案例一：基因表達分析

• 實驗背景：研究團隊欲通過 qRT - PCR 檢測某疾病相關基因在不同組織樣本中的表達差異,。

• 檢測結果：使用 Qubit RNA IQ Assay Kit 對提取的 RNA 樣本進行檢測,，發(fā)現(xiàn)部分樣本 RIN 值≥7,，濃度在 200 - 500 ng/μL 之間,，28S/18S 比值在 1.8 - 2.2 之間,；而另一部分樣本 RIN 值在 5 - 7 之間,，濃度較低,，約為 50 - 100 ng/μL,，28S/18S 比值略低于 1.8。

• 實驗設計調整：對于 RIN 值和濃度都較好的樣本,，可直接用于 qRT - PCR 實驗,，且可適當減少每個反應的 RNA 上樣量，以避免 RNA 過量導致的非特異性擴增,。對于 RIN 值在 5 - 7 之間的樣本,，由于其 RNA 有一定程度降解,，可能影響定量準確性，研究團隊決定增加每個反應的 RNA 上樣量,，并設置多個復孔,，以提高檢測的可靠性。同時,，在數據分析時,，對這些樣本的數據進行更謹慎的處理和驗證。

案例二：轉錄組測序

• 實驗背景：科研人員計劃對某種植物在不同生長階段的轉錄組進行測序,，以了解其基因表達的動態(tài)變化,。

• 檢測結果：Qubit RNA IQ Assay Kit 檢測顯示，大部分樣本 RIN 值＞8,，濃度在 300 - 800 ng/μL 之間,，28S/18S 比值接近 2.0，但有少數樣本 RIN 值為 6 - 7,，濃度也相對較低,，約為 100 - 200 ng/μL。

• 實驗設計調整：對于高質量的樣本,，按照標準的轉錄組測序文庫構建流程進行操作,。而對于 RIN 值為 6 - 7 的樣本，考慮到轉錄組測序對 RNA 完整性要求較高,，研究人員首先嘗試優(yōu)化 RNA 提取方法,，重新提取這些樣本的 RNA，若再次檢測結果仍不理想,，他們決定將這些樣本用于其他對 RNA 質量要求稍低的實驗,，如簡單的基因差異表達分析，而不用于轉錄組測序,，以免因 RNA 質量問題影響測序數據的質量和后續(xù)分析,。

案例三：microRNA 研究

• 實驗背景：某實驗室致力于研究 microRNA 在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用，需要從腫瘤組織和正常對照組織中提取 RNA,，進行 microRNA 的表達譜分析,。

• 檢測結果：Qubit RNA IQ Assay Kit 的檢測結果表明，所有樣本的 RIN 值都在 7 - 8 之間,，濃度在 150 - 400 ng/μL 之間,，但 28S/18S 比值在 1.6 - 1.8 之間，略低于理想范圍,。

• 實驗設計調整：由于 microRNA 相對較小且穩(wěn)定性較高,，對總 RNA 的完整性要求不像 mRNA 那樣嚴格。雖然 28S/18S 比值略低,，但 RIN 值表明 RNA 整體質量尚可,。因此,，研究人員在實驗設計中，適當增加了 RNA 的起始量,，以確保有足夠的 microRNA 用于后續(xù)的分離和檢測步驟,。同時,，在數據分析階段,，采用了一些專門針對 microRNA 表達譜分析的算法和質量控制措施，以減少可能因 RNA 質量問題帶來的誤差,。