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布魯克 GeoMx DSP 數(shù)字空間多組學(xué)分析系統(tǒng)
布魯克 GeoMx DSP 數(shù)字空間多組學(xué)分析系統(tǒng)以特異性解析組織異質(zhì)性在組織空間背景下精準(zhǔn)解析不同組織功能區(qū)域中不同細(xì)胞群理解組織異質(zhì)性對(duì)于研究發(fā)育生物學(xué)、疾病發(fā)生發(fā)展機(jī)制以及對(duì)治療的響應(yīng)極為重要,。布魯克 GeoMx DSP 數(shù)字空間多組學(xué)分析系統(tǒng)彌補(bǔ)了組織成像和分子表達(dá)檢測(cè)(如單細(xì)胞測(cè)序等)之間的鴻溝,,支持您從空間多組學(xué)角度解鎖新的生物學(xué)見(jiàn)解。
技術(shù)原理
布魯克 GeoMx DSP 數(shù)字空間多組學(xué)分析系統(tǒng)采用傳利技術(shù)在抗體或者RNA上偶聯(lián)DNA Oligo,。每個(gè)DNA Oligo對(duì)應(yīng)一個(gè)靶標(biāo),,最高可達(dá)96個(gè)蛋白靶標(biāo)或>1000個(gè)RNA靶標(biāo)(二代測(cè)序輸出)。當(dāng)抗體或RNA與組織上的靶標(biāo)結(jié)合后,,GeoMx Digital Spatial Profiler利用激光切斷DNA oligo與抗體或RNA之間的連接物,,從而釋放出DNA Oligo以進(jìn)行下一步定量。
主要特點(diǎn):
1. 多靶標(biāo):可在-張FFPE組織 上定份析高達(dá)10000多種RNA或最高96種蛋白質(zhì)
2. 原位:采用1-4種熒光抗體染色獲取組織的形態(tài)學(xué)信息
3. 多維度:既可定分析蛋白質(zhì),也可定量分析RNA
4. 高精度:可達(dá)單細(xì)胞水平
5. 精準(zhǔn)定量:采用數(shù)字化單分子計(jì)數(shù)技術(shù),,最高達(dá)106水平
6. 樣本無(wú)損:整個(gè)操作過(guò)程對(duì)樣本無(wú)損傷,,利于保存珍貴樣本
7. 高通量: -天可分析多達(dá)12份組織樣本
彈性專注于您感興趣的目標(biāo)區(qū)域
科研者可以靈活的圈選策略,高效地理解組織結(jié)構(gòu),。由于不同組織的特點(diǎn),,研究人員往往在單一載玻片上可能對(duì)某一區(qū)域特別感興趣。在保留組織樣本完整性的情況下,,GeoMx Digital Spatial Profiler可以允許使用者在單張載玻片上根據(jù)組織輪廓選取感興趣區(qū)域(Region Of Interest, ROI),,甚至選取稀有細(xì)胞群體進(jìn)行分析。
工作原理
利用標(biāo)準(zhǔn)IHC方法,,將成像試劑(熒光標(biāo)記的抗體或探針),、定量試劑(DNA條形碼標(biāo)記的抗體或探針)和組織切片進(jìn)行雜交孵育。在DSP儀器中完成組織成像,、感興趣區(qū)域(ROI)圈選,,接下來(lái)與感興趣區(qū)域形狀匹配的紫外光束照射該區(qū)域,使得該區(qū)域內(nèi)的DSP條形碼得以釋放并被自動(dòng)收集,,進(jìn)而利用高通量測(cè)序(NGS)進(jìn)行表達(dá)定量,,最終得到的是組織中不同空間區(qū)域的表達(dá)譜信息。
1. 樣本制備:任何樣本(FFPE或新鮮冷凍樣本),;任何形態(tài)學(xué)標(biāo)記物,;檢測(cè)RNA和/或蛋白質(zhì)。
2. 樣本檢測(cè):利用GeoMx DSP對(duì)RNA和蛋白質(zhì)進(jìn)行自動(dòng)化組織成像和分子檢測(cè),。
3. 表達(dá)定量:利用NGS進(jìn)行表達(dá)定量,。
4. 數(shù)據(jù)分析:預(yù)置的數(shù)據(jù)處理流程,,交互式數(shù)據(jù)分析界面。
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