CUT＆RUN技術(shù)提供了一種檢測細(xì)胞中蛋白-DNA相互作用的快速、可靠且真正的低細(xì)胞數(shù)測定法,。與ChIP實(shí)驗(yàn)不同，CUT＆RUN不存在甲醛交聯(lián),、染色質(zhì)碎裂和免疫沉淀,，使之成為一種使蛋白-DNA相互作用富集和檢測靶基因的更快且更有效的方法。

CUT＆RUN可在一天之內(nèi)完成從活細(xì)胞到純化DNA的過程，且經(jīng)證明每次檢測只需使用少至500-1000個(gè)細(xì)胞,。和ChIP中碎裂所有細(xì)胞染色質(zhì)不同，CUT＆RUN利用一種染色質(zhì)抗體靶向消化方法,，從而使背景信號比ChIP實(shí)驗(yàn)低得多。

因此CUT＆RUN僅需ChIP-seq檢測所需測序深度的1/10.zui后，加入簡單的Spike-in DNA即可準(zhǔn)確定量和標(biāo)準(zhǔn)化靶標(biāo)蛋白結(jié)合,，而這是ChIP方法無法實(shí)現(xiàn)的，這種方法可有效標(biāo)準(zhǔn)化樣品間和實(shí)驗(yàn)間的信號,。

艾美捷 EpiGentek EpiNext CUT＆RUN快速套件,以優(yōu)惠價(jià)格從低輸入提供無超聲破碎,，以可靠地識別真正的目標(biāo)蛋白質(zhì)富集區(qū)域并實(shí)現(xiàn)高分辨率定位,。可滿足用戶快速富集蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用的圖譜的需求,。

EpiNext CUT＆RUN快速套件用于快速富集特定DNA,，并與來自低輸入細(xì)胞/染色質(zhì)的蛋白質(zhì)（組蛋白或轉(zhuǎn)錄因子），并在體內(nèi)識別或定位使用Illumina平臺或其他方法通過下一代測序進(jìn)行蛋白質(zhì)-DNA相互作用,，如作為qPCR,。創(chuàng)新的工作原理、優(yōu)化的協(xié)議和套件組件允許以zui小化的非特異性背景水平捕獲目標(biāo)蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物,。這個(gè)捕獲的DNA特別適合于構(gòu)建非條形碼（單復(fù)合）和條形碼（多路復(fù)用）文庫以較少的偏差和較高的速度映射目標(biāo)蛋白質(zhì)-DNA相互作用區(qū)域高分辨率,。

圖：使用EpiNext™ 切斷并運(yùn)行快速試劑盒，對照抗體捕獲組蛋白DNA復(fù)合物（H3K9me3）來自從Hela細(xì)胞分離的1 ug染色質(zhì),，用于DNA文庫制備,。290 bps左右的峰值反映了單核小體（150 bps）。