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初級(jí)會(huì)員 | 第6年

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CUT&RUN技術(shù)在功能性全基因組圖譜方面的重要應(yīng)用

時(shí)間:2021/10/20閱讀:253
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我們知道,,基因表達(dá)可以通過(guò)許多不同的機(jī)制進(jìn)行調(diào)節(jié),包括轉(zhuǎn)錄因子,、組蛋白和其他DNA結(jié)合蛋白,。繪制出DNA和蛋白質(zhì)之間的相互作用圖譜,對(duì)于理解基因激活或抑制以及其他細(xì)胞過(guò)程至關(guān)重要,。

 

傳統(tǒng)上,,可以通過(guò)進(jìn)行染色質(zhì)免疫沉淀和測(cè)序(ChIP-seq)來(lái)分析這些相互作用。但是這種方法需要大量的起始材料才能產(chǎn)生足夠強(qiáng)的信號(hào)以消除背景噪聲,,并且經(jīng)常返回假陽(yáng)性信號(hào),。同時(shí),ChIP-seq還需要優(yōu)化的超聲處理來(lái)破碎染色質(zhì),,這可能非常耗時(shí)并可能導(dǎo)致樣品損失,。

 

在zui近的一項(xiàng)研究中,佛羅里達(dá)大西洋大學(xué)和國(guó)家糖尿病,、消化和腎臟疾病研究所的科學(xué)家們利用CUT&RUN技術(shù)建立了一個(gè)功能性全基因組圖譜,,該圖譜是一種稱為缺氧誘導(dǎo)因子的蛋白質(zhì)復(fù)合物的特異性結(jié)合位點(diǎn)—HIF1α,位于人眼的晶狀體中,。該團(tuán)隊(duì)表示選擇CUT&RUN而不是ChIP-seq分析,,是因?yàn)榍罢卟恍枰?span style="font-family: Calibri;">DNA-蛋白質(zhì)交聯(lián)。此外,,與ChIP-seq相比,,前者成功實(shí)驗(yàn)所需的細(xì)胞計(jì)數(shù)J低。

 

在該實(shí)驗(yàn)中,,CUT&RUN技術(shù)得以成功的應(yīng)用,,有助于接下來(lái)的大量研究,重點(diǎn)是了解某些蛋白質(zhì)可能對(duì)基因表達(dá)的作用,。

 

艾美捷 EpiGentek EpiNext CUT&RUN快速套件,以優(yōu)惠價(jià)格從低輸入提供無(wú)超聲破碎,,以可靠地識(shí)別真正的目標(biāo)蛋白質(zhì)富集區(qū)域并實(shí)現(xiàn)高分辨率定位??蓾M足用戶快速富集蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用的圖譜的需求,。

 

EpiNext CUT&RUN快速套件 結(jié)果展示:

 

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