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細(xì)菌總蛋白和膜蛋白提取方法
閱讀：575 發(fā)布時(shí)間：2018-7-13實(shí)驗(yàn)試劑
裂解液（pH 8.5-9.0）：50 mM Tris-HCl,，2 mM EDTA, 100 mM NaCl，0.5% Triton X-100，調(diào)pH值至8.5-9.0備用,；
溶菌酶；蛋白酶抑制劑PMSF,；1% SDS溶液,；Trizol裂解液；無水乙醇,；異丙醇,；0.3M鹽酸胍；
疏水性蛋白提取液（非裂解液）：1% Triton X-114,，150mM NaCl, 10mM Tris-HCl,，1mM EDTA，調(diào)pH值至8.0備用,。
實(shí)驗(yàn)設(shè)備
高速離心機(jī),；超聲儀；透析袋,；EP管；渦旋儀,；水浴鍋等,。
實(shí)驗(yàn)步驟
1. 從新鮮樣品中提取總蛋白（簡(jiǎn)易法）
1) 自配裂解液（pH 8.5-9.0）：50 mM Tris-HCl，2 mM EDTA, 100 mM NaCl,，0.5% Triton X-100,，調(diào)pH值至8.5-9.0備用；用前加入100 μg/ml 溶菌酶,，1μl/ml 的蛋白酶抑制劑PMSF,。該裂解液用量為10-50ml 裂解液/1g濕菌體。
2) 將40ml 菌液在12000g,，4℃下離心15分鐘收集菌體,，沉淀用PBS懸浮洗滌2遍，沉淀加入1ml裂解液懸浮菌體,。
3) 超聲粉碎,，采用300w，10s超聲/10s間隔,，超聲20min,，反復(fù)凍融超聲3次至菌液變清或者變色。
4) 1000g離心去掉大碎片,，上清可直接變性后PAGE電泳檢測(cè)，或者用1% SDS溶液透析后凍存。
缺點(diǎn)：Western blotting結(jié)果表明,，疏水性跨膜蛋白提取效率有限。
2. 從Trizol裂解液中分離總蛋白
1) Trizol溶解的樣品研磨破碎后,，加分層，2-8℃下10000g離心15min,，上層水相用于RNA提取,，體積約為總體積的60%。
2) 用乙醇沉淀中間層和有機(jī)相中的DNA,。每使用1ml Trizol加入0.3ml無水乙醇混勻,，室溫放置3min，2-8℃不超過2000g離心5min,。
3) 將上清移至新的EP管中,，用異丙醇沉淀蛋白質(zhì)。每使用1ml Trizol加入1.5ml異丙醇,，室溫放置10min,，2-8℃下12000g離心10min，棄上清,。
4) 用含有0.3M鹽酸胍的95%乙醇洗滌,。每1ml Trizol加入2ml洗液，室溫放置20min,， 2-8℃下7500g離心5min,，棄上清，重復(fù)洗滌2次,。后加入2ml無水乙醇,，渦旋后室溫放置20min，2-8℃下7500g離心5min,，棄上清,。
5) 冷凍干燥5-10min，1%SDS溶液溶解,，反復(fù)吹打,，50℃溫浴使其*溶解，2-8℃下10000g離心10min去除不溶物,。
6) 替代方案：將3中的酚醇上清液移至小分子量透析袋中,，在2-8℃的1% SDS溶液中透析3次，1000g離心10min去除沉淀,，上清可直接用于蛋白實(shí)驗(yàn),。
3. 從新鮮樣品中提取疏水性膜蛋白（Triton X-114去污劑法）
1) 配制疏水性蛋白提取液（非裂解液）：1% Triton X-114，150mM NaCl, 10mM Tris-HCl,，1mM EDTA,，調(diào)pH值至8.0備用。
2) 菌液于4℃條件下15000g離心15min收集菌體；用1ml 含有5mM MgCl2 的PBS洗滌3次,，后于4℃條件下15000g離心15min收集菌體,。
3) 菌體沉淀加入1ml冷提取液，于4℃條件下放置2h,，17000g離心10min,，去除沉淀取上清。
4) 將上述上清中的Triton X-114含量增加到2%,，再加入20mM的CaCl2抑制部分蛋白酶活性,，37℃條件下放置10min使其分層。室溫下1000g離心10min使液相和去污相充分分層,。
5) 將液相和去污相分開,，分別用10倍體積的冷丙酮在冰上沉淀45min。
6) 于4℃條件下17000g離心30min,，用去離子水洗滌沉淀3次,。
7) 將沉淀溶解在1% SDS溶液中，測(cè)定蛋白濃度,，比較液相和去污相中蛋白提取效率,，一般是去污相中疏水性膜蛋白較多，適于進(jìn)一步蛋白實(shí)驗(yàn),。
8) SDS-PAGE進(jìn)一步分析液相和去污相的蛋白圖譜,。