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Acridine Orange屬于三環(huán)雜芳香燃料，可以標記DNA,、RNA,，屬于異染性熒光染料，AO常用于細胞內(nèi)DNA和RNA進行檢測,，AO與核酸結(jié)合方式主要有：1,、插入性結(jié)合，AO嵌入核酸雙鏈的堿基對之間,，這種結(jié)合方式主要為AO與DNA的結(jié)合,，其熒光發(fā)射峰為530nm，激發(fā)后呈綠色熒光,；2,、靜電吸引，帶正電荷的AO與單鏈核酸的磷酸根(帶負電荷)產(chǎn)生靜電間的吸引結(jié)合,，這種結(jié)合方式主要為AO與RNA的結(jié)合,，其熒光發(fā)射峰為640nm，激發(fā)后呈紅色熒光,，少量結(jié)合會呈桔黃色或桔紅色熒光,。因此AO嵌合到雙鏈DNA分子中顯綠色,，與DNA單鏈或RNA結(jié)合時發(fā)橙紅色熒光；Ethidium Bromide嵌合到雙鏈DNA或RNA的堿基對中,，無堿基特異性,，發(fā)紅色熒光；AO可透過活細胞膜,，EB不能通過與活細胞膜具有相同通透性的細胞膜,。