不可成藥"的靶點(diǎn),，存在難以逾越的技術(shù)瓶頸。哈佛大學(xué)Wenyi Wei教授和西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院Jian Jin教授報(bào)道了一種基于寡核苷酸鏈的“ TF-PROTAC "，它由DNA寡核苷酸和E3配體通過(guò)點(diǎn)擊反應(yīng)連接而成（圖4）,，并能選擇性地降解致病性TF,。 TF-PROTAC 的選擇性取決于所使用的 DNA 寡核苷酸。
作者成功開(kāi)發(fā)了兩個(gè)系列的基于VHL的TF-PROTAC：NF-κB-PROTAC（dNF-κB）和E2F-PROTAC（dE2F）,，分別有效降解細(xì)胞內(nèi)的內(nèi)源性p65和E2F1蛋白,，并表現(xiàn)出優(yōu)異的抗-細(xì)胞增殖作用（圖5）。
2021 年,，Crews 團(tuán)隊(duì)還報(bào)道了靶向轉(zhuǎn)錄因子 (TF) 的寡核苷酸 PROTAC：oligoTRAFTAC（圖 6）。OligoTRAFTAC由與 TF 和 E3 泛素連接酶配體結(jié)合的寡核苷酸鏈組成,。
蛋白質(zhì)印跡實(shí)驗(yàn)表明，oligoTRAFTAC 成功降解了兩種致癌轉(zhuǎn)錄因子：c-Myc 和 brachyury,。此外,，作者發(fā)現(xiàn)oligoTRAFTACs可以成功降解脊索瘤細(xì)胞系的brachyury，并且在隨后的體內(nèi)斑馬魚模型實(shí)驗(yàn)中也表現(xiàn)出良好的降解活性（圖7）,。
適體是寡核苷酸（DNA 或 RNA）序列,。寡核苷酸片段通常通過(guò)指數(shù)富集配體系統(tǒng)進(jìn)化（SELEX）體外篩選從核酸文庫(kù)中獲得。核酸接頭因其可以與多種目標(biāo)物質(zhì)以高特異性和選擇性結(jié)合而被廣泛應(yīng)用,。 2021年,，譚衛(wèi)紅課題組基于核酸適配體AS1411：ZL216設(shè)計(jì)了PROTAC（圖8）。
AS1411可以特異性靶向腫瘤細(xì)胞中高表達(dá)的核仁素受體,，核仁素受體與其配體結(jié)合后被內(nèi)化,。作者通過(guò)體外實(shí)驗(yàn)證明PROTAC具有較高的水溶性和血清穩(wěn)定性。此外,，作者發(fā)現(xiàn)ZL216促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞中核仁素受體-ZL216-VHL三元復(fù)合物的形成,，并在體外和體內(nèi)有效誘導(dǎo)核仁素受體降解。隨后的細(xì)胞增殖和遷移實(shí)驗(yàn)表明,，ZL216還抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖和遷移（圖9）,。
PROTAC是一種很有前景的靶向蛋白質(zhì)降解策略,。作為一種有效的靶向蛋白質(zhì)降解方法,，PROTACs在催化性能、高選擇性,、克服耐藥性,、有效阻斷非成藥靶點(diǎn)等方面顯著優(yōu)于傳統(tǒng)小分子藥物。但PROTAC一般具有高分子量和高疏水性,，其理化性質(zhì)很大程度上超過(guò)了“五法則"（RO5）,。因此,，傳統(tǒng)PROTAC的藥物開(kāi)發(fā)往往受到其細(xì)胞膜通透性差、藥代動(dòng)力學(xué)（PK）特性差以及缺乏腫瘤特異性靶向的限制,。
為此,，盛春泉課題組提出了Aptamer-PROTAC Conjugates（APCs）的設(shè)計(jì)理念。 APC 是通過(guò)可裂解的連接鏈將 PROTAC 靶向 BET 蛋白與適體 AS1411 (AS) 偶聯(lián)而獲得的（圖 10）,。其中,，核酸適體AS1411可以選擇性靶向腫瘤細(xì)胞表面高表達(dá)的核仁素受體。 AS本身對(duì)核仁素受體過(guò)表達(dá)的腫瘤具有良好的抑制活性,，目前正在II期臨床試驗(yàn)中進(jìn)行評(píng)估,。腫瘤細(xì)胞中谷胱甘肽含量豐富，因此連接鏈選擇可被谷胱甘肽（GSH）裂解的二硫鍵,，可選擇性響應(yīng)腫瘤微環(huán)境,，在連接鏈裂解后釋放活性BET降解劑。
圖 10. APC 的設(shè)計(jì)策略
與未修飾的BET PROTAC（PRO）相比,，APC綴合物（APR）在McF-7細(xì)胞的小鼠異種移植模型中表現(xiàn)出改善的腫瘤靶向能力,，從而增強(qiáng)BET蛋白的體內(nèi)降解和抗腫瘤效力。因此,，APC策略為腫瘤特異性靶向PROTAC的開(kāi)發(fā)提供了新的設(shè)計(jì)思路,。
圖11 蛋白質(zhì)降解實(shí)驗(yàn)及體內(nèi)成像、抗腫瘤實(shí)驗(yàn)
適配體PROTACs Conjugates (APCs)的發(fā)展自提出以來(lái)可謂“驚天動(dòng)地",。與傳統(tǒng)PROTAC相比,，基于核酸的PROTAC提高了傳統(tǒng)小分子PROTAC的靶向性，在提高水溶性,、膜通透性,、腫瘤靶向性等方面發(fā)揮著重要作用。由于核酸藥物在體內(nèi)易被核酸酶水解,，半衰期短,，極大限制了其在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。未來(lái)的研究方向應(yīng)集中于提高核酸藥物的穩(wěn)定性,、延長(zhǎng)半衰期,、改善藥代動(dòng)力學(xué)性質(zhì)、解決核酸藥物遞送問(wèn)題,。
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