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對于pcr 耗材,八聯(lián)管,、pcr 96 孔板選擇您不妨來看下!

時間:2022/8/11閱讀:2678
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  對于pcr 耗材,,八聯(lián)管、pcr 96 孔板選擇您不妨來看下!


  首先今天我們來聊聊 PCR 實驗中很關鍵的要素——耗材,。作為 PCR ??停私釨UNSEN本生 PCR 耗材相關的特性和術語是有必要的,。

  市面上的 PCR 耗材有很多,,各種品牌、規(guī)格,、顏色等,,讓人眼花繚亂。我們來慢慢認識它,。材質(zhì) PCR 耗材的原材料通常是聚丙烯,。它是一種很好的耐熱惰性物質(zhì)(使用溫度范圍為 -30~140℃),能夠承受 PCR 反應熱循環(huán)過程中的熱能變化,,很好地封閉和保護 PCR 反應體系中的物質(zhì),。

  顏色常見的有白管和透明管。在傳統(tǒng) PCR 實驗中,,兩者沒有區(qū)別,。但是,在相同的熒光定量/qPCR 實驗中,對于頂端信號讀取的 qPCR 儀器(在管的上方采集熒光信號)來說,,白管的靈敏度和一致性相對更高,。這是為什么呢?

  >>與透明管相比,A 白管得到的 Ct 值更低;B 白管得到的重復性更好

  qPCR 的核心數(shù)據(jù)是 Ct 值,,而熒光信號是 Ct 值計算的數(shù)據(jù)來源,,所以管內(nèi)的熒光能否完好地傳遞至檢測器是至關重要的。白色的管壁能夠阻止熒光穿過管壁和折射(下圖 A),,進而防止熒光傳至加熱模塊(放管子的金屬孔壁),,被模塊吸收或發(fā)生不一致反射等情況。相比于透明管,,在白管的頂端能夠采集到更強,,更聚焦的熒光信號。

  A 透明管和白管中熒光信號走向;B 分別加入等量熒光素后,,熒光強度對比

  So,假如你正在使用的是頂讀 qPCR 儀,,那么安利一下,,不妨用白管試試哦~

  質(zhì)量(是否干凈)這里強調(diào)一下耗材質(zhì)量的重要性。qPCR 耗材必須保證沒有污染物和抑制劑,。高壓和輻射能夠去除細菌和 DNA 酶,,但不能去除灰塵和 DNA 殘留,它們可能會抑制 PCR 反應或產(chǎn)生非特異性擴增,。物質(zhì)是具有吸光度的,,即便是很小的污染物也會吸收反應體系中的熒光,影響熒光信號的采集,。用一個夸張版的實驗來演示一下雜質(zhì)污染對實驗的影響,,在BUNSEN本生八聯(lián)排的一個反應孔中放入一粒雜質(zhì),不出所料,,擴增結(jié)果曲線出現(xiàn)了顯著的異常,。

  ↑ 8 復孔重復性反應結(jié)果,左邊孔中的雜質(zhì)讓曲線“跑偏"

  Tips 注意不要讓耗材長期暴露在空氣中,,取出耗材后,,一定要快速封好包裝袋,避免用裸手接觸,。有條件的話,,可在超凈臺中操作。容量/尺寸/通量

  容量決定了可加樣的多少(反應體積),。加樣過多會導致熱傳導效率下降,,溢出或交叉污染;而加樣不足會引起樣品蒸發(fā)損耗。qPCR 儀的加熱模塊也會決定可適配的耗材和適用的反應體系大小。通量很容易理解,,就是單次實驗多能上多少個樣品,。常見的容量和通量規(guī)格如下表所示

  單管/八聯(lián)排 0.2mL、0.1mL

  


  96 孔板 0.2mL,、0.1mL

  


  384 孔板 0.02mL

  


  容量規(guī)格也常用標準和低容量來區(qū)分,。low profile(低容)耗材的高度更低,這種短小設計地減少了反應體系上方的空間(“死體積"——無用部分),,降低熱循環(huán)過程中的蒸發(fā)影響,,同時能夠讓加熱模塊更大程度地將其包裹,提高熱傳導效率,。因此,,低容管也被稱為“快速"管或板。

  Tips 常見的反應體積一般為 20 µL,,推薦使用 0.1 mL 或 low profile 的低容反應管,。管壁厚度

  PCR 耗材的管壁厚度要均一,才能提供一致的熱傳導,。超薄管壁較標準版薄 50%,,可進一步減少熱屏障,帶來更快更好的反應效果,。當然,,建議選超薄的。

  透明度 qPCR 的管蓋和封膜需要具有很高的光學透性,,確保的熒光信號的穿透和傳遞,,減少失真(針對頂讀 qPCR 儀)。管壁的透明度越高反倒會影響實驗結(jié)果,,理由在前面解釋過,。傳統(tǒng) PCR 可忽略此特點。裙邊 PCR 板的裙邊指的是板的周圍延伸部分,。額.......這個裙邊作用是在構(gòu)建反應體系時為移液過程提供穩(wěn)定性支撐,,以及結(jié)合自動化工作站時提供機械強度和抓手。常見的有三種:無裙邊,、半裙邊和全裙邊(對應下圖 A,、B、C),。

  Tips 簡單理解就是,裙邊的意義更多在于為工業(yè)化,、自動化批量處理提供便利,,與機械臂的結(jié)合。在常規(guī)科研實驗室中可能不太需要,,使用無裙邊板即可,。

  封板膜

  


  PCR 封板膜由透明塑料或鋁箔制成。黏性透明薄膜比較常見,,適配于 96 或 384 孔板,,要有足夠好的光透性??梢栽诜饽r用個小卡片把孔周圍的膜壓緊,,避免漏氣等現(xiàn)象,。實驗室里的貼膜 boy 們應該很熟悉了吧,??梢院唵卫斫鉃?.....

  黏性鋁膜可能比較少見,,盡管不適合 qPCR,但對于光敏樣品是的耗材,,由于可以穿刺,,便于 PCR 中樣品轉(zhuǎn)移,。(適用于傳統(tǒng) PCR)

  總結(jié):耗材作為 PCR 體系的載體,,對提高實驗數(shù)據(jù)質(zhì)量是非常重要的。 有關 pcr 耗材,,八聯(lián)管,、pcr 96 孔板選擇!?本生生物小編就分享到這了,,看完本文您就應該有了基本的認識和了解相信大家都明白了吧!總的來說,,希望對大家有所幫助,。


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