技術(shù)文章
植物線粒體核酸提取試劑盒實驗原理
閱讀:361 發(fā)布時間:2021-12-18植物線粒體核酸提取試劑盒實驗原理
Plant Mitochondrial DNA Extraction Kit
上海雅吉生物科技有限公司
線粒體 DNA 提取的關(guān)鍵是盡可能的去掉核 DNA,。本試劑盒利用差速離心得到比較純凈的線粒體,,再利用 DNA 酶消化和裂解緩沖系統(tǒng)等多步驟去掉核 DNA,,最后得到純凈的線粒體 DNA,??捎糜?PCR 等對純度要求較高的實驗,。
本試劑盒用于從植物葉片中分離出完整而純化的線粒體,。適合于田間采摘或者實驗室培養(yǎng)的植物葉片中線粒體 DNA 的提取制備。
試劑存儲
本試劑盒整體保存于 2-8℃一年,,Dnase I -20℃保存,。使用前,在 DNase I 中加入 600ul(50T)或者 1200ul(100T)的DNA 酶反應液,,分裝后-20℃保存三個月,,如果超過三個月,活性可能會降低,,請自行訂購 DNASE I,。線粒體裂解液使用前常溫保存,如有沉淀可 37℃水浴溶解,,不影響使用,。
植物線粒體核酸提取試劑盒實驗原理使用參考
準備工作: :在 Dnase I 中加入 600ul(50T)或者 1100ul(100T)的 DNA 酶反應液,適當分裝后-20℃保存,。線粒體裂解液保存于常溫,,如有沉淀 37℃水浴溶解,離心機溫度下降到 4℃(2-8℃),如無低溫離心機,,也可以常溫離心,,并將離心時間為 10min 的改為 5min,但最后所得 DNA 品質(zhì)及產(chǎn)量可能會有一定影響,。
1. 樣本采集前處理:無論田間自然生長還是實驗室組織培養(yǎng),,采摘前須避光生長 24-48 小時,以減少葉片組織中糖類及葉綠體含量,。取適量植物細胞裂解液,,加入 0.5% β-巰基乙醇,如 10ml 植物細胞裂解液加入 50ulβ-巰基乙醇,,混勻,,形成植物細胞裂解液/β-巰基乙醇溶液,此溶液可 2-8 度保存一個月,。
2. 葉片用蒸餾水清洗 2-3 次,,濾紙吸干,有條件請用液氮研磨葉片 1-2 克,,研磨完后,,取 800mg 左右研磨的葉片粉,加入1.5ml 預冷的植物細胞裂解液/β-巰基乙醇溶液,,混勻,。如果無條件(無液氮),請預冷研缽,,取洗過的葉片 1000 mg,,用剪刀剪為碎塊放入玻璃勻漿器或者研缽中,。加入 1.5ml 預冷的植物細胞裂解液/β-巰基乙醇溶液,,冰上研磨至看不見明顯組織塊;
3. 將研磨物放置合適的離心管,,4℃,,1000× g 離心 5 min;
4. 將上清轉(zhuǎn)移到一新的離心管中,,在沉淀中加入 0.5ml 植物細胞裂解液/β-巰基乙醇溶液,,混勻,再次 4℃,,1000× g 離心5 min,,取上清;合并兩次上清,,將上清 4℃ 1000× g 再次離心 5 min,。
5.取上清,加入一新的離心管中,,4℃,, 16,000 × g 離心 10 min,。離心后的上清含胞漿成分,可從中提取胞漿蛋白,。將上清轉(zhuǎn)移到新離心管,,線粒體沉淀在管底。
6. 在線粒體沉淀中加入 0.5 mL 線粒體清洗液重懸線粒體沉淀,,4℃,,1000× g 離心 5 min;
7.取上清,,加入一新的離心管中,,4℃, 16,000 × g 離心 10 min,。棄上清,,高純度的線粒體沉淀在管底;
8. 加入 100ul DNA 酶反應液重懸線粒體,,吹打均勻后,,再加入 10ul DNASE I 溶液(見準備工作),混勻,,37℃水浴 10min,。此步為消化線粒體表面吸付的核 DNA。4℃,, 12,000 × g 離心 5 min,。盡可能的棄上清,再加入 200ul TE 重懸線粒體沉淀,,4℃,,12,000 × g 離心 5 min,洗去殘留的 DNA 酶,。
9.得到的沉淀,,用 200ul TE 緩沖液重懸線粒體沉淀,加入 10ul RNase A,。加入 200ul 線粒體裂解液,,輕輕混勻(不可吹打),放置 1-2min,,再加入 150ul 蛋白沉淀液,,迅速混勻。4℃,, 12,000 × g 離心 5 min,。此步驟可進一步去除核 DNA。
10.取上清,加入一新的離心管中(如用于酶切分析,,可加入此步:選用等體積的酚氯仿異戊醇 25:24:1 抽提一次,,再用氯仿抽提一次,或者直接用氯仿抽提兩次,,一般來說,,此步可去掉一些微量蛋白及糖類,但會造成線粒體 DNA 的損失,,因而用于 PCR 時可省,,并不影響后續(xù)實驗),加入 0.6 倍體積的異丙醇(如無異丙醇,,可加入 2.5 倍體積的乙醇沉淀 DNA,,如離心管太滿可分兩管)及 5-10ul 核酸核酸助沉劑,混勻,,-20℃沉淀半小時左右(此步可?。?/span>4℃,, 12,000 × g 離心 10 min,。
11. 棄上清,再加入 1ml 70%乙醇清洗,,4℃,, 12,000 × g 離心 5min。重復用 70%乙醇洗一次,。
12. 棄上清,,再次離心 1min 吸棄上清,不要碰到管底,,開蓋涼干約 5-10min,。
13.加入 20-30ul TE 緩沖液,輕彈管底,37℃水浴 5 分鐘,,線粒體 DNA 溶解,。
14. 進行 DNA 電泳檢測及-20℃保存,,進行下步的實驗,。(由于部分植物線粒體本身 DNA 含量很低,可以富集多個樣本合并濃縮或進行 PCR 檢測)
植物線粒體核酸提取試劑盒實驗原理注意事項
1. 以離心力 g 計算正確的離心速度,,不同的離心機可據(jù)此精確計算離心速度,。
2. 進行 Western Blot 和 2D-膠電泳,可直接在第 7 步的沉淀中加入上樣緩沖液裂解線粒體,。
3. β-巰基乙醇有毒,,請注意通風及防護
附:一般低溫度心機都有離心力顯示,如果沒有,可以用以下公式簡單的換算,。
轉(zhuǎn)速與離心力換算
G=1.11×(10 -5 )×R×[rpm] 2
G 為離心力,,一般以 g(重力加速度)的倍數(shù)來表示;
[rpm]2 即:轉(zhuǎn)速的平方,; R 為半徑,,單位為厘米。
植物線粒體核酸提取試劑盒實驗原理