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熒光定量PCR總RNA提取步驟
閱讀:331 發(fā)布時(shí)間:2023-8-71、A組織樣本:
迅速將新鮮的組織切成合適的大小,,在液氮中充分研磨后加裂解液裂解,,或直接加入裂解液后用勻漿器勻漿。每30-50mg組織加1ml Trizol,。
2,、B全血樣品:
加入3-5倍體積的紅細(xì)胞裂解液到血樣中,室溫孵育10min,,室溫3500rpm離心6min,。棄上清,原每2-3ml全血樣品加1mL Trizol,。
3,、C細(xì)胞樣品:
懸浮液中生長的細(xì)胞,通過離心收集細(xì)胞后,,每1×105?106細(xì)胞加入1mL Trizol,,移液器吹打混勻,直接裂解或-80℃儲(chǔ)存一個(gè)月,。貼壁生長的細(xì)胞,,有兩種處理方法。一種是移除培養(yǎng)基后,,將1mL Trizol直接加入直徑3.5cm的培養(yǎng)皿中裂解細(xì)胞,。或是先用胰蛋白酶將貼壁細(xì)胞消化下來并收集后,,再加入1mL Trizol進(jìn)行裂解,。(Note:加入Trizol前, PBS充分洗滌細(xì)胞去除殘余培養(yǎng)基,。)
4.1、 直接法
1),、加入1ml Trizol試劑,,混勻,冰上孵育10min,。
2),、4℃,12000rpm離心10min,,小心轉(zhuǎn)移上清液到不含顆粒的新EP管中,。
3)、加入200ul氯仿,,劇烈振蕩15秒,,室溫孵育5min。
4),、4℃,,12000rpm離心15min?;旌弦悍秩龑樱ㄗ钕旅娴谋椒?- 氯仿有機(jī)相,,中間相和上層水相,。小心轉(zhuǎn)移上層水相到新的EP管(大約60%體積的Trizol),不要吸取中間相,,可留下少量上層液體?。∟ote:質(zhì)量比數(shù)量更重要!)
5),、加入等體積的異丙醇,,輕輕地顛倒混勻約10次,室溫放置10min,。
6),、4℃,12000rpm離心10min,。棄上清,,1ml 75%乙醇洗滌RNA沉淀兩次。
7),、4℃,,12000rpm離心5min,棄上清,,室溫下風(fēng)干5-10min(不要太干,,過度干燥會(huì)導(dǎo)致RNA難溶解?。NA溶于15μl-50μlDEPC水中,。
8),、立即進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),或先-80℃長期保存,。
4.2,、 離心柱法
1)、4.1中步驟1)—4),。
2),、加入1/2體積的無水乙醇,輕柔顛倒混勻,。如有透明的纖維狀物體,,不影響下游步驟。
3),、將所有裂解物/乙醇混合物轉(zhuǎn)移至離心柱,,置于2mL,靜置2min,。4℃,,12000rpm離心3min,棄廢液,。
4),、加入500uL洗滌液,靜置2min,。4℃,,12000rpm離心30秒,棄廢液,。重復(fù)一次,。
5)、4℃,,10,000rpm離心2min以除去殘留的乙醇,。
6)、將離心柱置于新的RNase-free EP管中,,加入30ul-50ulDEPC水,,靜置5min, 12000rpm離心2min收集,。
7),、立即進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),或先-80℃長期保存,。