澳大利亞墨爾本大學微生物和免疫學系的Lachlan Coin和Sebastian Duchene團隊及合作者,，提供了新冠病毒的di一個直接RNA序列，詳細介紹了該冠狀病毒亞基因組長度的mRNA結構,，并描述了從共享數(shù)據(jù)中揭示的冠狀病毒進化遺傳學的各個方面,。相關論文3月7日發(fā)布于預印本服務器bioRxiv（bioRxiv所有論文未經(jīng)同行評議）,。

新冠病毒是一種冠狀病毒科陽性單鏈RNA病毒,，與能感染哺乳動物和禽類宿主的乙型冠狀病毒相關，例如MERS冠狀病毒和SARS冠狀病毒,。

為了確定新冠病毒亞基因組長度的mRNA的結構，研究人員使用了一種近建立的基于高度平行納米孔陣列的直接RNA測序方法,。簡而言之,，從具有高水平新冠病毒的培養(yǎng)材料中制備出核酸,，并在GridION平臺上進行測序。

通過這種方法,，新冠病毒樣本在40小時的測序中產(chǎn)生了680347個讀數(shù)，包含了860Mb的序列信息,。與培養(yǎng)的新冠病毒分離株的基因組一致，部分讀數(shù)屬于冠狀病毒序列（28.9%）,，包括分布在29893個堿基基因組中的367Mb序列,。其中一些的長度超過2萬個堿基，研究人員還捕獲了單個分子上的大部分基因組,。

通過數(shù)據(jù)分析,，研究人員確定了42個具有可預測的5-甲基胞嘧啶修飾的位點，這些位點在亞基因組長度的mRNA之間呈現(xiàn)一致的位置。

在其他陽性單鏈病毒中,，RNA甲基化在感染過程中會發(fā)生動態(tài)變化,，影響宿主—病原體相互作用和病毒復制。一旦數(shù)據(jù)集可用于新冠病毒的直接RNA序列,，研究人員可能會發(fā)現(xiàn)其他的修飾。人們目前對冠狀病毒的表觀轉錄組修飾知之甚少,。

研究人員認為,，通過使用直接的RNA序列數(shù)據(jù)，有助對新冠病毒分子生物學的深入了解,，并可能幫助構建病毒亞基因組長度mRNA結構的詳細視圖