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ssDNA/RNA環(huán)化連接酶

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產(chǎn)品簡(jiǎn)介

供貨周期 現(xiàn)貨 規(guī)格 2000U、20KU
貨號(hào) A-PJ1088 應(yīng)用領(lǐng)域 化工
主要用途 僅供科研研究實(shí)驗(yàn)    
ssDNA/RNA環(huán)化連接酶公司正在出售的產(chǎn)品:中華鱉脾臟成纖維細(xì)胞 磷化腺苷單磷活化蛋白激α1封閉多肽 肉毒梭狀芽孢桿菌PCR檢測(cè)試劑盒 大鼠生長(zhǎng)激釋放肽ghrelin(GHRP-Ghrelin) 試劑盒 ELISA 葡萄糖氧化(GOD)活性比色法檢測(cè)試劑盒 泊庫島食烷菌 19號(hào)染色體開放閱讀框24抗體

詳細(xì)介紹

公司產(chǎn)品僅供科研研究使用,、不得用于臨床診斷,!

貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

A-PJ1088

ssDNA/RNA環(huán)化連接酶

2000U

A-PJ1088

ssDNA/RNA環(huán)化連接酶

20KU

描述: ssDNA/RNA CircLigase 為熱穩(wěn)定的 DNA/RNA 連接 酶,不依賴于 ATP,,可催化單鏈 DNA 或單鏈 RNA 的分子內(nèi) 環(huán)化,。環(huán)化反應(yīng)中,要求催化底物單鏈 DNA/RNA 具有 5’- 磷酸基團(tuán)和 3’-OH 基團(tuán),。對(duì)于大于 15nt 的單鏈底物,,該酶 都能高效的連接。 

組分

活性定義:65°C 1h 條件下,,催化 1pmol 5’-磷酸化的 ssDNA
底物環(huán)化,,所需的酶量定義為 1Unit。
儲(chǔ)存:-20℃可保存 3 年,。
6.png反應(yīng)實(shí)例
1. 按以下組分配制反應(yīng)液
CircLigase (100 U/μl) 1 μl
5’磷酸化 ssDNA/RNA 10-100 pmol
10×CircLigase Buffer 2 μl
50mM MnCl2 1 μl
ddH2O Up to 20 ul
65°C 孵育 1h 進(jìn)行環(huán)化反應(yīng),。
2. 失活反應(yīng)
反應(yīng)結(jié)束后,可加入終濃度 10mM EDTA 終止反應(yīng),?;虿捎?br data-filtered="filtered" style="box-sizing: border-box; margin: 0px;"/>加熱方式 85℃ 10min 加熱失活。
使用注意事項(xiàng):
(1) 環(huán)化底物 ssDNA 或 RNA 必須帶有 5’磷酸基團(tuán),,3’端含有 OH,。
(2) 環(huán)化體系中的 ATP 濃度高于 20μM 以上時(shí)會(huì)極大抑制環(huán)化效率,甚至導(dǎo)致環(huán)化失敗,。因此建議底物為純化產(chǎn)物,。
(3) 由于本酶提高了耐熱性,在 65℃條件下進(jìn)行連接反應(yīng),,在測(cè)試中 Betain 無益于連接效率提升,。
(4) 本酶主要進(jìn)行分子內(nèi)環(huán)化連接,分子間的連接未檢測(cè)到,。
(5) 本酶對(duì) ssDNA 和 RNA 的環(huán)化效率高,,多數(shù)情況下,90%以上的底物被環(huán)化,。未被環(huán)化的 ssDNA 可通過加入 5U的 Exonuclease I,,37°C 消化 15min 去除,以獲得高純度的環(huán)化 ssDNA。未環(huán)化的 ssRNA,,將稍后給出去除方案,。
(6) 本酶可以連接 15nt 以上的核苷酸,更長(zhǎng)的產(chǎn)物連接參數(shù),,將稍后給出測(cè)試報(bào)告及 protocol,。
(7) 對(duì)于連接底物量較少的實(shí)驗(yàn)來講,推薦縮小體系,,而不是減少酶的用量,。在小體系實(shí)驗(yàn)時(shí)注意體系的蒸發(fā),可加入礦物油以防止蒸發(fā),。



5.png

PCR 反應(yīng)需要使用哪些試劑和設(shè)備,?

試劑:
模板DNA:PCR反應(yīng)需要模板DNA,如從細(xì)胞,、組織,、血液中提取DNA等;引物:PCR反應(yīng)的兩個(gè)引物,,分別與模板DNA的兩端配對(duì)擴(kuò)增所需的特定區(qū)域,,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;dNTPs:PCR反應(yīng)中需要四種dNTPs,,包括脫氧腺苷酸(dATP),、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP),、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),,用于細(xì)胞分裂、DNA合成等生物學(xué)過程,,用于PCR擴(kuò)增的模板DNA鏈的延伸和擴(kuò)增,;Taq DNA聚合酶:PCR反應(yīng)需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,,還有一些其他種類的聚合酶如PFU,、Phusion等,用于擴(kuò)增DNA鏈,;PCR buffer溶液:對(duì)PCR反應(yīng)具有緩沖作用,,調(diào)節(jié)反應(yīng)pH,硫代硫酸氫鹽SDS,、小分子有機(jī)化合物如甲醛,,可增強(qiáng)PCR反應(yīng)特異性,從而提高反應(yīng)效率,;酶切體系:PCR擴(kuò)增往往涉及到重組,、構(gòu)建和測(cè)序等等實(shí)驗(yàn)步驟,,常常需要進(jìn)行酶切操作。MARK:一種分子量標(biāo)準(zhǔn),,用來判別DNA片段大小的工具,。DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應(yīng)產(chǎn)物;
設(shè)備:
PCR儀:用于控制反應(yīng)溫度,,保證PCR反應(yīng)時(shí)不同溫度環(huán)節(jié)的嚴(yán)格控制,;電泳槽:用于分離PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;核酸提取儀:從組織樣本中全自動(dòng)提取核酸,。  這些試劑和設(shè)備在PCR分子生物學(xué)技術(shù)中均是,,只有在有序齊全的基礎(chǔ)上,才能進(jìn)行PCR反應(yīng)并得出準(zhǔn)確結(jié)果,。

PCR相關(guān)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn):

PCR反應(yīng)基本步驟一般的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)由20到35個(gè)循環(huán)組成,,每個(gè)循環(huán)包括以下3個(gè)步驟:

一、變性:

利用高溫(93-98℃)使雙鏈DNA分離,。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷,。在第一個(gè)循環(huán)之前,,通常加熱長(zhǎng)一些時(shí)間以確保模板和引物分離,,僅以單鏈形式存在。該步驟時(shí)間1-2分鐘,,接下來PCR儀就控制溫度進(jìn)入循環(huán)階段,。

二、退火或稱接合,復(fù)性:

在DNA雙鏈分離后,,降低溫度使得引物可以結(jié)合于單鏈DNA上,。此階段的溫度通常低于引物熔點(diǎn)5℃。錯(cuò)誤的退火溫度可能導(dǎo)致引物不與模板結(jié)合或者錯(cuò)誤地結(jié)合,。該步驟時(shí)間1-2分鐘,。

三、延伸:

DNA聚合酶由降溫時(shí)結(jié)合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補(bǔ)鏈,。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶,。該步驟時(shí)間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長(zhǎng)度。傳統(tǒng)的Taq估計(jì)合成1000bp/min,、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒,、商業(yè)公司生產(chǎn)的融合型聚合酶僅需約10-15秒。

PCR反應(yīng)條件優(yōu)化:

1,、變性溫度和時(shí)間:

保證模板DNA解鏈?zhǔn)潜WC整個(gè)PCR擴(kuò)增成功的關(guān)鍵,。加熱90~95°C, 30~60s,再復(fù)雜的DNA 分子也可變性為單鏈,。溫度過高或高溫持續(xù)時(shí)間過長(zhǎng),,可對(duì)Taq酶活性和dNTP分子造成損害,。

2、復(fù)性溫度和時(shí)間:

PCR擴(kuò)增特異性取決于復(fù)性過程中引物與模板的結(jié)合,。復(fù)性溫度越高,,產(chǎn)物特異性越高。復(fù)性溫度越低,,產(chǎn)物特異性越低,。需根據(jù)引物的Tm值具體設(shè)定。

3,、延伸溫度和時(shí)間:

一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間,。引物小于16個(gè)核苷酸時(shí),過高的延伸溫度不利于引物與模板的結(jié)合,,可以緩慢升溫到70~75°C,。延伸反應(yīng)時(shí)間,可根據(jù)待擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度而定,,小于1kb, 1min足夠,;大于1kb需加長(zhǎng)延伸時(shí)間。Taq酶可根據(jù)1kb/min增加時(shí)間,。這里需要注意,,延伸時(shí)間過長(zhǎng)可能出現(xiàn)非特異擴(kuò)增。因此需要設(shè)置恰到好處的延伸時(shí)間,。

4,、循環(huán)數(shù):

其他參數(shù)選定后,PCR循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度,。理論上說20?25次循環(huán)后,,PCR產(chǎn)物的積累即可達(dá)到最大值,實(shí)際操作中由于每步反應(yīng)的產(chǎn)率不可能達(dá)到100%,,因此不管模板濃度是多少,,20~30次是比較合理的循環(huán)次數(shù)。循環(huán)次數(shù)越多,,非特異擴(kuò)增增加,。

公司正在出售的產(chǎn)品:

諾如病毒G3型染料法熒光定量RT-PCR試劑盒

白介12受體亞基β-1ELISA試劑盒 IL12RB1/IL12R/IL12RB免費(fèi)代測(cè)試劑

禽腺病毒(11型)探針法熒光定量PCR試劑盒

24柯薩奇病毒24型變種PCR檢測(cè)試劑盒供應(yīng)

蛋白O-甘露糖基轉(zhuǎn)移1ELISA試劑盒 POMT1免費(fèi)代測(cè)試劑

豬鼻支原體PCR檢測(cè)試劑盒價(jià)格

銅綠假單孢菌(PA/綠膿桿菌  核檢測(cè)試劑盒

富含半胱氨蛋白61ELISA試劑盒

馬流產(chǎn)沙門氏菌探針法熒光定量PCR試劑盒

節(jié)瘤擬桿菌PCR檢測(cè)試劑盒

蛋白精氨甲基轉(zhuǎn)移1ELISA試劑盒

馬鈴薯源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒

蔓荊子探針法PCR鑒定試劑盒

丁型肝炎IgGELISA試劑盒

細(xì)粒棘球絳蟲探針法熒光定量PCR試劑盒

普氏立克次氏體染料法熒光定量PCR試劑盒

短腭肺鼻腔上皮癌關(guān)聯(lián)蛋白3ELISA試劑盒

兔出血癥病毒2(RHDV-2)核檢測(cè)試劑盒

七星庫道蟲探針法熒光定量PCR試劑盒

多肽YYELISA試劑盒

禽白血病病毒I亞群染料法熒光定量RT-PCR試劑盒

瑪爾摩分枝桿菌PCR檢測(cè)試劑盒

二氫二醇脫氫2ELISA試劑盒

鯉皰疹病2PCR檢測(cè)試劑盒說明書

馬隱秘桿菌PCR檢測(cè)試劑盒說明書

泛蛋白連接E3成分N-識(shí)別蛋白4ELISA試劑盒

諾如病毒 G Ⅱ型核檢測(cè)試劑盒

葡萄孢菌PCR檢測(cè)試劑盒

紡錘體蛋白4ELISA試劑盒

馬類圓線蟲PCR檢測(cè)試劑盒

淋球菌PCR檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法)

人蛋白體(prosome,macropain)亞基,2(PSMB2)試劑盒ELISA

禽白血病病毒PCR檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法)

牛免疫缺損病毒探針法熒光定量RT-PCR試劑盒

αN已酰氨基葡糖苷(αNAG)ELISA試劑盒

革蘭氏陽性細(xì)菌通用染料法熒光定量PCR試劑盒

腸出血性大腸桿菌O157:H7血清型探針法熒光定量PCR試劑盒

ssDNA/RNA環(huán)化連接酶人激R型同工(R-PK)檢測(cè)試劑盒elisa

大鼠白血病病毒PCR檢測(cè)試劑盒

鳥分枝桿菌類結(jié)核亞型探針法熒光定量PCR試劑盒

β甘露糖苷(β Manase) 試劑盒 ELISA

布魯塞爾德克酵母探針法熒光定量PCR試劑盒

惡性瘧原蟲(PF)核檢測(cè)試劑盒

人雌三醇(E3)ELISA試劑盒

禽傳染性支氣管炎病毒型PCR檢測(cè)試劑盒

 


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