真空轉印儀使用需要剪一塊尼龍膜,，要求其大小比窗口密封墊的邊緣至少寬0.5cm,。再剪一張與尼龍膜大小一致的濾紙,。剪一塊窗口密封墊，要求密封墊的邊緣比膠的邊緣至少窄0.5cm。
真空轉印儀操作步驟：
1.把尼龍膜以45度角方向浸入水中，潤濕膜，然后在在合適的轉印溶液中浸潤膜,。
2.把孔狀真空板置于平臺上,。依次放置潤濕的濾紙,，尼龍膜,，用10ml的玻璃管趕走膜上的氣泡,。
3.用水潤濕密封O型環(huán)。
4.把窗口密封墊置于膜上,。確保密封墊覆蓋住整個O型環(huán),。同時確保密封墊覆蓋住濾紙/膜,。請參照下圖進行組裝,。
5.把膠輕柔的置于密封墊上，覆蓋住窗口,。用玻璃管趕走氣泡,，確保膠的邊緣超出密封墊至少5cm。
6.把密封框置于頂部,，鎖住密封框,。
7.旋松(逆時針)真空調節(jié)閥幾圈以防止強的內部真空,。
8.慢慢的旋緊調節(jié)閥直到讀數(shù)為5inchesHg。如果使用Bio-Rad的真空泵,，需要在轉印前預熱10分鐘,。如果不預熱,，真空泵升壓會比較慢,，約在10分鐘后穩(wěn)定。
9.沿著窗口的邊緣用手指輕輕的按住膠,。此操作可幫助在膠和密封墊之間形成緊密的真空密封。
10.輕輕的倒入1000至1500ml的轉印緩沖液,。檢查膠是否移位,。如果膠漂浮起來了,，需要拆掉密封框，排干轉膜液,，重新按5至10步驟進行操作。
11.把轉印儀的蓋子蓋好。檢查緩沖液的水平面,，其高度應該高于膠,。檢查真空壓力，調節(jié)至5inchesHg,。
12.在設定壓力下轉膜90分鐘,。
轉印后這樣操作：
1.90分鐘后,，關掉真空裝置,。
2.打開密封框，把上層緩沖液排出,。
3.拿掉轉印膠，位于窗口中的膠應該比位于窗口外的膠薄一半,。檢查膠中剩余的DNA,，可以用EB染色來觀察。
4.拿掉窗口密封墊和尼龍膜,。把膜浸泡在2×SSC中5分鐘,，然后把膜夾在兩層濾紙中在真空干燥箱中80度干燥30分鐘,。干燥后的膜即可進行雜交。
5.拿掉轉印儀上的濾紙并從底盤中倒掉緩沖液,，按要求清洗轉印儀,。
