組分 | 質(zhì)粒 DNA | PCR 產(chǎn)物 | 基因組 DNA |
ddH2O | 15ul | 16ul | 30ul |
10× CutOne Buffer 或 10× CutOne Color Buffer | 2ul | 3ula | 5ul |
底物 DNA | 2ul (up to 1ug) | 10ul (~0.2ug) | 10ul (5ug) |
SfiI | 1ul | 1ul | 5ul |
Total | 20ul | 30ul | 50ul |
a. 本體系適用于經(jīng)過純化的 PCR 產(chǎn)物酶切,。未純化的 PCR 產(chǎn)物具備一定的離子強度,10× Cutone Buffer 加入量可適當減少至 2 μl,。但由于 DNA 聚合酶同時具有外切酶活性,,會影響酶切產(chǎn)物,因此如下一步需進行(2)輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),,然后瞬時離心以收集掛壁液滴,;
(3)50℃溫育 15 min(質(zhì)粒),,或 15~30 min(PCR 產(chǎn)物),或 30~60 min(基因組 DNA),;
(4)酚氯仿抽提或柱純化(可選),;
(5) 如果使用 CutOne Color Buffer 進行酶切反應(yīng),得到的產(chǎn)物可以直接進行上樣電泳,。
2,、雙酶切或多酶切(1)每種快速內(nèi)切酶的用量為 1 μl,并根據(jù)需要適當擴大反應(yīng)體系,;
(2) 所有快速內(nèi)切酶的體積總和不得超過總反應(yīng)體系的 1/10,;
(3)如果所用的幾種快速內(nèi)切酶的最適反應(yīng)溫度不同,應(yīng)先以最適溫度低的酶開始酶切,,再添加最適溫度較高的酶,,在其最適反應(yīng)溫度下進行酶切反應(yīng)。
3,、適用于質(zhì)粒的擴大反應(yīng)體系
DNA | 1ug | 2ug | 3ug | 4ug | 5ug |
SfiI | 1ul | 2ul | 3ul | 4ul | 5ul |
10× CutOne Buffer 或 10× CutOne Color Buffer | 2ul | 2ul | 3ul | 4ul | 5ul |
Total | 20ul | 20ul | 30ul | 40ul | 50ul |
不同 DNA 中的酶切位點數(shù)量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 3 |
甲基化修飾影響
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
無影響 | 剪切受影響 | 剪切受影響 | 無影響 | 無影響 |
在不同反應(yīng)緩沖液中的活性
| CutOne Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB CutSmart® Buffer | Takara QuickCut™ Buffer |
活性 | 100% | 100% | 100% | 100% |