島津GC-MS被廣泛應(yīng)用于復(fù)雜組分的分離與鑒定，其具有GC的高分辨率和質(zhì)譜的高靈敏度,，是生物樣品中藥物與代謝物定性定量的有效工具,。
島津GC-MS主要由以下部分組成：色譜部分、氣質(zhì)接口,、質(zhì)譜儀部分
一,、色譜部分
色譜部分和一般的色譜儀基本相同，包括柱箱,、氣化室和載氣系統(tǒng),。除特殊需要，多數(shù)不再裝檢測器,，而是將MS作為檢測器。此外,，在色譜部分還帶有分流／不分流進樣系統(tǒng),，程序升溫系統(tǒng)，壓力,、流量自動控制系統(tǒng)等,。色譜部分的主要作用是分離，混合物樣品在合適的色譜條件下被分離成單個組分,，然后進入質(zhì)譜儀進行鑒定,。色譜儀是在常壓下工作，而質(zhì)譜儀需要高真空,，因此,，如果色譜儀使用填充柱，必須經(jīng)過一種接口裝置-分子分離器,，將色譜載氣去除,，使樣品氣進入質(zhì)譜儀。如果色譜儀使用毛細管柱,，因為毛細管中載氣流量比填充柱小得多,，不會破壞質(zhì)譜儀真空，可以將毛細管直接插入質(zhì)譜儀離子源,。
二,、氣質(zhì)接口
氣質(zhì)接口是GC到MS的連接部件,。常見的連接方式是直接連接法，毛細管色譜柱直接導(dǎo)入質(zhì)譜儀,，使用石墨墊圈密封,，接口必須加熱，防止分離的組分冷凝,，接口溫度設(shè)置一般為氣相色譜程序升溫較高值,。
三、質(zhì)譜儀部分
質(zhì)譜儀既是一種通用型的檢測器,，又是有選擇性的檢測器,。它是在離子源部分將樣品分子電離，形成離子和碎片離子,，再通過質(zhì)量分析器按照質(zhì)荷比的不同進行分離,，在檢測器部分產(chǎn)生信號，并放大,、記錄得到質(zhì)譜圖,。
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