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多肽合成與修飾技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系。
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測序?qū)嶒灹鞒蹋?br>具體合成由下列幾個循環(huán)組成:
1) 去保護:Fmoc保護的柱子和單體必須用一種堿性溶劑(piperidine)去 除氨基的保護基團,。
2) 激活和交聯(lián):下一個氨基酸的羧基被一種活化劑所活化,。活化的單體與游離的氨基反應(yīng)交聯(lián),,形成肽鍵,。在此步驟使用大量的超濃度試劑驅(qū)使反應(yīng)完成。循環(huán):這兩步反應(yīng)反復(fù)循環(huán)直到合成完成,。
3) 洗脫和脫保護:多肽從柱上洗脫下來,,其保護基團被一種脫保護劑(TFA) 洗脫和脫保護,。
試劑檢測:沒有選購在線檢測附件的多肽合成儀用戶,,也可以采用試劑檢測方法做基本的耦合效果測定實驗,。
固相多肽合成中,,主要是通過檢測樹脂上游離氨基來判斷連接效率,,檢測方法稱為Kaiser方法,,其檢測結(jié)果,,如果有游離氨基的時候,顯示蘭色,,或紅褐色(pro,ser,,His),。
Kaiser試劑包括:A,6% 茚三酮的乙醇溶液,;B,,80% 苯酚的乙醇溶液;C,,2% 0.001M KCN的吡啶溶液
用線型梯變以每分鐘 0.5% 到 1.0% 改變的速度混合,。常見分析和純化用柱為 4.6× 250mm (3-10μ m) 和 22× 250mm (10μ m). 如果用徑向填柱,那么大小是 8×100 ( 3-10μ m )和 25× 250mm (10μ m)大量各種緩沖劑含許多不同試劑,比如 heptafluorobutyric 酸,, 0.1% 磷酸,, 稀 Heformic 酸 (5-6%, pH2-4), 10 -100mM NH4HCO3, 醋酸鈉 / 氨,, TFA/TEA ,,磷酸鈉或鉀,異戊酚,。這樣許多不同組合可形成緩沖劑,,但要注意一點:硅反相柱料不能長時間暴露于高 pH ,甚至微堿 pH ,, 因為這樣會破壞柱子一般多肽分離拿150mm的柱子就可以了,,250mm在分離度上改善不大,因為多肽的分離機理和小分子不同,。小分子是通過液液交換,,所以柱子越長交換越充分,分離度也越高,。
Asp和Glu
Asp和Glu側(cè)鏈羧基常用t-Bu保護.可用TFA,、TMSBr等脫除.但是用t-Bu保護仍有側(cè)鏈環(huán)化形成酰亞胺的副反應(yīng)發(fā)生.近年來,發(fā)展了一些新的保護基如環(huán)烷醇酯,、金剛烷醇酯等可減輕這一副反應(yīng),,這些保護基可用TMSOTf(三氟甲磺酸*硅烷酯)除去.
Ser、Thr和Tyr
ser,、Thr的羥基及Tyr的酚羥基通常用t-Bu保護.叔丁基的引入比較麻煩,,首先ser制成芐氧羰基酯,再在酸催化下與異丁烯反應(yīng).Ser和Thr還可用芐基保護,,Ser用芐醇引入芐基,、Thr用溴芐引入芐基.
Asn和Gln
Asn和Gln側(cè)鏈的酰胺鍵在肽合成中一般不加以保護.但合成大肽時,Asn和Gln的α-羧基活化時可能會發(fā)生分子內(nèi)脫氫反應(yīng)生成氰基化合物.堿性時Gln的側(cè)鏈可以環(huán)化生成酰胺.而且不保護的Fmoc-Gln和Fmoc-Asn在DCM中溶解度很差.為了避免這些問題,,可以用9-咕噸基,,2,4,,6-*氧芐基,,4,4′―二甲氧二苯甲基或三苯甲基等保護,,這四種基因均可用TFA脫除.
His
His是zui容易發(fā)生消旋化的氨基酸,,必須加以保護.
對咪唑環(huán)的非π-N開始用芐基(Bzl)和甲基磺酰基(TOS)保護.但這兩種保護基均不太理想.TOS對親核試劑不穩(wěn)定,,Bzl需要用氫解或Na/NHs除去,,并且產(chǎn)生很大程度消旋.Boc基團是一個較理想的保護基,,降低了咪唑環(huán)的堿性,抑制了消旋,,成功地進行了一些合成.但是當(dāng)反復(fù)地用堿處理時,,也表現(xiàn)出一定的不穩(wěn)定性在堿中穩(wěn)定,但是沒能很好地抑制消旋,,而且脫保護時要用很強的親核試劉如.
對咪唑環(huán)π-N保護,,可以*抑制消旋,π-N可以用芐氧甲基(Bom)和叔丁氧甲基(Bum)保護,,(Bum)可以用TFA脫除,,Bom更穩(wěn)定些,需用催化氫解或強酸脫保護,,Bum是目前很有發(fā)展前途的His側(cè)鏈保護基,,其不足之處在于Fmoc(His)Bum在DCM和DMF中的溶解度較差.
Cys
Cys的-SH具有強親核性,易被?;闪蛎?,也易被氧化為二硫鍵,必須加以保護.常用保護基有三類:一類用TFA可脫除,,如對甲芐基,、對甲氧芐基和三苯甲基等;第二類可用(CF3CO)3T1/TFA脫除,對TFA穩(wěn)定.如t-Bu,、Bom和乙酰胺甲基等.第三類對弱酸穩(wěn)定,,如芐基和叔丁硫基(stBu)等,Cys(StBu)可用巰基試劑和磷試劑還原,,Cys(Bzl)可用Na/NH3(1)脫保護.
Arg
Arg的胍基具有強親核性和堿性,,必須加以保護.理想的情況是三個氮都加以保護,實際上保護1或2個胍基氮原子.保護基分四類:(1)硝基(2)烷氧羰基(3)磺?;?4)三苯甲基.
硝基在制備,、?;呀庵挟a(chǎn)生很多副反應(yīng),,應(yīng)用不廣.烷氧羰基應(yīng)主要有Boc和二金剛烷氧羰基(Adoc)2、Fmoc(Arg)Boc的耦聯(lián)反效率不高,,理時不處穩(wěn)定,,會發(fā)生副反應(yīng);Adoc保護了兩個非π-N,但有同樣的副反應(yīng)發(fā)生.對磺?;Wo,,其中TOS應(yīng)用zui廣,但它較難脫除.近年來2,,3,,6-*基-4-甲氧苯橫酰基(Mtr)較受歡迎,在TFA作用下,,30分鐘即可脫除,,但是它們都不能*抑制側(cè)鏈的酰化發(fā)生.三苯甲基保護基可用TFA脫除.缺點是反應(yīng)較慢,,側(cè)鏈仍有?;磻?yīng),且其在DCM,、DMF中溶解度不好.
Lys
Lys的ε-NH2必須加以保護.但與α-NH2的保護方式應(yīng)不同,,該保護基要到肽鏈合成后除去.ε-NH2的保護無消旋問題,可以采用?;Wo基,,其它常用的保護基有芐氧碳基
Fmoc基團的脫除
Fmoc基團的芴環(huán)系的吸電子作用使9-H具有酸性,易被較弱堿除去,,反應(yīng)條件很溫和.反應(yīng)過程可表示如下:進攻9-H,β消除形成二苯芴烯,,很容易被二級環(huán)胺進攻形成穩(wěn)定的加成物.Fmoc基團對不同的堿穩(wěn)定性不同,可根據(jù)實際條件選用.
多肽修飾服務(wù):包括同位素標記( 2H, 15N, 13C),、聚乙二醇修飾,、多種二硫鍵修飾、多種磷酸化,、KLH,、BSA、OVA,、多肽的乙?;被?、甲基化,、生物素標記、熒光等修飾,。
修飾服務(wù)的特點
全面的熒光標記基團可選:例如熒光素(Fluorescein),, 異硫氰酸熒光素(FITC), 四甲基羅丹明(Tetramethylrhodamine),, 磺酰羅丹明(Sulforhodamine),, Dinitrophenyl, Dansyl 等
修飾方式牢固:共價鍵結(jié)合,,穩(wěn)定,,不易被破壞
修飾方式多樣:熒光基團和多肽鍵之間還可以加入多種功能性linker
修飾位置靈活:N端、C端,,或者中間序列均可
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