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初級(jí)會(huì)員 | 第6年

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今天我們就來(lái)聊聊活細(xì)胞的DNA染色~

時(shí)間:2019/4/30閱讀:4241
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目前,,在活細(xì)胞的DNA染色中,有兩組染料,。組是Hoechst系列,,它們具有細(xì)胞滲透性和熒光性(即低熒光直到結(jié)合靶DNA),但由于340-360nm范圍內(nèi)短紫外-藍(lán)色波長(zhǎng)激發(fā)的要求,,它們具有相當(dāng)?shù)?/span>毒性,。

第二組活細(xì)胞染料由遠(yuǎn)紅外染料組成,如SiR-DNA™,、Syto61™,、Draq5™或Vybrant®Dyecycle™Ruby,。這些染料克服了前一組光譜范圍的限制,,允許使用波長(zhǎng)約為650nm、發(fā)射波長(zhǎng)約為700nm的低能激發(fā)光,。這種光具有小的光毒性(SiR-Tubulin™和SiR-Actin™)并且細(xì)胞或組織樣品在該光譜范圍內(nèi)不吸收光也不自發(fā)熒光,,這使得在厚樣本中有更深處成像成為可能。 

SiR-DNA™(SiR–Hoechst)是基于熒光團(tuán)硅羅丹明(SiR)和DNA小槽粘合劑雙苯甲酰亞胺(Hoechst)組合而成,,它比遠(yuǎn)紅外染料組其他染料更具優(yōu)勢(shì),。

SiR–Hoechst(SiR-DNA™) 和其他遠(yuǎn)紅外DNA染料長(zhǎng)時(shí)間活細(xì)胞成像對(duì)比圖,顯示SiR–Hoechst的低毒性及熒光穩(wěn)定性

市面上幾種常見DNA染料對(duì)比 

特性
 

SiR-DNA™
 

其他遠(yuǎn)紅外染料
Syto61™,、Draq5™或Vybrant®Dyecycle™
 

短波長(zhǎng)染料

Hoechst™

DAPI,、EB

 細(xì)胞毒性

8小時(shí)內(nèi)持續(xù)使用對(duì)細(xì)胞無(wú)影響

廠家建議使用的濃度下對(duì)細(xì)胞顯示出強(qiáng)烈的毒性作用(細(xì)胞停止分裂或死亡)

適用于活細(xì)胞,但細(xì)胞毒性高,

不適于活細(xì)胞,,且EB致使細(xì)胞突變

細(xì)胞滲透性

有細(xì)胞滲透性

有細(xì)胞滲透性

有細(xì)胞滲透性

無(wú)細(xì)胞滲透性

特異性

針對(duì)于活細(xì)胞DNA,,特異性非常好

Syto61™、Draq5™或Vybrant®Dyecycle™染料在活細(xì)胞的DNA以外的其他結(jié)構(gòu)上產(chǎn)生強(qiáng)烈的非特異性信號(hào)

很高的吸收率和自發(fā)熒光,,背景較高

超分辨率顯微鏡兼容性

在多次暴露于激發(fā)光下信號(hào)仍然很強(qiáng)

Syto61與超分辨顯微鏡兼容,,但其高背景熒光和細(xì)胞毒性

不適合超分辨率分析

注:SiR-DNA™是Spirochrome SA公司的商標(biāo) (瑞士)

Vybrant® DyeCycle™ Ruby stain 和Syto61™是美國(guó)Thermo Fisher Scientific公司的商標(biāo)

DRAQ5™是Biostatus公司商標(biāo)

Hoechst™是美國(guó)Sanofi公司商標(biāo)

 

SiR-DNA™的主要發(fā)展方向是將熒光特性高DNA特異性,、低毒性遠(yuǎn)紅外激發(fā)/發(fā)射范圍相結(jié)合,。此外,由于其穩(wěn)定性和對(duì)遠(yuǎn)紅光的特性,,探針在超分辨顯微鏡(STDE和SIM)中表現(xiàn)非常好,。因此,SiR-DNA™是一種優(yōu)良的探針,,其性能與SiR-tubulin和SiR-actin一樣,。

在顯微鏡觀察和高通量篩選過(guò)程中,SiR-DNA™可以在不受紫外線刺激的情況下進(jìn)行簡(jiǎn)單的核復(fù)染,。在流式細(xì)胞術(shù)過(guò)程中,,SiR-DNA™可以直接用于血液/BM的表型分析和細(xì)胞DNA含量分析,而無(wú)需紅細(xì)胞溶解或固定,、滲透或RNase處理等步驟,。 

說(shuō)了這么多,您有沒(méi)有對(duì)SiR-DNA™活細(xì)胞染料很心動(dòng)了,?作為專業(yè)的生命科學(xué)解決方案供應(yīng)商,,艾美捷科技為您推薦的活細(xì)胞DNA染色試劑盒: 

產(chǎn)品名稱

Ex/Em

濾光鏡

貨號(hào)

SiR-DNA Kit

652/672nm

標(biāo)準(zhǔn)Cy5設(shè)置

 CY-SC007

* 試劑盒均內(nèi)含Verapamil(維拉帕米,戊脈安),,一種廣譜的外排泵抑制劑,。

廠家質(zhì)檢:

常見問(wèn)題整理:

是否兼容固定細(xì)胞?

SiR-DNA™可以與甲醇或PFA固定的細(xì)胞一起使用,。然而,,介質(zhì)對(duì)SiR-DNA™的亮度有很大的影響。當(dāng)混有PBS或Vectashield®的細(xì)胞產(chǎn)生很低的信號(hào),,混合有純甘油的細(xì)胞會(huì)染出非常明亮的細(xì)胞核,。因此,我們建議在用SiR-DNA™染色固定細(xì)胞時(shí)使用純甘油作為介質(zhì),。

哪些物種的樣本和組織能被SiR探針染色,?

下方僅引述已報(bào)告起作用的細(xì)胞系、組織或生物體,。

智人:U2OS,,成纖維細(xì)胞,,HeLa,HUVEC, MCF-10A, HCT-116, A549,紅細(xì)胞

肌肉:C2C12,,IA32,,骨骼肌,原代心肌細(xì)胞,,原代卵母細(xì)胞

褐家鼠:初級(jí)海馬神經(jīng)元,、初級(jí)皮質(zhì)神經(jīng)元、NRK

風(fēng)信子:COS-7

金鯽:BHK

黑腹果蠅:Notum上皮,,S2

迪德爾菲斯有袋動(dòng)物:OK細(xì)胞

為什么SiR探針的背景比其他熒光團(tuán)低,?

SiR探針使用的是近紅外/遠(yuǎn)紅外光譜范圍內(nèi)的激發(fā)光,從而避免較短波長(zhǎng)的光產(chǎn)生自發(fā)熒光,,從而避免產(chǎn)生較高的背景,。SiR耦合探針具有兩種物理狀態(tài):①非熒光,關(guān)閉狀態(tài)(spirolactone)和②高熒光,,開啟狀態(tài)(zwitterion),。探針與其配體目標(biāo)的結(jié)合有利于高熒光的開放狀態(tài),而未結(jié)合探針則存在于封閉,、非熒光狀態(tài)(下圖),。從未結(jié)合態(tài)到結(jié)合態(tài)熒光放大率增加100倍。這就產(chǎn)生了一種高度敏感的生物傳感器,,其中大部分熒光只發(fā)生在結(jié)合態(tài),。

SiR衍生物在熒光(開放)型(左結(jié)構(gòu))和非熒光(封閉)型(右結(jié)構(gòu))之間存在平衡

Nature Communication專屬產(chǎn)品文章精彩了解:

G. Lukinavicius et al.,SiR–Hoechst is a far-red DNA stain for live-cell nanoscopy, Nat. Commun. 6:8497 doi: 10.1038/ncomms9497 (2015).

不同類型細(xì)胞DNA成像圖,4μm SiR–Hoechst

SiR-Hoechst染色HeLa細(xì)胞的共聚焦(confocal)和電鏡(STED)對(duì)比

SiR-Hoechst染色HeLa細(xì)胞的共聚焦(confocal)和電鏡(STED)對(duì)比

Cytoskeleton公司成立于1993年,,專注于生物化學(xué)和細(xì)胞過(guò)程研究中的純化蛋白和便捷試劑盒開發(fā)與生產(chǎn),。公司提供藥物篩選、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄后修飾(PTM),、細(xì)胞骨架研究相關(guān)的系列試劑盒和產(chǎn)品,尤其以細(xì)胞骨架相關(guān)研究見長(zhǎng),,既能滿足于樣品較少的科學(xué)研究,,也可以用于小規(guī)模篩選研究和高通量大規(guī)模篩選研究。

目前主要的產(chǎn)品有340余種,,其產(chǎn)品主要覆蓋肌動(dòng)蛋白,,微管蛋白,,馬達(dá)蛋白,,小G蛋白,細(xì)胞外基質(zhì),,活細(xì)胞成像等相關(guān)領(lǐng)域,,提供對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì),,抗體,檢測(cè)與分析試劑盒,,并且產(chǎn)品線還在不斷的擴(kuò)大中,。此外,公司還提供微管蛋白,,肌動(dòng)蛋白,,小G蛋白,GAPs,,GEFs等現(xiàn)有產(chǎn)品的藥物篩選服務(wù),。

 

 

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