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當(dāng)前位置:上海徠同生物科技有限公司>>技術(shù)文章>>Biotium EvaGreen GelRed核酸凝膠染料EB替代品
GelRed 和GelGreen是設(shè)計以取代劇毒的代替高毒性的溴化乙錠(EtBr)的新一代核酸凝膠熒光染料,。Biotium科學(xué)家研發(fā)的GelRed 和GelGreen集低毒性、高靈敏性和出色的穩(wěn)定性等優(yōu)點于一體,效果由于EtBr及其他EtBr替代品,。
幾十年來,EtBr因極其低廉的價格,,一般的靈敏度,,一直被用作核酸凝膠染色的主要染料。然而EtBr是一個高度誘變的物質(zhì),。該染料的使用安全隱患,,凈化及廢物處置的相關(guān)費用等,終導(dǎo)致其代價高昂,。正因如此,,近年來市場上出現(xiàn)了一些替代品,如SYBR系列染料等,。盡管這些替代染料減少了致突變性,,但卻喪失了染料其他方面的功能。例如,,SYBR Safe的靈敏度很低,,SYBR Green及SYBR Gold的穩(wěn)定性遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于EtBr。SYBR染料能快速的進入細(xì)胞,,結(jié)合線粒體及細(xì)胞核DNA,,是的染料在一定濃度是有毒的。事實上,,在紫外線或其他誘變劑誘導(dǎo)下,,SYBR Green I 強烈的突變性已經(jīng)被廣泛認(rèn)知。(Ohta,,et al.Mut Res 492,91(2001))
為了保證GelRed和GelGreen的安全性,,Biotium的科學(xué)家采用一種新型非常簡單的概念:阻止染料進入活細(xì)胞減少遺傳毒性。我們相信,,不給DNA結(jié)合染料滲透活細(xì)胞中結(jié)合基因組DNA的機會,,便可以保證染料沒有或大幅度減少其誘變性作用。因此,,我們設(shè)計的GelRed和GelGreen 染料擁有*化學(xué)結(jié)構(gòu)保證其無法滲透細(xì)胞膜,。Ames試驗驗證即使?jié)舛冗h(yuǎn)遠(yuǎn)高于實驗者操作凝膠染色的工作濃度,GelRed和GelGreen也無誘變性,。此外,,環(huán)境的安全性試驗表示,,GelRed和GelGreen是*無害的,對水生生物無毒,。因此,,廢棄的GelRed和GelGreen可以直接倒入下水道,或按照普通垃圾處理,。
無論是作為預(yù)制凝膠染料染色或電泳后染色,,GelRed和GelGreen染料都是搞靈敏度的。312/302nm的紫外光透射下,,GelRed靈敏度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過EtBr,,與SYBR Gold靈敏度相當(dāng),后凝膠染色法GelRed效果更明亮,。與SYBR Gold不同的是,,GelRed 也可以被作高度靈敏的與之驚叫預(yù)制凝膠染色。GelGreen是用于488nm激光凝膠掃描儀或者可見藍(lán)光激發(fā)的Dark Reader 的研究人員使用要求,。GelGreen光譜類似于SYBR Safe,,但比后者更為靈敏。
GelRed和GelGreen另一個主要優(yōu)勢是其顯著的穩(wěn)定性,??梢杂貌僮鱁tBr同樣的方式操作兩種染料。這意味著,,染料在水中是非常穩(wěn)定的,,可以在室溫下長期儲存,也可以在微波中加熱進行預(yù)制凝膠,。這兩種燃料也非常耐光,,暴露在室內(nèi)燈光下也比較穩(wěn)定。
EB GelRed SYBR Safe GelGreen
圖1. GelRed 和GelGreen比EB和SYBR Safe更靈敏,。左圖:比較了GelRed 和EB 的1%預(yù)制膠,,TBE緩沖液跑膠。右圖:比較了GelGreen和SYBR Safe 1%瓊脂糖凝膠的后染狀況,,同樣在TBE緩沖液中完成,。選用了Invitrogen的1 Kb的DNA Ladder作2倍稀釋,分別加入四個泳道中,,從左向右依次為200ng,,100ng,50ng和25ng,。
圖2. 在37°C下,,分別使用1X SYBR Green I, SYBR Safe, GelRed and GelGreen 對HeLa 細(xì)胞進行孵化,并分別在5分鐘(A)和30分鐘(B)后觀察。實驗顯示SYBR染料迅速進入細(xì)胞并將細(xì)胞內(nèi)的核酸染成亮綠色(以上僅圖示 SYBR Green 1),,而 GelRed 和 GelGreen 則因為不能穿透細(xì)胞膜而*沒有進入細(xì)胞內(nèi), 足以證明GelRed和GelGreen是安全的,。
圖 3. GelGreen (綠色) GelRed (紅色)在 PBS 緩沖溶液中結(jié)合 dsDNA 后的激發(fā)和發(fā)射光譜。
圖 4. 室溫下,, GelRed ( 500 nm )和 SYBR Gold ( 488 nm )稀釋在 1 × TBE 凝膠染色液中測得的吸光度隨時間變化圖,。 GelRed 和 SYBR Gold 初始的吸光度值分別為 0.029 和 0.051 。
GelRed 和GelGreen特點:
比EtBr安全:
艾姆斯氏實驗以及其他實驗證實無誘變性無細(xì)胞毒性,;
方便處理:
通過了環(huán)境安全實驗,,可以直接丟棄無需特殊處理。
超高的靈敏度:
比EtBr和SYBR Safe更靈敏,。
*的穩(wěn)定性:
溶于水中,,室溫下能長期保存,微波爐加熱性能穩(wěn)定,。
廣泛的適用性:
適用于預(yù)制凝膠和凝膠電泳后染色。
簡單的步驟:
預(yù)制凝膠和凝膠電泳后染色,。
兼容標(biāo)準(zhǔn)紫外凝膠成像系統(tǒng)及可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置:
使用312nm激發(fā)的UV凝膠成像系統(tǒng)時,,GelRed可以替代EB;無需改變成像條件;GelRed 可用EB常用儀器觀察,;GelGreen可用SYBR染料儀器進行觀察,。GelRed 可以替代 EB ; GelGreen 足以替代任意一種 SYBR 染料,。
可用于下游實驗:
普通的膠回收后,,可用于下游實驗。
產(chǎn)品信息:
Cat# | Product Name | Unit Size | 品 牌 |
41001 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 3X in water | 4.0 L | Biotium |
41002 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in DMSO | 0.5 mL | Biotium |
41003 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in water | 0.5 mL | Biotium |
41003-1 | GelRedTM 10,000X solution in water, bulk pack | 10 mL | Biotium |
41004 | GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in DMSO | 0.5 mL | Biotium |
41005 | GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in water | 0.5mL | Biotium |
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