核酸的定量
核酸的定量是分光光度計(jì)使用頻率高的功能,。可以定量溶于緩沖液的寡核苷酸,,單鏈,、雙鏈DNA,以及RNA,。核酸的高吸收峰的吸收波長260 nm,。每種核酸的分子構(gòu)成不一,因此其換算系數(shù)不同,。定量不同類型的核酸,,事先要選擇對應(yīng)的系數(shù)。如:1OD 的吸光值分別相當(dāng)于50μg/ml的dsDNA,,37μg/ml的ssDNA,,40μg/ml的RNA,30μg/ml的Olig,。測試后的吸光值經(jīng)過上述系數(shù)的換算,,從而得出相應(yīng)的樣品濃度。測試前,,選擇正確的程序,,輸入原液和稀釋液的體積,爾后測試空白液和樣品液,。然而,,實(shí)驗(yàn)并非一帆風(fēng)順。讀數(shù)不穩(wěn)定可能是實(shí)驗(yàn)者頭痛的問題,。靈敏度越高的儀器,,表現(xiàn)出的吸光值漂移越大,。
事實(shí)上,,分光光度計(jì)的設(shè)計(jì)原理和工作原理,允許吸光值在一定范圍內(nèi)變化,,即儀器有一定的準(zhǔn)確度和精確度,。如Eppendorf Biophotometer的準(zhǔn)確度≤1.0%(1A)。這樣多次測試的結(jié)果在均值1.0%左右之間變動(dòng),,都是正常的,。另外,還需考慮核酸本身物化性質(zhì)和溶解核酸的緩沖液的pH值,,離子濃度等:在測試時(shí),,離子濃度太高,也會導(dǎo)致讀數(shù)漂移如TE,,可大大穩(wěn)定讀數(shù),。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由于樣品中不可避免存在一些細(xì)小的顆粒,,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在干擾測試效果,。為了大程度減少顆粒對測試結(jié)果的影響,,要求核酸吸光值至少大于0.1A,吸光值好在0.1-1.5A,。在此范圍內(nèi)混合液不能存在氣泡,,空白液無懸浮物,否則讀數(shù)漂移劇烈,;必須使用相同的比色杯測試空白液和樣品,,否則濃度差異太大;換算系數(shù)和樣品濃度單位選擇一致,;不能采用窗口磨損的比色杯,;樣品的體積必須達(dá)到比色杯要求的小體積等多個(gè)操作事項(xiàng)。
除了核酸濃度,,分光光度計(jì)同時(shí)顯示幾個(gè)非常重要的比值表示樣品的純度,,如A260/A280的比值,用于評估樣品的純度,,因?yàn)榈鞍椎奈辗迨?80nm,。純凈的樣品,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA),。如果比值低于1.8 或者2.0,,表示存在蛋白質(zhì)或者酚類物質(zhì)的影響。A230表示樣品中存在一些污染物,,如碳水化合物,,多肽,苯酚等,,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0,。A320檢測溶液的混濁度和其他干擾因子。純樣品,,A320一般是0,。
蛋白質(zhì)的直接定量(UV法)
這種方法是在280nm波長,直接測試蛋白,。選擇Warburg 公式,,光度計(jì)可以直接顯示出樣品的濃度,或者是選擇相應(yīng)的換算方法,,將吸光值轉(zhuǎn)換為樣品濃度,。蛋白質(zhì)測定過程非常簡單,先測試空白液,然后直接測試蛋白質(zhì),。由于緩沖液中存在一些雜質(zhì),,一般要消除320nm 的“背景”信息,設(shè)定此功能“開”,。與測試核酸類似,,要求A280的吸光值至少大于0.1A,的線性范圍在1.0-1.5 之間,。實(shí)驗(yàn)中選擇Warburg 公式顯示樣品濃度時(shí),,發(fā)現(xiàn)讀數(shù)“漂移”。這是一個(gè)正常的現(xiàn)象,。事實(shí)上,,只要觀察A280的吸光值的變化范圍不超過1%,表明結(jié)果非常穩(wěn)定,。漂移的原因是因?yàn)閃arburg 公式吸光值換算成濃度,,乘以一定的系數(shù),只要吸光值有少許改變,,濃度就會被放大,,從而顯得結(jié)果很不穩(wěn)定。蛋白質(zhì)直接定量方法,,適合測試較純凈,、成分相對單一的蛋白質(zhì)。紫外直接定量法相對于比色法來說,,速度快,,操作簡單;但是容易受到平行物質(zhì)的干擾,,如DNA的干擾,;另外敏感度低,要求蛋白的濃度較高,。
比色法蛋白質(zhì)定量
蛋白質(zhì)通常是多種蛋白質(zhì)的混合物,,比色法測定的基礎(chǔ)是蛋白質(zhì)構(gòu)成成分:氨基酸(如酪氨酸,絲氨酸)與外加的顯色基團(tuán)或者染料反應(yīng),,產(chǎn)生有色物質(zhì),。有色物質(zhì)的濃度與蛋白質(zhì)反應(yīng)的氨基酸數(shù)目直接相關(guān),從而反應(yīng)蛋白質(zhì)濃度,。
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