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流感病毒N6亞型核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)反應(yīng)流程常規(guī)程序

閱讀:257          發(fā)布時間:2023-1-4

流感病毒N6亞型核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)反應(yīng)流程常規(guī)程序:


將PCR反應(yīng)所需的成分配置完后,,在PCR儀上于94-96℃預(yù)加熱幾十秒至幾分鐘,使模板DNA充分變性,,然后進(jìn)入擴(kuò)增循環(huán),。在每一個循環(huán)中,先于94℃保持30秒鐘使模板變性,,然后將溫度降到復(fù)性溫度(一般50-60℃之間),,一般保持30秒鐘,使引物與模板充分退火,;在72℃保持1分鐘(擴(kuò)增1kb片段),,使引物在模板上延伸,合成DNA,,完成一個循環(huán),。重復(fù)這樣的循環(huán)25~35次,使擴(kuò)增的DNA片段大量累積,。最后,,在72℃保持3-7min,使產(chǎn)物延伸完整,,4℃保存。


2.復(fù)性(退火)和延伸溫度


復(fù)性的溫度是PCR擴(kuò)增是否順利的關(guān)鍵因素,,通常在50-60℃之間,。具體的溫度主要由引物的Tm值決定。延伸溫度絕大多數(shù)設(shè)定為72℃,。如果復(fù)性的溫度很高,,可以將延伸溫度和復(fù)性溫度設(shè)置成同一溫度,變成二步法PCR,。


3.反應(yīng)時間


變性步驟一般使用30秒鐘,,如果模板的G+C含量較高,或直接用細(xì)胞做模板,,變性時間可適當(dāng)延長,。復(fù)性時間有30秒種一般是足夠的。延伸時間由擴(kuò)增產(chǎn)物的大小決定,,一般采用1kb用1分鐘來保證充足的時間,。


4.循環(huán)次數(shù)


循環(huán)次數(shù)主要與模板的起始數(shù)量有關(guān),在模板拷貝數(shù)為104~105數(shù)量級時,,循環(huán)數(shù)通常為25~35次,。


平臺效應(yīng)(plateaueffect):PCR擴(kuò)增過程后期會出現(xiàn)的產(chǎn)物的積累按減弱的指數(shù)速率增長的現(xiàn)象。原因:底物和引物的濃度已經(jīng)降低,,dNTP和DNA聚合酶的穩(wěn)定性或活性降低,,產(chǎn)生的焦磷酸會出現(xiàn)末端產(chǎn)物抑制作用,,非特異性產(chǎn)物或引物的二聚體出現(xiàn)非特異性競爭作用,擴(kuò)增產(chǎn)物自身復(fù)性,,高濃度擴(kuò)增產(chǎn)物變性不ce底,。


5.PCR反應(yīng)液的配制


PCR反應(yīng)體系的配置方式有時也會影響反應(yīng)的正常進(jìn)行。常規(guī)方法與其它酶學(xué)反應(yīng)一樣,,在最后加入DNA聚合酶,。早期的PCR儀沒有帶加熱的蓋子,要求在反應(yīng)液上覆蓋一層礦物油,,防止水分蒸發(fā),。


對于使用具3’-5’外切活性的高溫DNA聚合酶時,有時會擴(kuò)增不出產(chǎn)物,。在遇到這個問題時,,如果將反應(yīng)成分分開配制,A管含模板,、引物和dNTP,,以及調(diào)整體積的H2O,B管含緩沖液,、DNA聚合酶和水,,然后再將兩管溶液混合起來,可較好地克服這個問題,。


按照常規(guī)的方法配制反應(yīng)體系,,有時會出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增的問題。熱啟動(hotstart)PCR操作方式可較好解決這一問題,。將dNTP,、緩沖液,Mg2+和primer先配制好,,然后加入一粒蠟珠(如AmpliWaxPCRQam100),,加熱熔化,再冷卻,,使蠟將溶液封住,,最后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有當(dāng)PCR反應(yīng)進(jìn)入高溫階段后,,蠟層熔化,,所有反應(yīng)成分才會混合在一起。


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