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chip-seq+多色Absin助力!探究p53調節(jié)腫瘤免疫微環(huán)境的潛在機制

閱讀:623      發(fā)布時間:2024-11-7
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作為癌癥中最常見的基因改變,,超過一半的人類癌癥都有p53突變,,從而導致轉錄失活。然而,,p53如何調節(jié)"immune landscape",,為免疫逃逸創(chuàng)造有力條件仍然難以捉摸。該項研究中發(fā)現(xiàn),,癌癥干細胞(CSCs)建立了一個白細胞介素-34(IL-34)協(xié)調的生態(tài)位,,以促進p53缺失的肝癌的腫瘤發(fā)生發(fā)展。在機制上發(fā)現(xiàn)IL-34是一個被p53轉錄抑制的基因,,而p53缺失導致CSCs分泌IL-34,。IL-34誘導cd36介導的脂肪酸氧化代謝升高,從而驅動泡沫樣腫瘤相關巨噬細胞(TAMs)的M2樣極化,。這些IL-34協(xié)調的TAMs抑制CD8+T細胞介導的抗腫瘤免疫,,以促進免疫逃逸。阻斷IL-34-CD36軸可引起抗腫瘤免疫,,并與抗pd-1免疫治療協(xié)同作用,,導致完quan應答,。該研究結果揭示了p53調節(jié)腫瘤免疫微環(huán)境的潛在機制,并為p53失活的癌癥免疫治療提供了一個潛在的靶點,。

 

 

文章:Interleukin-34-orchestrated tumor-associated macrophage reprogramming is required for tumor immune escape driven by p53 inactivation IF=25.5

 

對Trp53WT和Trp53缺失的腫瘤進行了rna測序,,結合q-PCR、ELISA和免疫印跡結果,,發(fā)現(xiàn)CSCs在Trp53缺失的腫瘤樣本表達的IL-34顯著升高,多重免疫組化染色顯示IL-34和EpCAM共定位于Trp53缺失的腫瘤,,EpCAM+ CD47+ CSCs在Trp53缺失的腫瘤中不表達p21,。這些結果共同表明,p53失活的CSCs是分泌IL-34的主要細胞亞群,。

 

圖1 由p53失活的CSC異常高分泌的IL-34促進了肝癌的腫瘤發(fā)生

 

為了驗證p53可能抑制IL34轉錄的猜測,,使用abs50034染色質免疫共沉淀(ChIP)試劑盒采用ChIP-seq(K)+ChIP-qPCR(L)+DNA pull down(M)聯(lián)合證實p53可直接抑制IL34的轉錄!

 

圖2 ChIP-seq(K)+ChIP-qPCR(L)+DNA pull down(M)

 

(K)染色體視圖圖顯示了p53在IL34和CDKN1A的啟動子上的結合(p21,;陽性對照),。

(L)用對照抗體IgG或抗p53或抗rna聚合酶II對HepG2細胞進行染色質免疫共沉淀,然后用IL34啟動子引物進行PCR,。

(M)免疫印跡分析生物素化和未生物素化的IL34啟動子探針的下拉沉淀(與HepG2細胞提取物)

 

考慮到IL-34是參與單核細胞增殖,、存活和向巨噬細胞分化的細胞因子,研究者用CIBERSORT研究了肝臟腫瘤免疫細4胞的組成,,發(fā)現(xiàn)IL-34的表達與巨噬細胞的比例呈正相關,。空間轉錄組測序和多重免疫組化結果表明Trp53null腫瘤中的大多數(shù)tam是單核細胞來源的巨噬細胞(MDMs),,進一步的研究發(fā)現(xiàn),,在trp53缺失的腫瘤中,tam在分泌il-34的CSCs附近積累,,基因集富集分析表明,,來自Trp53null腫瘤的tam在脂滴特征上富集,BODIPY脂肪酸探針對tam進行染色表明,,trp53缺失腫瘤中的tam類似于泡沫樣巨噬細胞,,差異基因分析顯示,Trp53null腫瘤中CD206+和CD163+巨噬細胞的比例增加,,這些結果共同表明,,積聚在csc附近的tam表現(xiàn)出脂質負載的促腫瘤表型。Trp53+/+ 或Trp53-/-與骨髓源性巨噬細胞共培養(yǎng)后檢測發(fā)現(xiàn),,IL-34在Trp53null腫瘤中促進脂質積累和tam的促腫瘤極化,。

 

圖3 IL-34在p53失活的CSCs附近誘導泡沫樣tam

 

在接下來的實驗中,研究者證明了IL-34通過CD36促進脂肪酸攝取,,并通過FAO代謝重編程誘導巨噬細胞的促腫瘤極化,,為了提供IL-34-CD36軸在體內促進TAM脂質積累和m2樣巨噬細胞極化的直接證據(jù),,研究者將Il34過表達的CT細胞(Trp53+/+)和Il34基因敲除的PT細胞接種到小鼠體內,發(fā)現(xiàn)Il34過表達的腫瘤中tam的比例高于CT腫瘤,,通過注射氯膦酸脂體對巨噬細胞進行全身耗竭,,il-34缺陷PT腫瘤與對照PT腫瘤之間的腫瘤生長差異被消除,流式細胞術和共培養(yǎng)實驗表明,,IL-34-CD36軸協(xié)調的TAM通過抑制Trp53null肝癌中的T細胞介導的抗腫瘤免疫來促進腫瘤免疫逃逸,。

 

在隨后的小鼠實驗中發(fā)現(xiàn),用抗IL-34或CD36的中和抗體治療Trp53/PT腫瘤小鼠,,IL-34或CD36的抗體阻斷導致腫瘤生長明顯受限,,對TP53突變的肝癌的公共單細胞RNA-seq數(shù)據(jù)的分析表明,腫瘤細胞高表達IL34,,TAM表現(xiàn)出強勁的CD36表達,,而其在所有其他細胞類型中的表達都很弱??傊?,結果表明,阻斷IL-34信號傳導可能成為TP53突變癌癥患者的潛在免疫療法,。

 

圖4 阻斷IL-34信號可抑制肝癌生長并導致p53失活

 

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