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PCR產(chǎn)物跑不出來條帶原因參考
閱讀:15087 發(fā)布時間:2022-3-23PCR是分子生物學的常規(guī)和常用手段,,用途很多,但是都是通過擴增目的基因片段來實現(xiàn)的,。
那么,,首先需要搞明白的是,需要擴增的基因片段大小是多大,,因為不同大小的基因片段其擴增的難度是有差異的,,尤其過長的片段,需要使用不同的taq酶來進行擴增(比如LA taq),。幾點容易發(fā)生問題的地方供參考:
1.引物,,PCR是基于引物來實現(xiàn)的。引物是否是自己設(shè)計的,?如果是,,需要檢查一下引物設(shè)計的是否合理。如果是從文獻中選取的,,一般出問題的可能性不大,,不放心的可以在數(shù)據(jù)庫比對一下,防止文獻出錯,。
2.模板,,一般來講通過試劑盒提取的DNA質(zhì)量都是可以保證的,也能在4℃冰箱放置較長的時間,,仍能進行PCR擴增,。要是通過煮沸法粗提的DNA就沒辦法放置太長時間了。一句話就是,,模板DNA的濃度要合適,。
3.反應(yīng)條件,,這一塊就比較復雜了,特別是對自己設(shè)計的引物來說,,選擇合適的退火溫度,是需要慢慢摸索的,,一般根據(jù)計算的退火溫度降低5~10℃來進行首chi擴增,如果出現(xiàn)了目的條帶,,且有雜帶時,,在逐步提高退火溫度,,以提高反應(yīng)的特異性,。
此外,還有反應(yīng)體系,,電泳條件等等因素。