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PCR反應主要五種物質
閱讀:600 發(fā)布時間:2023-3-13PCR反應五要素:參加PCR反應的物質主要有五種即引物、酶,、dNTP,、模板和Mg2+。
1、引物量: 每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,,以zui低引物量產生所需要的結果為好,,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體的機會,。
2,、酶及其濃度 目前有兩種Taq DNA聚合酶供應, 一種是從棲熱水生桿菌中提純的天然酶,,另一種為大腸菌合成的基因工程酶,。催化一典型的PCR反應約需酶量2.5U(指總反應體積為100ul時),濃度過高可引起非特異性擴增,,濃度過低則合成產物量減少,。
3、dNTP的質量與濃度 dNTP的質量與濃度和PCR擴增效率有密切關系,,dNTP粉呈顆粒狀,,如保存不當易變性失去生物學活性,。dNTP溶液呈酸性,,使用時應配成高濃度后,以1M NaOH或1M Tris,。HCL的緩沖液將其PH調節(jié)到7.0~7.5,,小量分裝, -20℃冰凍保存,。多次凍融會使dNTP降解,。在PCR反應中,dNTP應為50~200umol/L,,尤其是注意4種dNTP的濃度要相等( 等摩爾配制),,如其中任何一種濃度不同于其它幾種時(偏高或偏低),就會引起錯配,。濃度過低又會降低PCR產物的產量,。dNTP能與Mg2+結合,使游離的Mg2+濃度降低,。
4,、模板(靶基因)核酸 模板核酸的量與純化程度,是PCR成敗與否的關鍵環(huán)節(jié)之一,,傳統(tǒng)的DNA純化方法通常采用SDS和蛋白酶K來消化處理標本,。SDS的主要功能是:溶解細胞膜上的脂類與蛋白質,因而溶解膜蛋白而破壞細胞膜,,并解離細胞中的核蛋白,,SDS 還能與蛋白質結合而沉淀;蛋白酶K能水解消化蛋白質,特別是與DNA結合的組蛋白,,再用有機溶劑酚與氯仿抽提掉蛋白質和其它細胞組份,,用乙醇或異丙醇沉淀核酸。提取的核酸即可作為模板用于PCR反應,。一般臨床檢測標本,,可采用快速簡便的方法溶解細胞,裂解病原體,,消化除去染色體的蛋白質使靶基因游離,,直接用于PCR擴增。RNA模板提取一般采用異硫氰酸胍或蛋白酶K法,,要防止RNase降解RNA,。
5、Mg2+濃度 Mg2+對PCR擴增的特異性和產量有顯著的影響,,在一般的PCR反應中,,各種dNTP濃度為200umol/L時,Mg2+濃度為1.5~2.0mmol/L為宜,。Mg2+濃度過高,,反應特異性降低,出現非特異擴增,,濃度過低會降低Taq DNA聚合酶的活性,,使反應產物減少。