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?WIWAM植物表型成像系統(tǒng)由比利時SMO公司與Ghent大學(xué)VIB研究所研制生產(chǎn),,整合了LED植物智能培養(yǎng)、自動 化控制系統(tǒng),、葉綠素?zé)晒獬上駵y量分析,、植物熱成像分析、植物近紅外成像分析,、植物高光譜分析,、植物多光譜分 析、植物CT斷層掃描分析,、自動條碼識別管理,、RGB真彩3D成像等多項*技術(shù),以較優(yōu)化的方式實現(xiàn)大量植物樣 品——從擬南芥,、玉米到各種其它植物的方位生理生態(tài)與形態(tài)結(jié)構(gòu)成像分析,,用于高通量植物表型成像分析測量、植 物脅迫響應(yīng)成像分析測量、植物生長分析測量,、生態(tài)毒理學(xué)研究,、性狀識別及植物生理生態(tài)分析研究等。
SMO是歐洲著名的機械設(shè)備制造與設(shè)計工程公司,,是一家將大規(guī)模自動化理念和工業(yè)級零件和設(shè)備整合入 植物成像系統(tǒng)的廠家,,在機械自動化以及機器視覺成像領(lǐng)域擁有豐富的設(shè)計和實踐經(jīng)驗,為歐洲*客戶提供機械設(shè)計 解決方案,,SMO公司將機械領(lǐng)域的*理念帶入了植物表型機器人領(lǐng)域,,所采用的配件均為工業(yè)界廣泛認(rèn)可的高品質(zhì) 配件,耐受苛刻環(huán)境,,另外表型設(shè)備領(lǐng)域的諸多自動化配件,,均由SMO公司自主設(shè)計,因公司擁有極為強大的工程師 團隊,,基于工業(yè)領(lǐng)域的豐富經(jīng)驗,,可針對不同客戶需求,一般2-3周就可以提供極復(fù)雜表型成像系統(tǒng)的解決方案,。目前 WIWAM植物表型平臺分為WIWAM XY,,WIWAM Line以及WIWAM Conveyor 3個系列,同時還提供WIWAM Boxing柜 式成像系統(tǒng),,也提供野外表型成像系統(tǒng)設(shè)計方案,。
室內(nèi)植物表型成像柜WIWAM Imaging Box產(chǎn)品介紹
WIWAM Imaging Box是一款基礎(chǔ)可重復(fù)性強大表型成像機器人,用于對小型,、中型和大型植物,,如擬南芥植物研究和表型分析,也可對番茄,、大豆,、玉米等較大植株等進行表型分析等研究,也可對培養(yǎng)皿,、多孔板,,花盆等進行成像,訂購時需提供研究植物種類和要求尺寸,。該成像柜可測量多種植物生長參數(shù),。WIWAM Imaging Box更換花盆需要進行手工操作。
WIWAMImaging Box箱式外殼,,不同線路以及或多個成像相機以及計算機軟件和控制系統(tǒng)組成,。全套系統(tǒng)大都安裝在現(xiàn)有箱 式堅固外殼內(nèi),內(nèi)置高品質(zhì)工業(yè)部件,。通常采用上方取景照相機獲得圖像,。成像柜可同時安裝一系列照相機系統(tǒng),如可見光(VIS),紅外光(IR),,近紅外光(NIR),多光譜以及葉綠素?zé)晒庀鄼C等,。相機專門可配相機定位系統(tǒng),,用以實現(xiàn)將多個相機系統(tǒng)定位在同一視角,允許不同成像方式,;也標(biāo)配稱重澆水裝置,。通過控制系統(tǒng)就可以進行高分辨率成像。該成像柜可通過較優(yōu)化的方式實現(xiàn)植株的方位生理生態(tài)與形態(tài)結(jié)構(gòu)成像分析,,用于較高通量植物表型成像分析測量,、植物脅迫響應(yīng)成像分析測量、植物生長分析測量,、生態(tài)毒理學(xué)研究,、性狀識別及植物生理生態(tài)分析研究等。系統(tǒng)成像柜標(biāo)配稱重和灌溉站,,可對每個植株均進行進行個性處理,。成像平臺是封閉區(qū)域,配有適合照像的光照條件,,可從不同觀察角度獲得穩(wěn)定圖像,,聚焦遠處感興趣部分。成像柜可以容納備選一系列照相系統(tǒng),,用于非損害性圖像獲取,。除了上面提到的標(biāo)準(zhǔn)配置,WIWAM Imaging Box可設(shè)計成頂視-側(cè)視版本,,用于高達150cm盆栽植物的表型成像,,包含一個自上而下的鏡頭和一個水平鏡頭,可以從各個方面拍攝樣品圖像,。該成像柜也可集成光,、溫度和濕度傳感器監(jiān)控環(huán)境,詳細記錄實驗生長條件,。
室內(nèi)植物表型成像柜WIWAM Imaging Box優(yōu)勢
所有表型平臺均為SMO工程部門自主設(shè)計,、針對課題組的研究項目快速、準(zhǔn)確提供技術(shù)方案,,設(shè)備中諸多備件為自主生產(chǎn)和設(shè)計,;公司軟件設(shè)計團隊針對具體項目提供有針對性的WIWAM定制軟件;SMO和VIB自主開發(fā)PIPPA 數(shù)據(jù)管理,、視覺成像和分析軟件,,系統(tǒng)高效處理整個實驗設(shè)計的大數(shù)據(jù);PIPPA 軟件可安裝在網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器上(包括專有用戶管理系統(tǒng)),網(wǎng)絡(luò)中每個計算機均可操作,;在PIPPA軟件內(nèi),,可集成整合外來分析數(shù)據(jù)和文本;易于獲取數(shù)據(jù)庫和原始圖像數(shù)據(jù),;與客戶自有IT技術(shù)設(shè)施進行整合,;針對客戶對表型設(shè)備運行環(huán)境了解欠缺的事實,提供表型設(shè)備生長室,、溫室建設(shè)交鑰匙設(shè)計方案,,實現(xiàn)環(huán)境參數(shù)如 照明、溫度,、濕度等控制,,提供一站式表型研究解決方案;專門技術(shù)人員維護設(shè)備,、定期指導(dǎo)維護硬件,;代理密切溝通服務(wù)、提供支持反饋,;自主電路設(shè)計,、建筑內(nèi)電柜設(shè)計、機械電纜布線以及PLC管理所有室內(nèi)設(shè)施,,將工業(yè)領(lǐng)域理念灌輸?shù)娇蒲兄?;多篇利用WIWAM系統(tǒng)進行研究的文章發(fā)表在*期刊如Nature Biotechnology等上面;迅速增長的用戶群,;采用開放式框架設(shè)計,,可整合市面上的所以種類成像模塊。
應(yīng)用領(lǐng)域
遺傳資源和序列數(shù)據(jù)快速積累,,但將該信息與基因功能相關(guān)聯(lián)的進程要緩慢的多,,這表明植物表型是理解基因 編碼過程以及應(yīng)用該知識改善作物產(chǎn)量的主要瓶頸。*表型工作是耗勞力和教具技術(shù)挑戰(zhàn)性的部分,,成本高且耗時,。但該“表型瓶頸”已可通過集成新型圖像獲取技術(shù)、機器人技術(shù),、圖像分析技術(shù)以及數(shù)據(jù)處理技術(shù)解決,。WIWAM 植物表型成像系統(tǒng)集成了這些技術(shù),替代了很多人工處理,。該植物表型平臺可應(yīng)用到多個研究領(lǐng)域,,包括植物生 長調(diào)節(jié)、耐旱研究,、植物生理,、鹽堿或重金屬脅迫反應(yīng)等,。也可在不同光照條件,營養(yǎng)水平或土壤類型下,,研究化 學(xué)物影響.
產(chǎn)品可選配模塊
可見光RGB成像模塊
可見光RGB成像是所有高通量植物表型平臺的核心部分,,它分辨率高、測量快速,、科研中應(yīng)用多,、發(fā)表文章較多,可以捕獲與植物生長和發(fā)育相關(guān)的大量參數(shù),。此外,它們可以提供植物形態(tài)和結(jié)構(gòu)的測量,,并且包含顏色信息,。參數(shù)如下:
葉面積、植物緊實度/緊密度,、葉片周長,、偏心率、葉圓度,、葉寬指數(shù),、植物圓直徑、凸包面積,、植物質(zhì)心,、節(jié)間距、生長高度,、植物三維大高度和寬度,、相對生長速率、葉傾角,、節(jié)葉片數(shù)量,。
IT解決方案和儲存
WIWAM軟件在工業(yè)計算機上運行,觸摸屏,。該軟件配有用戶友好圖形界面,,用于控制機器人站行為以及以*靈活度設(shè)計設(shè)計實驗??赏瑫r運行多組實驗,,可運行不同隨機模式,可及時規(guī)劃單個植株或一組植株的處理,。在預(yù)設(shè)啟動時間,,PC機將向工業(yè)PLC發(fā)送指令,照管機器人移動,。所有成像,,稱重/澆水以及環(huán)境數(shù)據(jù)均可存于SQL數(shù)據(jù)庫,,記錄后可用于分析記錄。系統(tǒng)采用了開放式數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu),,可以直接獲取圖像,。該平臺可以與高性能計算相連,用于分析儲存數(shù)據(jù)或者可與本地服務(wù)器設(shè)施整合,。
SMS郵件服務(wù)可以通知用戶機器報警和錯誤,,可盡快進行用戶干涉。系統(tǒng)可于任一點暫停和停下,,UPS(不間斷電源)可防止數(shù)據(jù)丟失和確保在停電后全系統(tǒng)恢復(fù),。該軟件也有平臺管理員系統(tǒng)設(shè)置和維護行為通道。
圖像分析和數(shù)據(jù)可視化
WIWAM Conveyor有VIB開發(fā)的圖像分析和數(shù)據(jù)可視化軟件支持,,此軟件包,,稱為PIPPA,是中央網(wǎng)絡(luò)界面和數(shù)據(jù)庫,,一方面用來為不同類型的WIWAM植物表型平臺提供管理的工具,,另一方面用于分析圖像和數(shù)據(jù)。
PIPPA與該平臺通訊,,通過將PIPPA網(wǎng)絡(luò)界面生成的實驗結(jié)果傳到平臺,。每個花盆的處理和基因型信息已在數(shù)據(jù)庫限定以確保在整個實驗中的數(shù)據(jù)一體性。實驗期間PIPPA對來自平臺的稱重,,灌溉測量,,環(huán)境數(shù)據(jù),錯誤記錄以及圖像信息進行處理分析,。PIPPA支持這些圖像后續(xù)處理(旋轉(zhuǎn)/收獲/等),。圖像分析文本可以在PIPPA界面初始化,可設(shè)置于網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器運行(獨立版本)或計算機群運行,,以快速生成結(jié)果,。隨后,通過檢查數(shù)據(jù)是否在特定閾值之內(nèi)可在網(wǎng)絡(luò)幾面對輸出文本進行驗證,,例如,,是否生長相關(guān)性狀,如植物枝條面積一段時間內(nèi)是否增加,。
北京博普特科技有限公司是比利時WIWAM植物表型成像系統(tǒng)的中國區(qū)總總代理,,全面負(fù)責(zé)其系列產(chǎn)品在中國市場的推廣、銷售和售后服務(wù)
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