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黃曲霉PCR定量試劑盒實(shí)驗(yàn)原理
閱讀:113 發(fā)布時間:2020-11-13提 供 商 | 上海谷研實(shí)業(yè)有限公司 | 資料大小 | 14.9KB |
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黃曲霉PCR定量試劑盒說明書
產(chǎn)品名稱:黃曲霉PCR定量試劑盒
產(chǎn)品規(guī)格:50次
運(yùn)輸:低溫
保存:負(fù)20度
有效期:一年
貨期:現(xiàn)貨
黃曲霉探針法熒光定量 PCR 試劑盒黃曲霉(Aspergillusflavus.),,半知菌類,,一種常見腐生真菌,。多見于發(fā)霉 的糧食、糧制品及其它霉腐的有機(jī)物上,。本產(chǎn)品是以探針法熒光定量PCR 技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測黃曲霉的試劑盒,,它具有下列特點(diǎn):
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品DNA 模板,。
2. 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,,靈敏性高。
3. 提供陽性對照,,便于區(qū)分假陰性樣品,。
4. 特異性高,引物是根據(jù)黃曲霉高度保守區(qū)設(shè)計(jì),,不會跟其他微生物的DNA 發(fā)生交叉反應(yīng),。
5. 本產(chǎn)品足夠 50 次 20μL 體系的探針法熒光定量 PCR 反應(yīng)。PCR實(shí)驗(yàn)方法步驟:
方法
1:在冰浴中,,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中,。
10×PCR buffer
5 μl dNTP mix(2mM)
4 μl 引物1(10pM)
2 μl 引物2(10pM)
2 μl Taq酶(2U/μl)
1 μl DNA模板(50ng-1μg/μl)
1 μl 加ddH2O至50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油,。
2:調(diào)整好反應(yīng)程序,。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,,執(zhí)行擴(kuò)增,。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段:93℃40s → 58℃30s → 72℃60s,,循環(huán)30-35次,在72℃保7min,。
3:結(jié)束反應(yīng),,PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測或-20℃長期保存,。
4:PCR的電泳檢測:如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μl進(jìn)行抽提反應(yīng)混合液,,以除去石蠟油,;否則,直接取5-10μl電泳檢測,。
產(chǎn)品僅用于科研14℃或-20℃黃曲霉探針法熒光定量 PCR 試劑盒樣品收集,、處理及保存方法
1. 血清:使用不含熱原和內(nèi)毒素的試管,操作過程中避免任何細(xì)胞刺激,,收集血液后,,3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘將血清和紅細(xì)胞迅速小心地分離。
2. 血漿:EDTA,、檸檬酸鹽或肝素抗凝,。3000 轉(zhuǎn)離心30 分鐘取上清。
3. 細(xì)胞上清液:3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘去除顆粒和聚合物,。
4. 組織勻漿:將組織加入適量生理鹽水搗碎,。3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘取上清。
5. 保存:如果樣本收集后不及時檢測,,請按一次用量分裝,,凍存于-20℃,避免反復(fù)凍融,,在室溫下解凍并確保樣品均勻地充分解凍,。
需要自備的器材:
1.產(chǎn)品僅用于科研儀器:分析天平、離心機(jī),、熒光 PCR 擴(kuò)增儀,、組織研磨器、-20 ℃冰箱,、可調(diào)移液器(2 µL,、20
µL、200 µL,、1000 µL),。
2.耗材:熒光 PCR 反應(yīng)管、眼科剪,、眼科鑷,、生理鹽水、1.5 mL 經(jīng)焦碳酸二乙酯(DEPC)水
處理的滅菌離心管,、吸頭(10 µL,、200 µL、1000 µL),、滅菌雙蒸水,。
特點(diǎn):
1.即開即用,,用戶只需要提供樣品 DNA 模板,操作簡單,,定量準(zhǔn)確快速,。
2. 引物經(jīng)過優(yōu)化,特異性強(qiáng),。預(yù)期的 PCR 產(chǎn)物長度為 560 bp,。
3. PCR mix 中含上樣染料,PCR 后可以直接上樣電泳,。
4. 提供陽性對照,,便于分析試驗(yàn)結(jié)果。操作流程:
1.整個檢測過程應(yīng)嚴(yán)格按照本說明書要求分別在試劑準(zhǔn)備區(qū),、樣本處理區(qū)和PCR擴(kuò)增區(qū)進(jìn)行操作,,各區(qū)實(shí)驗(yàn)服、儀器,、耗材應(yīng)獨(dú)立使用,,不能混用;實(shí)驗(yàn)用吸頭采用帶濾芯吸頭,;樣本處理區(qū)應(yīng)配有生物安全柜,,樣本處理在生物安全柜中進(jìn)行操作;三個區(qū)應(yīng)該配有紫外線殺菌裝置,。
2.為避免RNA降解,,樣本處理過程應(yīng)在0-4℃條件下操作,且完成實(shí)驗(yàn)后立即上機(jī)檢測,;樣本處理過程中使用的器具耗材應(yīng)經(jīng)過無核酶處理,。
3.每次實(shí)驗(yàn)應(yīng)該設(shè)置陰、陽性對照,。
4.試劑盒所有試劑在使用前應(yīng)該在常溫下充分融化混勻,,并應(yīng)瞬時離心。
5.試劑盒內(nèi)所配陰性和陽性對照在一次使用前應(yīng)全部轉(zhuǎn)移至標(biāo)本準(zhǔn)備區(qū),,并單獨(dú)存放,。
6.為防止熒光干擾,應(yīng)避免裸手直接接觸PCR反應(yīng)管,,并應(yīng)避免在PCR反應(yīng)管上進(jìn)行任何標(biāo)記,。
7.儀器擴(kuò)增相關(guān)參數(shù)應(yīng)按照本說明書相關(guān)要求進(jìn)行設(shè)置;不同批號試劑不能混用,。
8. ABI系列熒光定量PCR儀參數(shù)設(shè)置中不選ROX校正,,淬滅基因選擇None。
9.實(shí)驗(yàn)過程中產(chǎn)品的廢棄物應(yīng)該進(jìn)行無害化處理后方可丟棄。
儲存條件:
14℃或-20℃樣品收集,、處理及保存方法
1.血清:使用不含熱原和內(nèi)毒素的試管,,操作過程中避免任何細(xì)胞刺激,,收集血液后,,3000轉(zhuǎn)離心10分鐘將血清和紅細(xì)胞迅速小心地分離。
2.血漿:EDTA,、檸檬酸鹽或肝素抗凝,。3000轉(zhuǎn)離心30分鐘取上清。
3.細(xì)胞上清液:3000轉(zhuǎn)離心10分鐘去除顆粒和聚合物,。
4.組織勻漿:將組織加入適量生理鹽水搗碎,。3000轉(zhuǎn)離心10分鐘取上清。
5.保存:如果樣本收集后不及時檢測,,請按一次用量分裝,,凍存于-20℃,避免反復(fù)凍融,,在室溫下解凍并確保樣品均勻地充分解凍,。
黃曲霉探針法熒光定量 PCR 試劑盒反應(yīng)五要素:
參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即引物、酶,、dNTP,、模板和Mg2+
引物:引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,PCR 產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補(bǔ)的程度,。理論上,,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設(shè)計(jì)互補(bǔ)的寡核苷酸鏈做引物,,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴(kuò)增,。設(shè)計(jì)引物應(yīng)遵循以下原則:
①引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右,。
②引物擴(kuò)增跨度: 以200-500bp為宜,,特定條件下可擴(kuò)增長至10kb的片段。
③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC*隨機(jī)分布,,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列,。
④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補(bǔ),,特別是3'端的互補(bǔ),,否則會形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴(kuò)增條帶。
⑤引物3'端的堿基,,特別是末及倒數(shù)第二個堿基,,應(yīng)嚴(yán)格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗,。
⑥引物中有或能加上合適的酶切位點(diǎn),, 被擴(kuò)增的靶序列*有適宜的酶切位點(diǎn), 這對酶切分析或分子克隆很有好處,。
⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性,。
引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以*引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴(kuò)增,,且可增加引物之間形成二聚體的機(jī)會。
運(yùn)輸及保存:低溫運(yùn)輸,,-20℃保存,,保存期限為一年。陽性對照需要單獨(dú)放置,,不要污染其他試劑,。
自備試劑:樣品 DNA。