詳細介紹
公司產(chǎn)品僅供科研研究使用,、不得用于臨床診斷,!
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
A-PJ1113 | T5核酸外切酶 | 1000U |
A-PJ1113 | T5核酸外切酶 | 10KU |
T5 核酸外切酶沿 5’-3’方向降解 DNA,,它可降解雙鏈DNA、單鏈 DNA 和缺刻的質(zhì)粒 DNA,。它既能從 5’-末端起始降解 DNA,,也能從線性或環(huán)狀雙鏈 DNA 的切刻或缺口處起始降解 DNA,但不能降解超螺旋雙鏈 DNA,?;谝陨咸匦裕琓5 核酸外切酶可應(yīng)用于 Gibson 組裝,。
儲存:-20℃可保存 3 年,。
活性定義:1 單位指在 50 μl 反應(yīng)體系,37°C 條件下,,30分鐘內(nèi)能從雙鏈 DNA 底物上催化產(chǎn)生 1 nmol 的酸可溶性脫氧核糖核苷酸所需要的酶量,。
使用注意事項:
(1)1×T5 Exo Buffer:50mM KAc,,20mM Tris-Ac pH 7.9,10mM Mg(Ac)2,,1mM DTT,。該酶在 PCR Buffer 中也具有活性。
(2)該酶的最佳反應(yīng)溫度為 37°C,,在 50°C 也具有一定活性,,因此可用于 Gibson 組裝。
使用方法:
1.建立如下反應(yīng)體系
模板 DNA 1 μg
10×T5 Exo Buffer 5 μl
T5 Exonuclease (10 U/μl) 1 μl
ddH2O upto 50 μl
2. 37°C,,30min,。
3. 加入 EDTA 至總濃度為 11mM,終止反應(yīng),。
PCR 反應(yīng)需要使用哪些試劑和設(shè)備,?
試劑:
模板DNA:PCR反應(yīng)需要模板DNA,如從細胞,、組織,、血液中提取DNA等;引物:PCR反應(yīng)的兩個引物,,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域,,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;dNTPs:PCR反應(yīng)中需要四種dNTPs,,包括脫氧腺苷酸(dATP),、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP),、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),,用于細胞分裂、DNA合成等生物學(xué)過程,,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增,;Taq DNA聚合酶:PCR反應(yīng)需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,,還有一些其他種類的聚合酶如PFU,、Phusion等,用于擴增DNA鏈,;PCR buffer溶液:對PCR反應(yīng)具有緩沖作用,,調(diào)節(jié)反應(yīng)pH,硫代硫酸氫鹽SDS,、小分子有機化合物如甲醛,,可增強PCR反應(yīng)特異性,從而提高反應(yīng)效率;酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組,、構(gòu)建和測序等等實驗步驟,,常常需要進行酶切操作。MARK:一種分子量標準,,用來判別DNA片段大小的工具,。DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應(yīng)產(chǎn)物;
設(shè)備:
PCR儀:用于控制反應(yīng)溫度,,保證PCR反應(yīng)時不同溫度環(huán)節(jié)的嚴格控制,;電泳槽:用于分離PCR擴增產(chǎn)物;核酸提取儀:從組織樣本中全自動提取核酸,。 這些試劑和設(shè)備在PCR分子生物學(xué)技術(shù)中均是,,只有在有序齊全的基礎(chǔ)上,才能進行PCR反應(yīng)并得出準確結(jié)果,。
PCR相關(guān)基礎(chǔ)實驗:
PCR反應(yīng)基本步驟一般的聚合酶鏈式反應(yīng)由20到35個循環(huán)組成,,每個循環(huán)包括以下3個步驟:
一、變性:
利用高溫(93-98℃)使雙鏈DNA分離,。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷。在第一個循環(huán)之前,,通常加熱長一些時間以確保模板和引物分離,,僅以單鏈形式存在。該步驟時間1-2分鐘,,接下來PCR儀就控制溫度進入循環(huán)階段,。
二、退火或稱接合,復(fù)性:
在DNA雙鏈分離后,,降低溫度使得引物可以結(jié)合于單鏈DNA上,。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導(dǎo)致引物不與模板結(jié)合或者錯誤地結(jié)合,。該步驟時間1-2分鐘,。
三、延伸:
DNA聚合酶由降溫時結(jié)合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈,。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶,。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度。傳統(tǒng)的Taq估計合成1000bp/min,、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒,、商業(yè)公司生產(chǎn)的融合型聚合酶僅需約10-15秒。
PCR反應(yīng)條件優(yōu)化:
1,、變性溫度和時間:
保證模板DNA解鏈是保證整個PCR擴增成功的關(guān)鍵,。加熱90~95°C, 30~60s,再復(fù)雜的DNA 分子也可變性為單鏈。溫度過高或高溫持續(xù)時間過長,,可對Taq酶活性和dNTP分子造成損害,。
2、復(fù)性溫度和時間:
PCR擴增特異性取決于復(fù)性過程中引物與模板的結(jié)合,。復(fù)性溫度越高,,產(chǎn)物特異性越高。復(fù)性溫度越低,,產(chǎn)物特異性越低,。需根據(jù)引物的Tm值具體設(shè)定。
3,、延伸溫度和時間:
一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間,。引物小于16個核苷酸時,過高的延伸溫度不利于引物與模板的結(jié)合,,可以緩慢升溫到70~75°C,。延伸反應(yīng)時間,可根據(jù)待擴增片段的長度而定,,小于1kb, 1min足夠,;大于1kb需加長延伸時間。Taq酶可根據(jù)1kb/min增加時間,。這里需要注意,,延伸時間過長可能出現(xiàn)非特異擴增。因此需要設(shè)置恰到好處的延伸時間,。
4,、循環(huán)數(shù):
其他參數(shù)選定后,PCR循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度,。理論上說20?25次循環(huán)后,,PCR產(chǎn)物的積累即可達到最大值,實際操作中由于每步反應(yīng)的產(chǎn)率不可能達到100%,,因此不管模板濃度是多少,,20~30次是比較合理的循環(huán)次數(shù)。循環(huán)次數(shù)越多,,非特異擴增增加,。
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