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上海徠同生物科技有限公司

Biotium EvaGreen GelRed核酸凝膠染料EB替代品

時間:2018-7-23閱讀:636
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GelRed 和GelGreen是設(shè)計以取代劇毒的代替高毒性的溴化乙錠(EtBr)的新一代核酸凝膠熒光染料,。Biotium科學(xué)家研發(fā)的GelRed 和GelGreen集低毒性、高靈敏性和出色的穩(wěn)定性等優(yōu)點于一體,效果由于EtBr及其他EtBr替代品,。

幾十年來,EtBr因極其低廉的價格,,一般的靈敏度,,一直被用作核酸凝膠染色的主要染料。然而EtBr是一個高度誘變的物質(zhì),。該染料的使用安全隱患,,凈化及廢物處置的相關(guān)費用等,終導(dǎo)致其代價高昂,。正因如此,,近年來市場上出現(xiàn)了一些替代品,如SYBR系列染料等,。盡管這些替代染料減少了致突變性,,但卻喪失了染料其他方面的功能。例如,,SYBR Safe的靈敏度很低,,SYBR Green及SYBR Gold的穩(wěn)定性遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于EtBr。SYBR染料能快速的進入細(xì)胞,,結(jié)合線粒體及細(xì)胞核DNA,,是的染料在一定濃度是有毒的。事實上,,在紫外線或其他誘變劑誘導(dǎo)下,,SYBR Green I 強烈的突變性已經(jīng)被廣泛認(rèn)知。(Ohta,,et al.Mut Res 492,91(2001))

為了保證GelRed和GelGreen的安全性,,Biotium的科學(xué)家采用一種新型非常簡單的概念:阻止染料進入活細(xì)胞減少遺傳毒性。我們相信,,不給DNA結(jié)合染料滲透活細(xì)胞中結(jié)合基因組DNA的機會,,便可以保證染料沒有或大幅度減少其誘變性作用。因此,,我們設(shè)計的GelRed和GelGreen 染料擁有*化學(xué)結(jié)構(gòu)保證其無法滲透細(xì)胞膜,。Ames試驗驗證即使?jié)舛冗h(yuǎn)遠(yuǎn)高于實驗者操作凝膠染色的工作濃度,GelRed和GelGreen也無誘變性,。此外,,環(huán)境的安全性試驗表示,,GelRed和GelGreen是*無害的,對水生生物無毒,。因此,,廢棄的GelRed和GelGreen可以直接倒入下水道,或按照普通垃圾處理,。

無論是作為預(yù)制凝膠染料染色或電泳后染色,,GelRed和GelGreen染料都是搞靈敏度的。312/302nm的紫外光透射下,,GelRed靈敏度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過EtBr,,與SYBR Gold靈敏度相當(dāng),后凝膠染色法GelRed效果更明亮,。與SYBR Gold不同的是,,GelRed 也可以被作高度靈敏的與之驚叫預(yù)制凝膠染色。GelGreen是用于488nm激光凝膠掃描儀或者可見藍(lán)光激發(fā)的Dark Reader 的研究人員使用要求,。GelGreen光譜類似于SYBR Safe,,但比后者更為靈敏。

GelRed和GelGreen另一個主要優(yōu)勢是其顯著的穩(wěn)定性,??梢杂貌僮鱁tBr同樣的方式操作兩種染料。這意味著,,染料在水中是非常穩(wěn)定的,,可以在室溫下長期儲存,也可以在微波中加熱進行預(yù)制凝膠,。這兩種燃料也非常耐光,,暴露在室內(nèi)燈光下也比較穩(wěn)定。

EB GelRed SYBR Safe GelGreen

圖1. GelRed 和GelGreen比EB和SYBR Safe更靈敏,。左圖:比較了GelRed 和EB 的1%預(yù)制膠,,TBE緩沖液跑膠。右圖:比較了GelGreen和SYBR Safe 1%瓊脂糖凝膠的后染狀況,,同樣在TBE緩沖液中完成,。選用了Invitrogen的1 Kb的DNA Ladder作2倍稀釋,分別加入四個泳道中,,從左向右依次為200ng,,100ng,50ng和25ng,。

圖2. 在37°C下,,分別使用1X SYBR Green I, SYBR Safe, GelRed and GelGreen 對HeLa 細(xì)胞進行孵化,并分別在5分鐘(A)和30分鐘(B)后觀察。實驗顯示SYBR染料迅速進入細(xì)胞并將細(xì)胞內(nèi)的核酸染成亮綠色(以上僅圖示 SYBR Green 1),,而 GelRed 和 GelGreen 則因為不能穿透細(xì)胞膜而*沒有進入細(xì)胞內(nèi), 足以證明GelRed和GelGreen是安全的,。

圖 3. GelGreen (綠色) GelRed (紅色)在 PBS 緩沖溶液中結(jié)合 dsDNA 后的激發(fā)和發(fā)射光譜。

圖 4. 室溫下,, GelRed ( 500 nm )和 SYBR Gold ( 488 nm )稀釋在 1 × TBE 凝膠染色液中測得的吸光度隨時間變化圖,。 GelRed 和 SYBR Gold 初始的吸光度值分別為 0.029 和 0.051 。

GelRed 和GelGreen特點:

比EtBr安全:

艾姆斯氏實驗以及其他實驗證實無誘變性無細(xì)胞毒性,;

方便處理:

通過了環(huán)境安全實驗,,可以直接丟棄無需特殊處理。

超高的靈敏度:

比EtBr和SYBR Safe更靈敏,。

*的穩(wěn)定性:

溶于水中,,室溫下能長期保存,微波爐加熱性能穩(wěn)定,。

廣泛的適用性:

適用于預(yù)制凝膠和凝膠電泳后染色。

簡單的步驟:

預(yù)制凝膠和凝膠電泳后染色,。

兼容標(biāo)準(zhǔn)紫外凝膠成像系統(tǒng)及可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置:

使用312nm激發(fā)的UV凝膠成像系統(tǒng)時,,GelRed可以替代EB;無需改變成像條件;GelRed 可用EB常用儀器觀察,;GelGreen可用SYBR染料儀器進行觀察,。GelRed 可以替代 EB ; GelGreen 足以替代任意一種 SYBR 染料,。

可用于下游實驗:

普通的膠回收后,,可用于下游實驗。

產(chǎn)品信息:

Cat#

Product Name

Unit Size

品 牌

41001

GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 3X in water

4.0 L

Biotium

41002

GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in DMSO

0.5 mL

Biotium

41003

GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in water

0.5 mL

Biotium

41003-1

GelRedTM 10,000X solution in water, bulk pack

10 mL

Biotium

41004

GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in DMSO

0.5 mL

Biotium

41005

GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in water

0.5mL

Biotium

 

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