技術文章
解決PCR產物中出現(xiàn)假陰性或無擴增產物
閱讀:1994 發(fā)布時間:2022-5-23解決PCR產物中出現(xiàn)假陰性或無擴增產物(即陽性對照中有條帶,,而樣品則無條帶)方法:
1、條帶放置時間過久,核酸被降解,,最好在48h內進行電泳檢測,。
2,、DNA模板純度低,如含有雜蛋白質或Taq酶抑制劑,,可對DNA進行再次純化或重新用優(yōu)質試劑盒提取DNA; DNA濃度太低時,,可以加大模板量;對具有二級結構DNA使用較好的聚合酶,;提取DNA時,,避免吸入酚類試劑。
3,、對設計不合理的引物進行重新設計合成,;引物應高濃度小量分裝保存,防止多次凍融而降解失效,;檢測引物OD值并進行電泳檢測以確保兩條引物濃度一致,。
4、酶失活時,,更換新酶,,或新舊兩種酶同時使用,以分析是否因酶的活性喪失或不夠而導致假陰性,。
5,、PCR反應條件:提高變性/退火溫度;適當增加循環(huán)次數(shù),。
6,、Mg2+濃度過低可影響PCR擴增產量甚至使PCR擴增失敗,而Mg2+濃度過高會降低PCR的特異性,,因而可適當提高Mg2+濃度,。
7、如果靶序列發(fā)生突變或缺失時,,也會影響引物和模板的特異性結合,,產生假陰性結果。
Q3:非特異性條帶擴增或者條帶出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象
Answer:
1,、當引物特異性差或引物形成二聚體時,,可重新設計引物或者使用巣式PCR
2、若模板或引物濃度過高,,可適當降低模板或引物濃度
3,、酶量過多,則適當減少酶量
4,、Mg2+濃度偏高,,則降低鎂離子濃度
5、退火溫度偏低,適當提高退火溫度或使用二階段溫度法(94變性,,65左右退火與延伸)
6,、循環(huán)次數(shù)過多,不僅會降低擴增效率,,且會使錯誤摻入率增加,,因此需要減少循環(huán)次數(shù)。