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探針?lè)晒舛縋CR試劑盒通用原則：
1,，先選擇好探針，然后設(shè)計(jì)引物使其盡可能的靠近于探針。
2,， 擴(kuò)增子的長(zhǎng)度應(yīng)不超過(guò)400bp，理想的能在100－150bp內(nèi),，擴(kuò)增片斷約短,，有效的擴(kuò)增反應(yīng)就越容易獲得。較短的擴(kuò)增片斷也容易保證分析的一致性
3,， 保持GC含量在20％和80％之間,，GC富含區(qū)容易產(chǎn)生非特異反應(yīng)，從而會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增效率的降低,，及在SG分析中非特異信號(hào),。
4， 為了保證效率和重復(fù)性,，應(yīng)避免重復(fù)的核苷酸序列,，尤其是G（不能有4個(gè)連續(xù)的G）
5， 將引物和探針互相進(jìn)行配對(duì)檢測(cè),，以避免二聚體和發(fā)卡結(jié)構(gòu)的形成,。
探針?lè)晒舛縋CR試劑盒探針設(shè)計(jì)指導(dǎo)
1,，在設(shè)計(jì)引物之前設(shè)計(jì)探針
2，探針的Tm值應(yīng)在68－70℃之間,，如果是目測(cè)探針,，則要仔細(xì)審查GC富含區(qū)。
3,，探針的5’端要避免有鳥氨酸,，5’G會(huì)有淬滅作用，即使被切割下來(lái)這種淬滅作用也還會(huì)存在
4,，選擇C多于G的鏈作探針,，G的含量多于C會(huì)降低反應(yīng)效率，這時(shí)就應(yīng)選擇配對(duì)的另一條鏈作為探針,。
6,， 探針應(yīng)盡可能的短，不要超過(guò)30個(gè)bp,。
7,， 檢測(cè)探針的DNA折疊和二級(jí)結(jié)構(gòu)。