NuSmart®在FFPE(福爾馬林固定石蠟包埋)鑒定中應用
——無需脫蠟,、一片即結果
FFPE是"福爾馬林固定,、石蠟包埋"(Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded)的縮寫,,是一種常見的組織樣本保存方法,。在醫(yī)學研究和臨床診斷中,,F(xiàn)FPE可用于組織學檢查,、病理診斷和分子分析,。而FFPE在分子分析中的應用主要包括:
1、癌癥研究:FFPE樣本常用于癌癥基因組學研究,,包括突變分析,、拷貝數變異檢測等。
2,、基因表達分析:FFPE樣本中的RNA可用于基因表達分析,,了解疾病相關基因的表達模式。
3,、DNA甲基化分析:FFPE樣本可用于研究DNA甲基化狀態(tài),,探索與疾病相關的表觀遺傳學改變。
4,、miRNA分析:FFPE樣本中的miRNA可用于研究其在疾病發(fā)生發(fā)展中的作用,。
5、生物銀行和歷史樣本研究:利用存儲的歷史FFPE樣本進行生物標志物的發(fā)現(xiàn)和驗證研究,。
愿望是美好的,,現(xiàn)實是提取FFPE中DNA存在很多“痛處",例如
1,、DNA損傷和化學修飾:福爾馬林固定導致DNA發(fā)生化學修飾,,如堿基脫嘌呤、鏈間交聯(lián)等,。
2,、DNA片段化:FFPE樣本中的DNA通常已部分降解,形成較小的片段,,這可能影響某些需要較長DNA片段的實驗,。
3,、DNA與蛋白質的交聯(lián):DNA可能與組蛋白等蛋白質緊密交聯(lián),增加了提取和純化的難度,。
4,、樣品質量控制:組織脫水、固定延遲或時間過長等因素都會損害標本質量,。
5,、DNA提取效率:目前市場的FFPE提取試劑盒性能差異很大,提取時間和提取效率都有很大不同,。
6,、PCR抑制劑:FFPE樣本中可能存在PCR抑制劑,影響后續(xù)的PCR擴增反應,。
NuSmart®技術wan美解決以上痛點,,NuSmart®FFPE樣本PCR試劑盒提供了FFPE Buffer用于將切片中組織DNA釋放出來,高耐受力的2× FFPE Smart Mix能夠抑制常見干擾劑,??偨Y來看有以下特點:
—1-2片切片就有結果
—操作簡單,無需脫蠟
—操作便捷,,僅需要10分鐘
—僅需要加熱處理
—無需配備昂貴設備
操作流程
案例 不同組織切片擴增8對引物
1,、肝 2、肺 3,、胃
使用NuSmart®FFPE樣本PCR試劑盒(貨號Nu-FFPE0101)處理肝,、肺、胃三組切片,,使用2× FFPE Smart Mix擴8對引物,。
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