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技術(shù)文章

馬隱秘桿菌染料法熒光定量PCR試劑盒說明書

閱讀:256          發(fā)布時間:2019-8-15

馬隱秘桿菌染料法熒光定量PCR試劑盒

 

中英文名稱

規(guī)格

價格

說明書

Arcanobacterium equi

馬隱秘桿菌染料法熒光定量PCR試劑盒

50

2490

 

運(yùn)輸:低溫

保存:負(fù)20

有效期:一年

貨期:2-3

產(chǎn)品及特點(diǎn)

1. 即開即用,,用戶只需要提供馬隱秘桿菌樣品,。

2. 根據(jù)馬隱秘桿菌染料法熒光定量保守序列設(shè)計(jì)的專一性引物,與相關(guān)病毒無交叉反應(yīng),。

3. 靈敏度可以達(dá)到幾百拷貝/反應(yīng),。

4. 一管式熒光定量PCR檢測,避免后續(xù)污染,。

5. 本試劑盒足夠50次20μL反應(yīng)體系的熒光定量PCR,。

本產(chǎn)品只適用于科研,不能用于臨床診斷,。

規(guī)格及成分

成分

編號

十孔盒包裝

2×qPCR MagicMix

試劑一

500μL(棕色管)

熒光PCR模板稀釋液

試劑二

1 mL(黃蓋)

馬隱秘桿菌染料法熒光定量PCR引物混合物

試劑三

100μL(白蓋)

馬隱秘桿菌染料法熒光定量PCR陽性對照

(1×10E8 拷貝/μL)

試劑四

50μL(紅蓋)

使用手冊

試劑五

1

運(yùn)輸及保存

低溫運(yùn)輸,,-20℃保存,保存期限一年,。

自備試劑 

DNA模板,、10×ROX(根據(jù)機(jī)型決定,具體見使用方法),。

使用方法

,、稀釋PCR陽性對照(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)

1. 注意:由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分),。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供可以直接使用的DNA片段作為陽性對照,。

2. 標(biāo)記6個離心管,,分別為7,6,,5,,4,3,,2,。

3. 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR模板稀釋液(用帶芯槍頭,下同),。

4. 在7號管中加入5 μL 1×10E8拷貝/μL 的陽性對照,,充分震蕩1分鐘,得1×10E7拷貝/μL的陽性對照,。放冰上待用,。

5. 換槍頭,在6號管中加入5 μL 1×10E7拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),,充分震蕩1分鐘,,得1×10E6拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用,。

6. 換槍頭,,在5號管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL的陽性對照到5號管中,充分震蕩1分鐘,,得1×10E5拷貝/μL的陽性對照,。放冰上待用。

7. 重復(fù)上面的操作直到得到6個稀釋度的陽性對照,。放冰上待用,。

二、樣品DNA的制備

8. 如果有N個樣品,,必須設(shè)置N+2個提取,,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是NC(樣品制備陰性對照),。可以用10μL上步制備的PCR陽性對照的第4號(濃度為1×10E4 拷貝/μL,,10μL相當(dāng)于1萬拷貝)或第5號(濃度為1×10E5 拷貝/μL,,10μL相當(dāng)于10萬拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC,。另外用水作為NC,。如果每次制備需要200μL樣品,,則PC和NC的體積也必須是200μL。

9. 用自選方法純化樣品的DNA,,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容,。

三、設(shè)置qPCR反應(yīng)(20 μL體系,,在樣品制備室進(jìn)行)

10. 如果只做1次重復(fù),,則標(biāo)記N+9個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,,1個用于PCR陰性對照,,6個用于PCR陽性對照。如果做2-3次重復(fù),,則反應(yīng)設(shè)置數(shù)量相應(yīng)增加2或3倍,。

11. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后加):

成分

樣品管

N+2

PCR陰性對照管

PCR陽性

對照管(2-7管)

2×qPCR MagicMix

(棕色管)

10 μL

10 μL

各10 μL

馬隱秘桿菌染料法熒光定量PCR

引物混合液(白蓋)

2 μL

2 μL

各2 μL

自備10×ROX (見注)

2 μL

2 μL

各2 μL

 N+2待測樣品DNA模板

6 μL

不加

不加

第7步所得PCR陽性對照

稀釋液(2-7號)

不加

不加

各6μL(2號樣到2號管,,3號樣到3號管…)

注:僅ABI7500、7700和7900儀器需要使用ROX作為對照,,其他熒光PCR儀器(如iCycler IQ,、MJ Option、MJ Chromo4,、MX3000,、MX4000、RotorGene 3000,、RotorGene 6000和LightCycler480)不需要使用ROX,,則用水替代。

12. 蓋上蓋子后上機(jī),,按下面參數(shù)進(jìn)行PCR(具體PCR參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化),。

過程

溫度

時間

預(yù)變性

92℃

5分鐘

PCR反應(yīng)

(30個循環(huán))

92℃

60 

54℃

60 

72℃

60 

13. 數(shù)據(jù)采集

具體操作按所用儀器推薦的流程進(jìn)行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合DNA時,,大吸收光譜在471 nm,,結(jié)合DNA時的大吸收光譜在500 nm,大發(fā)射光譜在530 nm,。信號采集可以設(shè)置在復(fù)性或延伸步驟,。 

四、數(shù)據(jù)處理

14. 如果把本試劑盒用于定量檢測,,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,。再以待測樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,,再推算出其濃度,。

如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,,則陰性對照Ct必須大于或等于40,。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴(kuò)增曲線,,Ct值應(yīng)該小于或等于30,。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,,如果小于或等于35則為陽性,。如果在35-40之間,則重復(fù)一次,。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的Ct值如果大于或等于40則為陰性,,如果小于40,則為陽性,。

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