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PCR產(chǎn)物跑不出來(lái)?xiàng)l帶原因參考
閱讀:15447 發(fā)布時(shí)間:2022-3-23PCR是分子生物學(xué)的常規(guī)和常用手段,,用途很多,但是都是通過(guò)擴(kuò)增目的基因片段來(lái)實(shí)現(xiàn)的。
那么,,首先需要搞明白的是,,需要擴(kuò)增的基因片段大小是多大,因?yàn)椴煌笮〉幕蚱纹鋽U(kuò)增的難度是有差異的,,尤其過(guò)長(zhǎng)的片段,,需要使用不同的taq酶來(lái)進(jìn)行擴(kuò)增(比如LA taq)。幾點(diǎn)容易發(fā)生問(wèn)題的地方供參考:
1.引物,,PCR是基于引物來(lái)實(shí)現(xiàn)的,。引物是否是自己設(shè)計(jì)的?如果是,,需要檢查一下引物設(shè)計(jì)的是否合理,。如果是從文獻(xiàn)中選取的,一般出問(wèn)題的可能性不大,,不放心的可以在數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)一下,,防止文獻(xiàn)出錯(cuò)。
2.模板,,一般來(lái)講通過(guò)試劑盒提取的DNA質(zhì)量都是可以保證的,,也能在4℃冰箱放置較長(zhǎng)的時(shí)間,仍能進(jìn)行PCR擴(kuò)增,。要是通過(guò)煮沸法粗提的DNA就沒(méi)辦法放置太長(zhǎng)時(shí)間了,。一句話就是,模板DNA的濃度要合適,。
3.反應(yīng)條件,,這一塊就比較復(fù)雜了,特別是對(duì)自己設(shè)計(jì)的引物來(lái)說(shuō),,選擇合適的退火溫度,,是需要慢慢摸索的,一般根據(jù)計(jì)算的退火溫度降低5~10℃來(lái)進(jìn)行首chi擴(kuò)增,,如果出現(xiàn)了目的條帶,,且有雜帶時(shí),在逐步提高退火溫度,,以提高反應(yīng)的特異性,。
此外,還有反應(yīng)體系,,電泳條件等等因素,。