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實(shí)時(shí)熒光定量 PCR (RT-qPCR)原理及熒光技術(shù)方法
閱讀：539 發(fā)布時(shí)間：2024-10-14實(shí)時(shí)熒光定量 PCR (RT-qPCR) 是一種用于實(shí)時(shí)擴(kuò)增和檢測(cè)特定 DNA 或 RNA 序列的分子生物學(xué)技術(shù)。該方法利用熒光染料或探針,，當(dāng)與擴(kuò)增的 DNA 或 RNA 分子結(jié)合時(shí)會(huì)發(fā)出信號(hào)，從而可以對(duì)目標(biāo)序列進(jìn)行量化,。RT-qPCR 通常用于基因表達(dá)分析、病毒載量定量和基因突變檢測(cè)等應(yīng)用,。
RT-qPCR原理的三個(gè)主要步驟：
1 、反轉(zhuǎn)錄：
1）,、使用逆轉(zhuǎn)錄酶和特定引物將RNA樣品反轉(zhuǎn)錄成cDNA,。
2）,、該步驟將RNA模板轉(zhuǎn)化為更穩(wěn)定且可擴(kuò)增的DNA形式。
3）,、反轉(zhuǎn)錄過(guò)程中使用特定引物。
2 ,、PCR擴(kuò)增：
1）、使用特定引物對(duì)cDNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,，這些引物環(huán)繞目標(biāo)區(qū)域,。
2）,、PCR是一個(gè)循環(huán)過(guò)程,，呈指數(shù)級(jí)擴(kuò)增DNA模板的數(shù)量,。
3）、PCR反應(yīng)中包含熒光染料或探針,，它們結(jié)合到擴(kuò)增的DNA序列上并發(fā)出熒光信號(hào),。
3,、 熒光實(shí)時(shí)檢測(cè)：
1）,、使用實(shí)時(shí)PCR儀器實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào),。
2）、熒光的數(shù)量與每個(gè)PCR循環(huán)中擴(kuò)增的DNA數(shù)量成比例,。
3）,、使用專業(yè)軟件分析數(shù)據(jù)以確定循環(huán)閾值（Ct）值，該值表示熒光信號(hào)達(dá)到特定閾值水平所需的循環(huán)數(shù),。Ct值用于計(jì)算原始樣品中存在的目標(biāo)DNA量，從而允許進(jìn)行基因表達(dá)或病毒載量等定量分析,。
根據(jù)所使用的技術(shù)不同，實(shí)時(shí)熒光定量PCR可以分為：熒光探針和熒光染料兩種方法,。
現(xiàn)將其原理簡(jiǎn)述如下：
1. TaqMan熒光探針
TaqMan探針?lè)ㄊ歉叨忍禺惖亩?/span>PCR技術(shù)，其核心是利用Taq酶的3'→5'外切核酸酶活性,，切斷探針,，產(chǎn)生熒光信號(hào)。PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,，該探針為一寡核苷酸，兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán),。探針完整時(shí),，報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收；PCR擴(kuò)增時(shí),，Taq酶的3'→5'外切酶活性將探針酶切降解，使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,，從而熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào)，即每擴(kuò)增一條DNA鏈,，就有一個(gè)熒光分子形成，實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成wan全同步,。而新型TaqMan-MGB探針使該技術(shù)既可進(jìn)行基因定量分析，又可分析基因突變（SNP），有望成為基因診斷和個(gè)體化用藥分析的shou選技術(shù)平臺(tái),。
2. SYBR熒光染料
在PCR反應(yīng)體系中，加入過(guò)量SYBR熒光染料,，SYBR熒光染料非特異性地?fù)饺?/span>DNA雙鏈后,，發(fā)射熒光信號(hào)，而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會(huì)發(fā)射任何熒光信號(hào),，從而保證熒光信號(hào)的增加與PCR產(chǎn)物的增加wan全同步,。SYBR僅與雙鏈DNA進(jìn)行結(jié)合，因此可以通過(guò)溶解曲線,，確定PCR反應(yīng)是否特異,。SYBR熒光染料法定量PCR的基本過(guò)程是：
① 開(kāi)始反應(yīng),，當(dāng)SYBR染料與DNA雙鏈結(jié)合時(shí)發(fā)出熒光,；
② DNA變性時(shí),，SYBR染料釋放出來(lái),，熒光急劇減少；
③ 在聚合延伸過(guò)程中,，引物退火并形成PCR引物；
④ 聚合完成后,，SYBR染料與雙鏈產(chǎn)物結(jié)合,，定量PCR系統(tǒng)檢測(cè)到熒光的凈增量加大。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)根據(jù)化學(xué)原理可以分為探針類和非探針類,。探針類實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù)主要是利用與靶序列特異雜 交的探針來(lái)指示擴(kuò)增產(chǎn)物的增加；非探針類實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技 術(shù)主要通過(guò)熒光染料來(lái)指示產(chǎn)物的增加,。無(wú)論是探針類實(shí)時(shí)熒光 定量 PCR 技術(shù)還是非探針類實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù),，檢測(cè)的都是 擴(kuò)增產(chǎn)物的增加量。但探針類實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù)增加了識(shí)別 探針的具體的流程,，操作的難度較大,。