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1. 技術(shù)優(yōu)勢(shì)與試劑盒組成
核心特性:
高效去內(nèi)毒素:采用硅膠膜吸附技術(shù)結(jié)合去內(nèi)毒素系統(tǒng),,內(nèi)毒素去除率>99%,,殘留量<0.1 EU/μg DNA,,符合細(xì)胞轉(zhuǎn)染及動(dòng)物實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn),;
超螺旋結(jié)構(gòu)保留:通過(guò)溫和裂解體系(P2緩沖液)與多步離心過(guò)濾(CS1過(guò)濾器),,超螺旋質(zhì)粒占比>85%,,顯著提升轉(zhuǎn)染效率;
高通量處理:?jiǎn)未慰商幚?00-200 mL菌液,,高拷貝質(zhì)粒得率達(dá)500-1500 μg,,低拷貝質(zhì)粒得率200-600 μg,,滿足大規(guī)模實(shí)驗(yàn)需求。
試劑盒組成:
裂解系統(tǒng):溶液P1(含RNase A),、溶液P2(裂解液),、溶液P4(中和液);
純化系統(tǒng):平衡液BL,、漂洗液PW(含無(wú)水乙醇),、無(wú)水乙醇、洗脫液TB,;
耗材:吸附柱CP6(50 mL離心管適配),、收集管、過(guò)濾器CS1,。
2. 適用范圍與兼容性
下游應(yīng)用:
常規(guī)實(shí)驗(yàn):酶切,、PCR、測(cè)序,、連接,、轉(zhuǎn)化;
實(shí)驗(yàn):基因治療載體構(gòu)建,、顯微注射,、RNA干擾、CRISPR-Cas9基因編輯,;
細(xì)胞實(shí)驗(yàn):適用于內(nèi)毒素敏感型細(xì)胞(如Huh7,、HEK293T)的轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染效率較普通質(zhì)粒提升30%-50%,。
質(zhì)粒兼容性:
拷貝數(shù):高拷貝質(zhì)粒(如pUC19)推薦菌液量100 mL,,低拷貝質(zhì)粒(如pBR322)推薦菌液量200 mL;
大小范圍:支持1-20 kb質(zhì)粒提取,,對(duì)于>10 kb大質(zhì)粒,,需增加菌液量及裂解液體積。
1. 基因治療載體構(gòu)建
實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì):
使用DP117提取慢病毒載體骨架質(zhì)粒(如pLVX-IRES-ZsGreen1),,菌液量200 mL;
定量檢測(cè)濃度(OD260)及純度(OD260/OD280=1.8-2.0),,瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證超螺旋結(jié)構(gòu),;
結(jié)合Lipofectamine 3000轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,48小時(shí)后熒光顯微鏡觀察轉(zhuǎn)染效率>80%,。
結(jié)果示例:
提取的質(zhì)粒濃度達(dá)1.2 μg/μL,,內(nèi)毒素含量0.05 EU/μg,顯著低于普通試劑盒(>1 EU/μg);
慢病毒滴度達(dá)1×10? TU/mL,,較含內(nèi)毒素質(zhì)粒提升40%,。
2. CRISPR-Cas9基因編輯
實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì):
提取sgRNA表達(dá)質(zhì)粒(如pX458),菌液量100 mL,;
通過(guò)DP117去除內(nèi)毒素,,避免非特異性免疫激活;
核轉(zhuǎn)染HeLa細(xì)胞,,72小時(shí)后T7E1酶切驗(yàn)證編輯效率>35%,。
結(jié)果示例:
提取的質(zhì)粒OD260/OD280=1.85,內(nèi)毒素未檢出,;
基因編輯效率較含內(nèi)毒素質(zhì)粒提升25%,,脫靶率降低15%。
3. 動(dòng)物體內(nèi)實(shí)驗(yàn)
實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì):
提取治療性基因表達(dá)質(zhì)粒(如pAAV-CMV-GFP),,菌液量200 mL;
通過(guò)DP117確保內(nèi)毒素<0.1 EU/μg,,避免小鼠注射后發(fā)熱反應(yīng),;
尾靜脈注射C57BL/6小鼠(50 μg/只),7天后肝臟組織GFP熒光強(qiáng)度較含內(nèi)毒素質(zhì)粒組提升60%,。
結(jié)果示例:
質(zhì)粒純度(OD260/OD280=1.92)及內(nèi)毒素水平符合FDA要求,;
動(dòng)物存活率100%,無(wú)炎癥反應(yīng),。
1. 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
試劑配制:
溶液P1:加入RNase A后混勻,4℃保存,;
漂洗液PW:按標(biāo)簽要求加入無(wú)水乙醇,;
洗脫液TB:65-70℃預(yù)熱以提高洗脫效率。
儀器校準(zhǔn):
離心機(jī):確保轉(zhuǎn)速誤差<2%(8000 rpm對(duì)應(yīng)8228×g),;
移液器:定期校準(zhǔn),,避免體積誤差。
2. 操作流程
菌體收集:
100-200 mL菌液8000 rpm離心3分鐘,,棄上清,;
菌體沉淀用吸水紙吸干殘留培養(yǎng)基。
裂解與中和:
加入8 mL溶液P1,,渦旋振蕩至菌體懸?。?/p>
加入8 mL溶液P2,,溫和翻轉(zhuǎn)6-8次,,室溫放置5分鐘;
加入8 mL溶液P4,,立即翻轉(zhuǎn)6-8次,,室溫放置10分鐘,。
過(guò)濾與純化:
裂解液8000 rpm離心5分鐘,上清倒入過(guò)濾器CS1,,緩慢推動(dòng)推柄過(guò)濾,;
濾液加入0.3倍體積異丙醇,分兩次過(guò)吸附柱CP6,;
依次加入10 mL漂洗液PW,、3 mL無(wú)水乙醇洗滌,8000 rpm離心2分鐘棄廢液,;
空柱8000 rpm離心5分鐘,,去除乙醇?xì)埩簟?/p>
洗脫與保存:
吸附柱置于新收集管,加入1-2 mL預(yù)熱洗脫液TB,,室溫放置5分鐘,;
8000 rpm離心2分鐘,收集質(zhì)粒溶液,,-20℃保存,。
3. 實(shí)驗(yàn)后處理
廢棄物處理:
含內(nèi)毒素的菌體沉淀及濾液按生物危害品處理;
染菌的耗材121℃高壓滅菌30分鐘,。
儀器維護(hù):
吸附柱CP6為一次性耗材,,禁止重復(fù)使用;
離心機(jī)轉(zhuǎn)子用70%乙醇擦拭,,避免腐蝕,。
Q1:提取的質(zhì)粒濃度低如何解決,?
A:
檢查菌液OD600值,,推薦高拷貝質(zhì)粒1.8-2.0,低拷貝質(zhì)粒2.0-2.5,;
確保菌體懸浮,,避免裂解不充分;
延長(zhǎng)洗脫時(shí)間至10分鐘,,或重復(fù)洗脫一次,。
Q2:內(nèi)毒素殘留超標(biāo)怎么辦?
A:
確認(rèn)溶液P4與CS1過(guò)濾器未過(guò)期,;
裂解液離心時(shí)間延長(zhǎng)至15分鐘,,確保內(nèi)毒素充分沉淀;
使用LAL法驗(yàn)證內(nèi)毒素水平,,必要時(shí)增加乙醇洗滌次數(shù),。
Q3:如何提高大質(zhì)粒(>10 kb)的得率?
A:
菌液量增加至300 mL,裂解液P1/P2/P4按比例增加至12 mL,;
洗脫液TB預(yù)熱至70℃,,洗脫體積增加至3 mL;
吸附后靜置10分鐘再離心,,增強(qiáng)結(jié)合效率,。
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