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PCR反應(yīng)主要五種物質(zhì)
閱讀:511 發(fā)布時(shí)間:2023-3-13PCR反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即引物,、酶,、dNTP、模板和Mg2+,。
1,、引物量: 每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以zui低引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,,引物濃度偏高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性擴(kuò)增,,且可增加引物之間形成二聚體的機(jī)會(huì)。
2,、酶及其濃度 目前有兩種Taq DNA聚合酶供應(yīng),, 一種是從棲熱水生桿菌中提純的天然酶,另一種為大腸菌合成的基因工程酶,。催化一典型的PCR反應(yīng)約需酶量2.5U(指總反應(yīng)體積為100ul時(shí)),,濃度過高可引起非特異性擴(kuò)增,濃度過低則合成產(chǎn)物量減少,。
3,、dNTP的質(zhì)量與濃度 dNTP的質(zhì)量與濃度和PCR擴(kuò)增效率有密切關(guān)系,dNTP粉呈顆粒狀,,如保存不當(dāng)易變性失去生物學(xué)活性,。dNTP溶液呈酸性,使用時(shí)應(yīng)配成高濃度后,,以1M NaOH或1M Tris,。HCL的緩沖液將其PH調(diào)節(jié)到7.0~7.5,小量分裝,, -20℃冰凍保存,。多次凍融會(huì)使dNTP降解。在PCR反應(yīng)中,,dNTP應(yīng)為50~200umol/L,,尤其是注意4種dNTP的濃度要相等( 等摩爾配制),,如其中任何一種濃度不同于其它幾種時(shí)(偏高或偏低),就會(huì)引起錯(cuò)配,。濃度過低又會(huì)降低PCR產(chǎn)物的產(chǎn)量,。dNTP能與Mg2+結(jié)合,使游離的Mg2+濃度降低,。
4,、模板(靶基因)核酸 模板核酸的量與純化程度,是PCR成敗與否的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一,,傳統(tǒng)的DNA純化方法通常采用SDS和蛋白酶K來消化處理標(biāo)本,。SDS的主要功能是:溶解細(xì)胞膜上的脂類與蛋白質(zhì),因而溶解膜蛋白而破壞細(xì)胞膜,,并解離細(xì)胞中的核蛋白,,SDS 還能與蛋白質(zhì)結(jié)合而沉淀;蛋白酶K能水解消化蛋白質(zhì),,特別是與DNA結(jié)合的組蛋白,,再用有機(jī)溶劑酚與氯仿抽提掉蛋白質(zhì)和其它細(xì)胞組份,用乙醇或異丙醇沉淀核酸,。提取的核酸即可作為模板用于PCR反應(yīng),。一般臨床檢測(cè)標(biāo)本,可采用快速簡(jiǎn)便的方法溶解細(xì)胞,,裂解病原體,,消化除去染色體的蛋白質(zhì)使靶基因游離,直接用于PCR擴(kuò)增,。RNA模板提取一般采用異硫氰酸胍或蛋白酶K法,,要防止RNase降解RNA。
5,、Mg2+濃度 Mg2+對(duì)PCR擴(kuò)增的特異性和產(chǎn)量有顯著的影響,,在一般的PCR反應(yīng)中,各種dNTP濃度為200umol/L時(shí),,Mg2+濃度為1.5~2.0mmol/L為宜,。Mg2+濃度過高,反應(yīng)特異性降低,,出現(xiàn)非特異擴(kuò)增,濃度過低會(huì)降低Taq DNA聚合酶的活性,,使反應(yīng)產(chǎn)物減少,。