詳細(xì)介紹
商品屬性:
產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 貨號 |
Taq DNA連接酶 | 1000U | A-PJ1091 |
Taq DNA連接酶 | 10KU | A-PJ1091 |
描述:Taq DNA 連接酶是一種熱穩(wěn)定性連接酶,,能夠催化 磷酸二酯鍵的形成,使與同一互補靶 DNA 鏈雜交的兩條相 鄰寡核苷酸鏈的 5′-磷酸末端和 3′-羥基末端通過磷酸二酯 鍵相連,。該連接反應(yīng)只有當(dāng)兩條寡核苷酸鏈與互補靶 DNA 配對,,并且兩條寡核苷酸鏈之間沒有空隙的條件下才可 發(fā)生。因此,,可以用它來檢測單堿基替換,。在 45℃-65℃ 范 圍內(nèi),,Taq DNA 連接酶均有活性。該酶在 1XHiFi Taq Ligase Buffer 中具有的保真性連接,。
組分應(yīng)用
雙鏈 DNA 切刻的修復(fù)
儲存:-20℃可保存半年,,長期儲存請置于 -70℃。
活性定義:1 單位指 50μl 反應(yīng)體系中,,45℃ 條件下,,15 分鐘內(nèi)能使 50% 的 1μg 經(jīng) BstEII 消化的 λDNA 片段(12bp 粘性末端)發(fā)生連接所需要的酶量。該酶也可以使用 1×Taq DNA Ligase Buffer20 mM Tris-HCl(pH 7.6),,25 mM KAc,,10 mM Mg(Ac)2,10 mM DTT,,1 mM NAD 和 0.1% Triton X-100,,45℃ 溫育。 該酶需 NAD+ 作輔因子,,在 10×Taq DNA 連接酶緩沖液中已添加 NAD+,;為了延長 NAD+ 的半衰期,緩沖液應(yīng)于 -70℃ 貯存,。
使用方法
1,、配制如下反應(yīng)體系
DNA up to 1 µg
10×HiFi Taq Ligase Buffer 5 µl
Taq DNA Ligase 2 µl
滅菌水 up to 50 µl
2、45℃孵育 15min,。
PCR基本步驟及注意事項,?
一、實驗原理
PCR是體外人工選擇性擴增DNA的一種方法,,它類似于生物體內(nèi)DNA的復(fù)制,。在生物體內(nèi)DNA復(fù)制需要模板、引物,、DNA聚合酶,、DNA解旋酶、 dNTPs,;而體外PCR反應(yīng)同樣需要類似的成分,,有模板、引物,、PCR Buffer,、Taq酶、dNTPs,。其中引物是人工設(shè)計的特定序列,,實現(xiàn)對特定位置的擴增;PCR Buffer提供一個反應(yīng)的緩沖環(huán)境;反應(yīng)過程同生物體內(nèi)一樣,,DNA雙鏈打開,,引物結(jié)合模板,延伸形成新鏈,。而這些過程在生物體內(nèi)靠DNA解旋酶解鏈,,而在體外在通過控制反應(yīng)溫度實現(xiàn)的。如常用94℃變性模板DNA打開雙鏈,,在退火溫度處引物結(jié)合到模板上,,最后在72℃完成延伸,并反復(fù)重復(fù)此過程即可實現(xiàn)對特定片段DNA的大量擴增,。到第三循環(huán)開始才產(chǎn)生出和靶DNA區(qū)段相同的DNA分子,,進一步循環(huán)地產(chǎn)生出靶DNA區(qū)段的指數(shù)加倍。
在擴增后期,由于產(chǎn)物積累,使原來呈指數(shù)擴增的反應(yīng)變成平坦的曲線,產(chǎn)物不再隨循環(huán)數(shù)而明顯上升,這稱為平臺效應(yīng),。平臺期(Plateau)會使原先由于錯配而產(chǎn)生的低濃度非特異性產(chǎn)物繼續(xù)大量擴增,,達(dá)到較高水平。因此,,應(yīng)適當(dāng)調(diào)節(jié)循環(huán)次數(shù),,在平臺期前結(jié)束反應(yīng), 減少非特異性產(chǎn)物,。到達(dá)平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝,。
二、主要的成分
1.模板可以是多種形式,,主要包括基因組DNA、質(zhì)粒DNA,、攜帶病毒的基因組DNA,、PCR產(chǎn)物,cDNA等,,但不能為RNA,。對于不同類型的模板,其主要不同在于預(yù)變性的時間以及模板的量,。一般對于大的基因組DNA預(yù)變性時間10min足夠,,質(zhì)粒DNA2min、攜帶病毒的基因組DNA預(yù)變性2min,、PCR產(chǎn)物預(yù)變性2min即可,。
注意cDNA為單鏈DNA,但仍可做PCR的模板,,只不過在第一輪循環(huán)時只有一個引物結(jié)合,,合成另一條鏈。從第二輪開始,,兩個引物均與特異位點結(jié)合,,從而實現(xiàn)了與常規(guī)PCR的接軌,。而同作為單鏈的RNA卻不能進行PCR擴增,原因就在于實現(xiàn)PCR反應(yīng)的是DNA聚合酶,,只能特意識別DNA鏈,。
2.對于模版的量來說,一般25ul體系DNA的質(zhì)量為50—100ng,。對于基因組DNA由于其結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜,,提取的濃度也往往比較大,為防止?jié)舛冗^大對PCR造成影響,,故需對提取的DNA進行梯度稀釋,。否則濃度過高則可能會引起非特異性擴增。對于質(zhì)粒及PCR產(chǎn)物由于其結(jié)構(gòu)簡單,,且提取濃度一般較低,,則無需稀釋。
PCR實驗中應(yīng)該注意的問題有哪些?
沒有ct值
檢測結(jié)果遇到?jīng)]有Ct值情況,排查是否有以下問題:
1,、循環(huán)數(shù)不夠(一般不超過45循環(huán),不僅背景值提高,定量也不準(zhǔn));
2,、PCR程序設(shè)置錯誤,檢測熒光信號的步驟有誤。一般SG法采用72℃延伸時采集,TaqMan法則一般在退火結(jié)束時或延伸時采集信號,另外熒光采集是否選中;
3,、引物或探針降解,。可通過PAGE電泳檢測引物和探針是否降解;
4,、模板量可能降解或上樣量不足(不超過500ng,根據(jù)試劑盒說明書即可), 對未知濃度的樣本應(yīng)從系列稀釋樣本的最高濃度做起;如果發(fā)生模板降解,應(yīng)考慮樣本準(zhǔn)備中雜質(zhì)的引入及反復(fù)凍融的情況,建議將模板樣本小量分裝儲備,避免反復(fù)凍融;
5,、引物探針是否合適(尤其是引物跨越內(nèi)含子,以確保擴增基因組DNA;上下游引物Tm值超過4℃以上也會影響擴增)。
ct值過晚
在相對定量中, Ct值一般控制在15—25之間比較好,如果在絕對定量中, 對低拷貝數(shù)的樣品,Ct值會增大, 但是一般不宜超過40循環(huán), 否則定量不準(zhǔn)確,。
因此,判斷Ct值出現(xiàn)過晚是否屬于非正常情況, 需要根據(jù)具體實驗設(shè)計和目的進行,。
1、擴增效率低,。引物之間或者引物和探針的比例不合適, 需要進行優(yōu)化;引物或探針設(shè)計不合理, 需要重新設(shè)計;
2,、PCR程序不合適, 改用三步法進行反應(yīng), 或者優(yōu)化退火/延伸溫度, 可以適當(dāng)降低退火溫度; 退火/延伸時間短(可以在推薦的時間條件下延長10s);
3、MgCl2濃度不合適,增加鎂離子濃度等,。PCR各種反應(yīng)成分的降解或加樣量的不足;
4,、PCR產(chǎn)物太長。PCR產(chǎn)物設(shè)計超過500bp;
5,、模板中存在抑制物,。用高純度模板進行PCR檢測或?qū)⒛0暹M行稀釋。
公司正在出售的產(chǎn)品:
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