英文名稱:BHQ-3 NHS
CAS:871240-94-7
外觀:深紫色粉末
分子式:C37H38N7O4+
分子量:644.76
儲存條件:-20°C,避光避濕
結構式:

產(chǎn)品簡介:黑暗猝滅劑?-3染料寡核苷酸修飾,。BHQ-3可以位于5或3末端或寡核苷酸的內部,。BHQ?-3標記的寡核苷酸用于許多應用,包括用于實時PCR的雙標記熒光探針,。該暗猝滅劑具有620-730 nm的強吸收范圍,,可對在該范圍內發(fā)出熒光的熒光團(如Quasar?670和Quasar 705染料)進行很好的猝滅。
NHS修飾是合成后與一個伯氨基的共軛,,因此是一個附加的需要用氨基修飾,。C6或C12氨基可置于5'或對于3'端,使用C3或C7氨基,,對于內部位置,,使用氨基修飾的堿,,例如氨基dT C6?;贜HS的產(chǎn)率修飾是使用伯氨基進行的合成后共軛。與可作為酰胺的直接自動化偶聯(lián)改性相比,,產(chǎn)率較低,。近似各種規(guī)模的產(chǎn)量如下所示,。
50 nmol規(guī)模合成的終產(chǎn)量約為2 nmol,。
200 nmol規(guī)模合成的~5 nmol終產(chǎn)量,。
1μmol規(guī)模合成的~16 nmol終收率
黑洞猝滅劑-1(BHQ-1)被歸類為暗猝滅劑(一種非熒光發(fā)色團),被使用作為各種熒光共振能量轉移(FRET)DNA檢測探針中的3'-猝滅部分,。這樣的探針主要用于核酸分析,但也可用于核酸結構研究(1),。例子包括TaqMan探針(2),、蝎子引物(3)和分子信標(4),。BHQ-1的吸光度為534 nm,,有效吸光度范圍為480-580 nm。這是用于與熒光染料配對的猝滅劑,,熒光染料在可見光范圍(519-556 nm)的黃綠色到黃色部分發(fā)射,。這個染料的發(fā)射光譜與BHQ-1的吸收光譜充分重疊,從而使后者能夠淬滅染料前者熒光,。
在FRET探針中使用暗猝滅器的優(yōu)點是低背景熒光(因此更好)信噪比,(b)更高的動態(tài)范圍,,(c)適用于多重分析(由于暗猝滅器沒有二次熒光),,以及(d)使用暗猝滅劑易于合成FRET探針(因為暗猝滅劑在低聚物脫保護步驟中抗降解)(5),。
作為核酸雜交探針檢測系統(tǒng)使用的各種熒光染料和猝滅劑分子的開發(fā)允許開發(fā)幾種不同的實時PCR分析系統(tǒng),這些系統(tǒng)利用染料猝滅劑雜交探針,,僅當它們與目標結合時才產(chǎn)生熒光信號。然而,,為了正確設計針對特定目標的分析,重要的是根據(jù)分析中使用的雜交探針類型,、待檢測的目標數(shù)量以及可用于執(zhí)行分析的設備類型,,仔細選擇雜交探針的染料和猝滅劑。
1) 選擇能被激發(fā)源和你計劃在實驗中使用的分光光度熱循環(huán)儀的光學元件適當激發(fā)和檢測的熒光染料,。基于激光的激發(fā)源通常在窄波長范圍內(例如,,氬離子激光器為500-540 nm)提供激發(fā),,而白光源(例如,鹵鎢燈)和發(fā)光二極管與激發(fā)和發(fā)射濾光片結合可在整個可見范圍(400-700 nm)內激發(fā)熒光團,。
2) 對于用一個雜交探針檢測一個目標,,建議對染料使用FAM、HEX或TET,,因為它們可以在所有分光光度熱循環(huán)儀上檢測到,,并且所有三種探針都可以使用磷酰胺(這使得探針的合成簡單且具有成本效益)。
3) 對于復合分析,,至少需要兩種不同的雜交探針,,應選擇吸收和發(fā)射波長分離良好的染料,。
4) 對于FRET雜交探針,,應選擇光譜高度重疊的熒光染料猝滅劑對。請參閱淬火劑選擇表以選擇適當?shù)拇慊饎?br/>
5) 對于基于接觸猝滅的雜交探針(例如,,分子信標),任何非熒光猝滅劑都應工作良好,。
供應商:西安凱新生物科技有限公司
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其他產(chǎn)品列表:
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BHQ-2 acid 1214891-99-2
BHQ-3 acid 1338332-66-3
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BHQ-3 amine 1661064-89-6
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BHQ-3 NHS 871240-94-7
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