詳細介紹
商品屬性:
產品名稱 | 規(guī)格 | 貨號 |
Hi T7 RNA Polymerase | 10KU | A-PJ1058 |
對 T7 噬菌體啟動子具有高度的特異性,并可以其作為啟動子,,DNA 作為模板體外合成正義鏈,。雙鏈線性質粒 DNA,、PCR 產物均可作為該酶的底物模板。Hi T7 RNA 聚合酶經電子重構架及庫篩選,,與 Wild型比較來看,,酶的 DNA 模板結合區(qū)域親和力更高,使其具有持續(xù)合成能力,,從而獲得更高的產量,,并易于長片段RNA 的合成。該酶為重組純化制品,,無 DNase 和 RNase污染,。
活性定義:在標準反應體系下,37℃ 1 小時內將 1 nmol的 ATP 摻入酸不溶物所需要的酶量定義為一個活性單位,。
儲存:置于-20°C 可保存 2 年,,如有白色沉淀析出,37°C溫浴 5min 后使用,,不影響性能,。
熱失活:75°C,10min,。
2. 37℃孵育 2-3h (通常 3h,,即可獲得>80 μg 的總產量)。
3. 反應完畢后,,如需去除模板 DNA,,加入 Dnase I(2U)37℃處理 15min。
4. 終止反應:75℃加熱 10min,,或加入 2 μl 0.5M 的 EDTA(pH8.0),。
注意事項
1.質粒DNA的質量影響RNA的量和完整性。質粒DNA的濃度越高,,生成RNA的質量越高,,質粒模板DNA應該無RNase污染.
2.該酶為高產酶,RNA 產量高,,在反應完畢后,,通常存在肉眼可見的渾濁狀態(tài),其為反應副產物焦磷酸鎂,,此時表明反應劇烈,。在下一步 RNA 純化前,可通過短暫離心去除沉淀物,此過程并不丟失 RNA,。
3. 通常轉錄后 RNA 產物濃度在 2-4 μg/μl,,因此電泳時,僅需取 0.05-0.1 μl 即可,。
PCR基本步驟及注意事項,?
一、實驗原理
PCR是體外人工選擇性擴增DNA的一種方法,,它類似于生物體內DNA的復制,。在生物體內DNA復制需要模板、引物,、DNA聚合酶,、DNA解旋酶、 dNTPs,;而體外PCR反應同樣需要類似的成分,,有模板、引物,、PCR Buffer、Taq酶,、dNTPs,。其中引物是人工設計的特定序列,實現對特定位置的擴增,;PCR Buffer提供一個反應的緩沖環(huán)境,;反應過程同生物體內一樣,DNA雙鏈打開,,引物結合模板,,延伸形成新鏈。而這些過程在生物體內靠DNA解旋酶解鏈,,而在體外在通過控制反應溫度實現的,。如常用94℃變性模板DNA打開雙鏈,在退火溫度處引物結合到模板上,,最后在72℃完成延伸,,并反復重復此過程即可實現對特定片段DNA的大量擴增。到第三循環(huán)開始才產生出和靶DNA區(qū)段相同的DNA分子,,進一步循環(huán)地產生出靶DNA區(qū)段的指數加倍,。
在擴增后期,由于產物積累,使原來呈指數擴增的反應變成平坦的曲線,產物不再隨循環(huán)數而明顯上升,這稱為平臺效應。平臺期(Plateau)會使原先由于錯配而產生的低濃度非特異性產物繼續(xù)大量擴增,,達到較高水平,。因此,應適當調節(jié)循環(huán)次數,,在平臺期前結束反應,, 減少非特異性產物,。到達平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數取決于樣品中模板的拷貝。
二,、主要的成分
1.模板可以是多種形式,,主要包括基因組DNA、質粒DNA,、攜帶病毒的基因組DNA,、PCR產物,cDNA等,,但不能為RNA,。對于不同類型的模板,其主要不同在于預變性的時間以及模板的量,。一般對于大的基因組DNA預變性時間10min足夠,,質粒DNA2min、攜帶病毒的基因組DNA預變性2min,、PCR產物預變性2min即可,。
注意cDNA為單鏈DNA,但仍可做PCR的模板,,只不過在第一輪循環(huán)時只有一個引物結合,,合成另一條鏈。從第二輪開始,,兩個引物均與特異位點結合,,從而實現了與常規(guī)PCR的接軌。而同作為單鏈的RNA卻不能進行PCR擴增,,原因就在于實現PCR反應的是DNA聚合酶,,只能特意識別DNA鏈。
2.對于模版的量來說,,一般25ul體系DNA的質量為50—100ng,。對于基因組DNA由于其結構比較復雜,提取的濃度也往往比較大,,為防止?jié)舛冗^大對PCR造成影響,,故需對提取的DNA進行梯度稀釋。否則濃度過高則可能會引起非特異性擴增,。對于質粒及PCR產物由于其結構簡單,,且提取濃度一般較低,則無需稀釋,。
PCR實驗中應該注意的問題有哪些?
沒有ct值
檢測結果遇到沒有Ct值情況,排查是否有以下問題:
1,、循環(huán)數不夠(一般不超過45循環(huán),不僅背景值提高,定量也不準);
2、PCR程序設置錯誤,檢測熒光信號的步驟有誤。一般SG法采用72℃延伸時采集,TaqMan法則一般在退火結束時或延伸時采集信號,另外熒光采集是否選中;
3,、引物或探針降解,。可通過PAGE電泳檢測引物和探針是否降解;
4,、模板量可能降解或上樣量不足(不超過500ng,根據試劑盒說明書即可), 對未知濃度的樣本應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;如果發(fā)生模板降解,應考慮樣本準備中雜質的引入及反復凍融的情況,建議將模板樣本小量分裝儲備,避免反復凍融;
5,、引物探針是否合適(尤其是引物跨越內含子,以確保擴增基因組DNA;上下游引物Tm值超過4℃以上也會影響擴增)。
ct值過晚
在相對定量中, Ct值一般控制在15—25之間比較好,如果在絕對定量中, 對低拷貝數的樣品,Ct值會增大, 但是一般不宜超過40循環(huán), 否則定量不準確,。
因此,判斷Ct值出現過晚是否屬于非正常情況, 需要根據具體實驗設計和目的進行,。
1、擴增效率低,。引物之間或者引物和探針的比例不合適, 需要進行優(yōu)化;引物或探針設計不合理, 需要重新設計;
2,、PCR程序不合適, 改用三步法進行反應, 或者優(yōu)化退火/延伸溫度, 可以適當降低退火溫度; 退火/延伸時間短(可以在推薦的時間條件下延長10s);
3、MgCl2濃度不合適,增加鎂離子濃度等,。PCR各種反應成分的降解或加樣量的不足;
4,、PCR產物太長。PCR產物設計超過500bp;
5,、模板中存在抑制物,。用高純度模板進行PCR檢測或將模板進行稀釋。
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