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PCR系列?鳥類多瘤病毒(APV)核酸檢測試劑盒
閱讀:266 發(fā)布時間:2023-4-11本試劑盒根據(jù)鳥類多瘤病毒(Avian Polyoma Virus,APV)基因中的保守區(qū)設計引物,并對檢測體系進行了針對性優(yōu)化,可針對鳥類羽毛,、血液、組織及口腔/泄殖腔拭子等樣品中APV 的特異核酸片段進行PCR擴增,,擴增產(chǎn)物可以直接進行瓊脂糖凝膠電泳,,以進行結果判定。
實驗操作:
1. 樣本制備(樣本制備區(qū))
請參照動物基因組DNA快速提取試劑盒(PCR分析用)說明書,,或其他符合相關標準的核酸提取試劑盒/方法,,對處理后的樣本進行核酸提取。提取的樣本核酸盡量及時進行檢測,,放置于冰盒中,否則于 4℃或-20℃保存,。
2. 配制反應體系(加樣區(qū))
按照樣本數(shù)量(n+2,,n為樣本數(shù),每次實驗建議設置 1 個陽性對照,,1 個陰性對照)配制反應液,,具體配制方法如下:分別吸取((n+2)*7.5µL無酶無菌水+(n+2)*10µL APV反應液+(n+2)*1µL APV引物Mix)加入潔凈離心管中,,充分吹吸混勻,,分裝至0.2mL PCR 管(離心管)中,每孔18µL(如樣本過多,,可提前預制,,于 2~8℃短暫保存,2 小時內使用)
向反應液中依次添加 2μL無酶無菌水(陰性對照),、樣本核酸和APV陽性對照,,蓋好 管蓋,做好記錄,,反應總體積為 20μL,。充分混勻,,離心 30 秒后進行PCR擴增實驗。
3. PCR擴增(擴增及產(chǎn)物分析區(qū))
95℃預變性 5 分鐘,;94℃變性 45 秒,,55℃退火 45 秒,72℃延伸 45 秒,,共 35 個循環(huán),;72℃ 延伸 5 分鐘;4℃保存,。擴增產(chǎn)物先放置于 4℃(-20℃約 5 分鐘)條件下充分冷卻(15 分鐘)
4. 瓊脂糖凝膠電泳(以水平電泳瓊脂糖凝膠制備為例)
根據(jù)制膠量及凝膠濃度(1%~1.5%),,量取一定量的電泳緩沖液,倒入三角錐形瓶中,。
注:制膠緩沖液和電泳緩沖液需一致,。
準確稱量瓊脂糖,小心加入三角錐形瓶中,。在錐形瓶的瓶口蓋上牛皮紙或封口膜,,置
于微波爐中或電磁爐上加熱溶解。加熱至溶液沸騰后,,請戴上防熱手套,,小心晃動錐形瓶,如 此重復數(shù)次,,直至瓊脂糖溶解,。
注:瓊脂糖溶解過程采用多次短暫沸騰的方法,避免溶液過熱暴沸,。保證瓊脂糖充分溶解,,以免造成電泳圖像模糊不清。
充分溶解的瓊脂糖稍冷卻后,,加入適量核酸染料,,輕微充分搖勻(避免產(chǎn)生大量氣泡)。
將瓊脂糖溶液倒入制膠模中,,在適當位置處插上梳子,。凝膠厚度一般在 3~5mm之間。
室溫下待膠凝固(大約 30 分鐘~1 小時),,小心拔出梳子,,將凝膠置于事前加入電泳緩沖液的電泳槽中,保證電泳緩沖液沒過凝膠,。
取 5μL DNA Marker以及 10μL經(jīng)瞬時離心冷卻后的擴增產(chǎn)物,,分別加入凝膠的各個點樣孔中,所有樣本點樣完成后,,靜置 2 分鐘后,,接通電泳槽電源,,根據(jù)實際情況設置電壓(70~120V)及電泳時間(20-30 分鐘)。
5. 結果判定
APV陽性對照在 200bp左右出現(xiàn)擴增條帶,,且陰性對照無目標擴增條帶,,則結果成立。
樣本檢測結果在 200bp左右出現(xiàn)一條擴增主條帶,,表明待檢樣本中存在APV核酸,,則
判定為APV陽性。
樣本檢測結果無目標擴增條帶,,表明樣本中未檢測出APV核酸,,則判定為APV陰性。