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技術(shù)文章

蜱傳腦炎病毒染料法RT-PCR試劑盒

閱讀:272          發(fā)布時間:2019-9-24

 

產(chǎn)品及特點

蜱傳腦炎病毒(Tick-borne Encephalitis Virus,,TBEV)是一種RNA病毒,,傳播,在春夏季節(jié)流行于俄羅斯及我國東北森林地帶,,非疫區(qū)易感人被帶有病毒的蜱叮咬后,,易感染發(fā)病,另外因喝生羊奶(羊感染時奶中有病毒或被蜱類污染)而被傳染,,約經(jīng)8~14天潛伏期后發(fā)生腦炎,,出現(xiàn)肌肉麻痹、萎縮,、昏迷致死,,少數(shù)*者也常肌肉麻痹。居住在森林疫區(qū)的發(fā)生腦炎,,出現(xiàn)肌肉麻痹,、萎縮、昏迷致死,,少數(shù)*者也常肌肉麻痹,,因此快速準(zhǔn)確鑒定對該病的預(yù)防和檢疫有著重要作用。本產(chǎn)品基于PCR原理開發(fā),。它具有下列特點:

  • 一站式,,用于不需要單獨準(zhǔn)備每種成分,包括引物和對照,。
  • 根據(jù)蜱傳腦炎病毒的保守基因序列設(shè)計的引物,,具有良好的特異性。
  • 基于染料法qRT-PCR檢測,,靈敏度比常規(guī)RT-PCR高10-100倍,,可以達到至少1000拷貝/反應(yīng)。
  • 使用一管式qRT-PCR技術(shù),,RT和PCR兩步在一個試管內(nèi)完成不需要中間轉(zhuǎn)移樣品,,降低了操作誤差和可能的污染,。
  • 產(chǎn)品足夠50次30μL體系的RT-PCR只能用于科研,,不能用于臨床,。

 

規(guī)格及成分

成  份

編號

十孔包裝

2×qRT-PCR 緩沖液

190101a

500 μL(棕色管)

10×qRT-PCR酶混合液

190101b

100 μL(紅蓋)

 ROX染料I

190101c

50 μL(棕色管)

ROX染料II

190101d

50 μL(棕色管)

熒光PCR模板稀釋液

180701

1mL(亮黃蓋)

蜱傳腦炎病毒RT-PCR引物混合液

14-19500yw

100 μL(白蓋)

蜱傳腦炎病毒RT-PCR陽性對照

(1×10E8拷貝/μL

14-19500pc

50 μL(黃蓋)

天凈沙核酸釋放劑試用裝

61202

20次(1mL,綠蓋)

使用手冊

14-19500sc

1份

 

 

運輸及保存

低溫運輸,-20℃保存,,保存期限為12個月,。陽性對照需要因易污染其他成分需要單獨放置。本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,,只提供RNA段作為陽性對照,。

 

自備試劑

樣品RNA

 

使用方法

一、稀釋陽性對照(以10E2-10E7這6個10倍稀釋度為例,。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,。

  • 標(biāo)記6個離心管,,分別為7,6,,5,,4,3,,2,。用帶芯槍頭分別加入45 μL 熒光PCR模板稀釋液,用帶芯槍頭,,下同),。
  • 7號管中加入5 μL 10E8拷貝/μL 的陽性對照(本試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,,得10E7拷貝/μL的陽性對照,。放冰上待用。
  • 換槍頭,,在6號管中加入5 μL 10E7拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),,充分震蕩1分鐘,得10E6拷貝/μL的陽性對照,。放冰上待用,。
  • 換槍頭,在5號管中加入5 μL 10E6拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),,充分震蕩1分鐘,,得10E5拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用,。重復(fù)上面的操作直到得到6個稀釋度的陽性對照,。放冰上待用。

二,、樣品RNA的制備

  • 如果有N個樣品,,必須設(shè)置N+2個提取,,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照)一個是NC樣品制備陰性對照),??梢杂?0μL上步制備陽性對照梯度稀釋液中的4濃度為1×10E4拷貝/μL,10μL相當(dāng)于1萬拷貝加上一定量的水作為制備的陽性對照(加水后其總體積跟樣品一樣,,樣品體積多少取決于所用試劑盒的要求),。可以用水作為制備的陰性對照,。
  • 用自選方法純化N+2樣品的RNA,,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒RNA提取試劑盒兼容。本試劑盒免費贈20次免RNA提取的天凈沙核酸釋放劑試用裝,,

三,、設(shè)置RT-PCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進行

  • 如果做定量分析并且只做1次重復(fù),,則標(biāo)記N+9個PCR管,,其中N+2個于上步得到的N+2個樣品1個用于PCR陰性對照,,6個用標(biāo)準(zhǔn)曲線,。如果做定性分析,并且只做1次重復(fù),,則標(biāo)記N+4個PCR管,,其中N+2個于上步得到的N+2個樣品1個用于PCR陰性對照(用水做模板),,1個用于PCR性對照(用第4號陽性對照稀釋液做模板),。下面只描述定量分析的步驟,定性分析只是把6個標(biāo)曲反應(yīng)縮減成1個,,其余不變,。
  • 標(biāo)記管中下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,,陽性對照樣品要等所有管子蓋子后后加):

成分

N+2制備所得樣品

RT-PCR陰性對照

RT-PCR陽性

對照(2-7管)

2×qRT-PCR 緩沖液

10μL

10μL

各10μL

口蹄疫RT-PCR

引物混合物

2μL

2μL

2μL

50×ROX (見注)

0.4μL

0.4μL

各0.4μL

 樣品制備所得RNA模板(來于8

5.6μL

不加

不加

稀釋所得6個陽性對照(來于第6步)

不加

不加

5.6μL(2號樣到2號管,,3號樣到3號管

10×qRT-PCR

酶混合液

2μL

2μL

2μL

注:需使用ROX染料I的機型:ABI Prism7000、7300,、7700,、7900HT、Step-One,、Step-One Plus,。

需使用ROX染料II的機型::ABI Prism 7500、7500Fast,、MJ Research的Chromo4Opticon(II)Corbett Rotor Gene 3000

需要使用ROX的機型:Thermal Cycle Dice Real Time System,, LightCycler,、Smart Cycler SystemAgilent Mx3000P,、RotorGene 3000,、RotorGene 6000。

  • 上機后按下面參數(shù)進行RT-PCR(參數(shù)可能會因儀器不同而需優(yōu)化),。

過程

溫度

時間

RT逆轉(zhuǎn)錄

50℃

15-30分鐘

預(yù)變性

94℃

2分鐘

RT - PCR反應(yīng)

30個循環(huán))

95℃

15 秒

60

15 秒(采集FAM通道的熒光信號

72

15 秒

儀器預(yù)設(shè)程序進行溶解曲線分析

  • 數(shù)據(jù)處理
  • 如果把本試劑盒用于定量檢測,,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,。再以待測樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品RNA濃度的log值,推算出其濃度,。
  • 如果把本試劑盒用于定性檢測,,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40,。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,,有典型擴增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于30,。對待測樣品,,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性,。如果在35-40之間,,則重復(fù)一次。重復(fù)實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,,如果小于40,,則為陽性。

 

關(guān)聯(lián)產(chǎn)品

蜱傳腦炎病毒可視化RT-LAMP檢測試劑盒

 

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