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短螺旋體通用PCR檢測(cè)試劑盒說明書
閱讀：77 發(fā)布時(shí)間：2022-10-18| 提 供 商 | 上海谷研實(shí)業(yè)有限公司 | 資料大小 | 16.8KB |
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短螺旋體通用PCR檢測(cè)試劑盒說明書
特點(diǎn)優(yōu)勢(shì)：
1. 特異性：所有產(chǎn)品使用的引物均經(jīng)過詳盡的生物信息學(xué)分析,，經(jīng)過GenBank及自建龐大數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì),，確保所用的每一條引物均為種屬或血清型特異的基因序列區(qū)段，可實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)菌種屬及血清型的特異檢測(cè),，特異性均達(dá)到*,。
2. 重現(xiàn)性：該系列所有產(chǎn)品均經(jīng)過大量實(shí)驗(yàn)菌株的驗(yàn)證，重現(xiàn)性為*,。
3. 靈敏性：該系列產(chǎn)品可實(shí)現(xiàn)對(duì)檢測(cè)菌的高靈敏檢測(cè),，當(dāng)樣品中細(xì)菌的濃度達(dá)到103cfu/ml時(shí)，可實(shí)現(xiàn)對(duì)其的直接檢測(cè),，無需繁瑣的增菌過程,。
4. 實(shí)用性：檢測(cè)范圍廣，涵蓋了對(duì)人體危害較為嚴(yán)重的17種呼吸道及腸道致病菌,，可實(shí)現(xiàn)對(duì)臨床樣品及其他環(huán)境取樣的快速檢測(cè),，整個(gè)檢測(cè)過程為3-4個(gè)小時(shí)。
5. 優(yōu)勢(shì)1：序列資源豐富,，除GenBank公布的序列外,，公司還進(jìn)行了大量菌株的序列破譯，從理論上保證所選引物具有良好的保守性和特異性,。
6. 優(yōu)勢(shì)2：該系列試劑盒均經(jīng)過大量的保守性及特異性實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,，憑借公司擁有的豐富的菌種資源，每一種檢測(cè)試劑盒均經(jīng)過了20余種標(biāo)準(zhǔn)菌株和臨床菌株的保守性驗(yàn)證及40余種近緣標(biāo)準(zhǔn)菌株和臨床菌株的特異性驗(yàn)證,，確保在使用過程中不會(huì)出現(xiàn)任何的假陽(yáng)性及假陰性報(bào)告結(jié)果,。
短螺旋體通用PCR檢測(cè)試劑盒PCR使用方法：
一、樣品 DNA 的制備
1. 用自選方法純化樣品的 DNA,，本產(chǎn)品跟市場(chǎng)上絕大多數(shù)核酸純化產(chǎn)品兼容,。
2. 如果有 N 個(gè)樣品，則需要進(jìn)行 N+2 個(gè)樣品提取,，多出的一個(gè)用作樣品制備陽(yáng)性對(duì)照管,、另一個(gè)用作樣品制備陰性對(duì)照管。如果用本試劑盒自帶的 DNA 釋放劑試用裝,。則按下面步驟操作：
3. 配制溶液 A 工作液,。以配制 1mL 工作液（足夠 10 個(gè)樣品）為例：在一干凈塑料
管中加入 10uL 溶液 A 成分一，20uL 溶液 A 成分二和 970uL 超純水,，充分混合均勻即可,。溶液 A 工作液可室溫放置,，但最好在一周內(nèi)用完，不要長(zhǎng)期放置,。一次檢測(cè)一個(gè)樣品需要 100uL 溶液 A 工作液,，1mL 工作液足夠 10 個(gè)樣品。如果待測(cè)樣品數(shù)量為其他數(shù)字,，
配制的溶液 A 工作液的體積需要做相應(yīng)的調(diào)整,。
4. 在標(biāo)記好的 N+2 個(gè)離心管中，加入 1-5mg 固體樣品（半粒芝麻大小,，如奶酪）或5uL 液體樣品（如牛奶）待測(cè)樣品,。在樣品制備陽(yáng)性對(duì)照中加入 5uL 陽(yáng)性對(duì)照，在樣品制備陰性對(duì)照中加入 5uL 水,。
5. 在每個(gè)管中加入 100 uL 溶液 A 工作液,，確保固體樣品被溶液淹埋，如果是液體樣品則震蕩混勻,。
6. 95℃保溫 10 分鐘,。
7. 待冷卻到常溫后加入 10uL 溶液 B 并混勻得 DNA 釋放液。每個(gè)樣品得到的 DNA釋放液足夠進(jìn)行 50-100 次 PCR,。
短螺旋體通用PCR檢測(cè)試劑盒實(shí)驗(yàn)規(guī)則：
1,、要保證移液槍的準(zhǔn)確性，誤差不能超過2%,?？捎盟碗娮犹炱竭M(jìn)行確定。但有專業(yè)人員進(jìn)行矯正,。
2,、要配備20ul、50ul,、100ul,、1000ul和排槍各一支。吸取不同的液體后,，要更換槍頭。即使是吸取標(biāo)準(zhǔn)品時(shí),。
3,、要在實(shí)驗(yàn)前1小時(shí)將試劑盒從冰箱中取出，使各種試劑都恢復(fù)到室溫,，以使結(jié)果更穩(wěn)定,。
4、實(shí)驗(yàn)時(shí),，要使底物避光保存,。
5,、用槍吸取液體時(shí)速度不能太快，以免產(chǎn)生氣泡而使吸取量不準(zhǔn)確,。
6,、吸取液體時(shí)，要用量程和需要量接近的槍去吸,，減少誤差,。
7、將液體加到酶標(biāo)孔中時(shí),，避免槍頭和孔內(nèi)液體接觸,，可使槍頭上的液滴和孔壁接觸，液滴會(huì)自然流下去,。
8,、液體全部加完后，可將酶標(biāo)板在桌子上平行輕輕晃動(dòng)30秒,，混勻液體,。也可以用酶標(biāo)儀的晃動(dòng)功能。
9,、應(yīng)盡量做雙孔實(shí)驗(yàn),，這樣才能保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。
10,、對(duì)結(jié)果有疑問的樣品要用其它方法進(jìn)行確證,。
PCR反應(yīng)流程常規(guī)程序
將PCR反應(yīng)所需的成分配置完后，在PCR儀上于94-96℃預(yù)加熱幾十秒至幾分鐘,，使模板DNA充分變性,，然后進(jìn)入擴(kuò)增循環(huán)。在每一個(gè)循環(huán)中,，先于94℃保持30秒鐘使模板變性,，然后將溫度降到復(fù)性溫度（一般50-60℃之間），一般保持30秒鐘,，使引物與模板充分退火,；在72℃保持1分鐘（擴(kuò)增1kb片段），使引物在模板上延伸,，合成DNA,，完成一個(gè)循環(huán)。重復(fù)這樣的循環(huán)25～35次,，使擴(kuò)增的DNA片段大量累積,。最后，在72℃保持3-7min，使產(chǎn)物延伸完整,，4℃保存,。
2．復(fù)性（退火）和延伸溫度
復(fù)性的溫度是PCR擴(kuò)增是否順利的關(guān)鍵因素，通常在50-60℃之間,。具體的溫度主要由引物的Tm值決定,。延伸溫度絕大多數(shù)設(shè)定為72℃。如果復(fù)性的溫度很高,，可以將延伸溫度和復(fù)性溫度設(shè)置成同一溫度,，變成二步法PCR。
3．反應(yīng)時(shí)間
變性步驟一般使用30秒鐘,，如果模板的G+C含量較高,，或直接用細(xì)胞做模板，變性時(shí)間可適當(dāng)延長(zhǎng),。復(fù)性時(shí)間有30秒種一般是足夠的,。延伸時(shí)間由擴(kuò)增產(chǎn)物的大小決定，一般采用1kb用1分鐘來保證充足的時(shí)間,。
4．循環(huán)次數(shù)
循環(huán)次數(shù)主要與模板的起始數(shù)量有關(guān),，在模板拷貝數(shù)為104～105數(shù)量級(jí)時(shí)，循環(huán)數(shù)通常為25～35次,。
平臺(tái)效應(yīng)（plateaueffect）：PCR擴(kuò)增過程后期會(huì)出現(xiàn)的產(chǎn)物的積累按減弱的指數(shù)速率增長(zhǎng)的現(xiàn)象,。原因：底物和引物的濃度已經(jīng)降低，dNTP和DNA聚合酶的穩(wěn)定性或活性降低,，產(chǎn)生的焦磷酸會(huì)出現(xiàn)末端產(chǎn)物抑制作用,，非特異性產(chǎn)物或引物的二聚體出現(xiàn)非特異性競(jìng)爭(zhēng)作用，擴(kuò)增產(chǎn)物自身復(fù)性,，高濃度擴(kuò)增產(chǎn)物變性不*,。
5．PCR反應(yīng)液的配制
PCR反應(yīng)體系的配置方式有時(shí)也會(huì)影響反應(yīng)的正常進(jìn)行。常規(guī)方法與其它酶學(xué)反應(yīng)一樣,，在最后加入DNA聚合酶,。早期的PCR儀沒有帶加熱的蓋子，要求在反應(yīng)液上覆蓋一層礦物油,，防止水分蒸發(fā),。
對(duì)于使用具3’-5’外切活性的高溫DNA聚合酶時(shí)，有時(shí)會(huì)擴(kuò)增不出產(chǎn)物,。在遇到這個(gè)問題時(shí),，如果將反應(yīng)成分分開配制，A管含模板,、引物和dNTP,，以及調(diào)整體積的H2O,，B管含緩沖液,、DNA聚合酶和水,，然后再將兩管溶液混合起來，可較好地克服這個(gè)問題,。
按照常規(guī)的方法配制反應(yīng)體系,，有時(shí)會(huì)出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增的問題。熱啟動(dòng)（hotstart）PCR操作方式可較好解決這一問題,。將dNTP,、緩沖液，Mg2+和primer先配制好,，然后加入一粒蠟珠（如AmpliWaxPCRQam100）,，加熱熔化，再冷卻,，使蠟將溶液封住,，最后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有當(dāng)PCR反應(yīng)進(jìn)入高溫階段后,，蠟層熔化,，所有反應(yīng)成分才會(huì)混合在一起。
短螺旋體通用PCR檢測(cè)試劑盒實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)：
1）RT-PCR可以檢測(cè)組織,、細(xì)胞,、血液、細(xì)菌等很多材料,，不同的樣本有不同要求,，實(shí)驗(yàn)前請(qǐng)充分溝通確認(rèn)實(shí)驗(yàn)方案和樣本情況；
2）客戶盡可能提供實(shí)驗(yàn)的背景信息,、物種,、基因準(zhǔn)確的名稱和ID號(hào)；
3）客戶盡量不要提供DNA或RNA樣品,。
4）樣本保存于液氮或干冰,，也可以保存于Trizol液中。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR（quantitative real-time PCR,，qPCR）是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),，利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程，*通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法,。實(shí)時(shí)熒光定量PCR的化學(xué)原理包括探針類和非探針類兩類,，探針類是利用與靶細(xì)胞序列特異性雜交的探針來指示擴(kuò)增產(chǎn)物的增加，非探針類是利用熒光染料或者特異性設(shè)計(jì)的引物來指示擴(kuò)增的增加,。運(yùn)用該技術(shù)可以對(duì)DNA,、RNA樣品進(jìn)行定量（包括*定量和相對(duì)定量）和定性分析。
主要服務(wù)：DNA或RNA的*定量分析、基因表達(dá)差異分析,、基因分型,。
主要技術(shù)：引物設(shè)計(jì)、RNA提取,、cDNA合成,、qPCR。
試劑使用須知：
（1）請(qǐng)參照相關(guān)法規(guī),、文獻(xiàn),、MSDS等信息，理解并掌握好試劑的特性,，再進(jìn)行安全操作,。產(chǎn)品僅用于科研
（2）通常購(gòu)買試劑時(shí)一定要想到一次性用完。若估算不足有剩余的話,，更加注意其他保管和管理,。
（3）萬一試劑操作者并非專業(yè)技術(shù)人員。必須在專業(yè)人士的指導(dǎo)監(jiān)督下進(jìn)行操作,。對(duì)于使用后的廢棄物,，不要或者舊的試劑，應(yīng)按照相關(guān)法律法規(guī)正當(dāng)處理,。
（4）購(gòu)買后,，請(qǐng)務(wù)必確認(rèn)標(biāo)簽上的注意事項(xiàng)；做好預(yù)防顛倒,，摔壞的措施和管理體制,；在使用前再次確認(rèn)標(biāo)簽上的注意事項(xiàng)，做好必要的安全對(duì)策,；對(duì)沒有標(biāo)明其危害特性,、有害特性的，也要慎重地進(jìn)行操作,；必須帶好防護(hù)用具,，小心翼翼進(jìn)行操作。