使用磷酸化抗體時,需要注意以下事項以確保實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性:
樣本處理:
加入抑制劑:在裂解緩沖液(lysis buffer)中必須加入蛋白酶抑制劑和適量的磷酸酶抑制劑,,以抑制組織或細(xì)胞裂解過程中釋放的內(nèi)源性蛋白磷酸酶,,防止磷酸化蛋白去磷酸化,從而維持蛋白質(zhì)的磷酸化狀態(tài),。
確保裂解:建議使用裂解液裂解結(jié)合超聲處理,,確保細(xì)胞充分裂解并剪切染色質(zhì)DNA。超聲處理時應(yīng)保持低溫,,避免蛋白降解,。
新鮮樣本:使用新鮮制備的樣本,避免反復(fù)凍融,,以減少磷酸基團(tuán)的降解,。
抗體孵育:
低溫孵育:一抗孵育最好在4°C下進(jìn)行,并過夜孵育,,以確??贵w與目的蛋白充分結(jié)合。低溫有助于維持抗體與抗原的物理吸附,,防止高溫下抗原脫落,。
稀釋液選擇:根據(jù)產(chǎn)品說明書推薦的稀釋液稀釋抗體,通常建議使用含5%牛血清白蛋白(BSA)的TBST稀釋液,,而非含脫脂牛奶的TBST,,因為脫脂牛奶中可能含有磷酸化蛋白,影響實驗結(jié)果。
洗滌條件:
洗滌液選擇:推薦使用TBST作為洗滌液,,相對于PBST,,TBST能提供更強(qiáng)的信號。
洗滌次數(shù)和時間:洗滌次數(shù)和時間需要優(yōu)化,,以避免信號減弱或背景增加,。通常建議一抗和二抗孵育后,用TBST洗膜3次,,每次5分鐘。
封閉條件:
封閉劑選擇:雖然網(wǎng)絡(luò)上流傳磷酸化抗體不適于用牛奶封閉的說法,,但使用實驗級脫脂牛奶進(jìn)行室溫封閉1小時是有效的,,且有助于降低非特異性結(jié)合。
封閉時間:避免膜封閉時間過長,,以免掩蓋抗原表位,,阻止抗體結(jié)合。
對照設(shè)置:
陽性對照:設(shè)置合適的陽性對照,,以確認(rèn)抗體檢測到的特異性信號,。
總蛋白和內(nèi)參對照:除了檢測磷酸化蛋白外,還應(yīng)檢測該蛋白的總表達(dá)量,,以及使用普通內(nèi)參作為體系對照,,保證上樣量一致。
實驗環(huán)境:
低溫環(huán)境:在整個實驗過程中,,除超聲處理外,,應(yīng)保持低溫環(huán)境,以防止磷酸化蛋白在室溫下被蛋白磷酸酶降解,。
結(jié)果分析:
分子量比對:在壓片后,,根據(jù)marker比對條帶的分子量,確認(rèn)檢測到的條帶是否正確,。
曝光時間:優(yōu)化曝光或壓片時間,,以避免背景過深或條帶過淺。
抗體質(zhì)量:
選擇高質(zhì)量抗體:確保使用的磷酸化抗體質(zhì)量可靠,,并嚴(yán)格按照抗體說明書進(jìn)行操作,。
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