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分子實驗之如何保證樣本核酸穩(wěn)定,?

閱讀:1130      發(fā)布時間:2023-11-17
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科研狗起早摸黑做了幾天分子克隆實驗,,

本想著拖了好幾個星期的實驗終于要做完啦!瞬間覺得自己棒棒噠,!

但是最后看實驗結果?。?! 原地裂開


 

排查實驗試劑,,沒問題!

排查實驗操作,,沒問題,!

排查儀器,沒問題,!

那么問題到底出在哪呢,?


 

其實問題有可能出現(xiàn)在樣本保存與前處理步驟中哦。生物樣本中的核酸(DNA/RNA)會因為核酸酶,、溫度,、pH值,、微生物、自身化學性質等因素而發(fā)生被動或主動降解,,從而導致分子實驗結果不盡人意,。目前針對不同科研的需求,更多的樣本保存方式也相繼問世,,小愛為大家匯總了各類樣本保存的步驟,、注意事項、以及樣本保存耗材或保存液的推薦,。


一,、實驗樣本主要類型:

 

分子實驗中主要的樣本類型有:純核酸類、組織類,、細胞類及環(huán)境類,。不同樣本具有不同的保存方式以及操作注意事項。


圖1 常見的實驗樣本類型

 

表1 不同類型樣本核酸保存方法及穩(wěn)定性


類型

檢測目標

穩(wěn)定性及保存注意事項

組織

DNA/RNA

新鮮組織應盡快加入到含有核酸保護劑的管中,,放置于冰上運輸至實驗室,;石蠟包埋組織中的核酸在室溫即可保持穩(wěn)定。

血液

全血的DNA/RNA

DNA:全血室溫可穩(wěn)定保存24h,,2-8℃穩(wěn)定保存72h,,-20℃可長期保存

RNA:室溫不建議保存,樣本應至于含有核酸穩(wěn)定劑的管中,,放置于冰上運輸至實驗室,。

血清/血漿的cfDNA/ctDNA/病毒DNA/病毒RNA

cfDNA:2-8℃,8h內分離血漿,,-20℃或更低溫度穩(wěn)定保存,;

ctDNA:抽血后4-5h內即需要完成核酸提取,;

病毒DNA:2-8℃穩(wěn)定一周,,-20℃穩(wěn)定一年以上;

病毒RNA:2-8℃,,6h內分離血漿,-20℃或更低溫度保存

干血片的DNA

室溫穩(wěn)定保存19個月,,需要注意防潮,。

細胞

DNA/RNA

37℃保持細胞活力即可。

骨髓

RNA

必須在采集后立即至于RNA穩(wěn)定劑中,,或者于液氮中速凍

胸水,、腦水、腦脊液等其他生物體液樣本

DNA

低溫(2-8℃)保存,,盡快提取檢測,。




 

二,、實驗樣本前處理步驟及注意事項

 

1、組織樣本:


塊狀組織樣本短時間內無法充分裂解,,一般需要進行樣本預處理,。組織取材在組織離體30min內完成,取樣的動作要盡量快速利索,,將組織按任一方向切成黃豆粒大小,。


組織DNA提取:新鮮組織樣本用生理鹽水清洗2次,,即刻進行實驗,。如若不立即進行實驗,可用液氮速凍,,-80℃凍存,。


組織RNA提取:將動物或植物組織切成小塊,,在液氮中磨碎或用勻漿器勻漿處理,快速轉入裝有1mL Trizol(abs60154)的2mL離心管中,,立即進行實驗。若后期再進行實驗,,盡量保存時將樣本浸入RNA樣品保存液(abs9268)后置4℃冰箱過夜(4℃過夜是必需的,,這樣可使RNA樣品保存液滲入到組織中),然后轉移到-20℃冰箱,?;蛘咭旱心ソM織,加入Trizol,,放入-80℃保存,。


圖2 組織樣本RNA提取流程圖

 

2、細胞樣本:


DNA提?。?/strong>細胞收集沉淀后,,進行液氮速凍,-80℃保存,。


RNA提?。?/strong>

1)貼壁細胞:吸盡培養(yǎng)液,每10cm2培養(yǎng)面積加入1mL Trizol,,用加樣器吹打數(shù)次,,以確保細胞裂解,然后轉移至離心管中,。注:貼壁細胞Trizol的使用量應由培養(yǎng)皿表面積決定,,而非由細胞數(shù)目決定。Trizol量不足可能導致提取的RNA中有DNA污染;
2)懸浮細胞:離心收集細胞,,吸盡液體,,每5-10×106動植物或酵母細胞,或每1×107細菌細胞加入1mL Trizol,,用加樣器吹打,,使其裂解,然后轉移至離心管中,。 注:添加Trizol前切勿洗滌細胞,,以免RNA降解。必要時可以用勻漿器來裂解某些細菌或者酵母細胞,。若后期再進行RNA提取實驗,,細胞用液氮速凍,-80℃凍存,。

 

3,、血液樣本:


采用含有抗凝劑的真空采血管保存即可。但采血管中的抗凝劑種類多樣,,抗凝劑的種類也會直接影響后續(xù)檢測結果,,面對這么多的采血管如何進行選擇?我們建議使用EDTA或枸櫞酸鈉抗凝管,,不建議使用肝素抗凝管(因肝素在后面的核酸提取過程中很難去除,,且肝素對PCR反應有很強的抑制作用,因此不建議使用肝素抗凝管),。采集完血液,,顛倒混勻備用。另外冰凍血液溶解過程中會有破碎的細胞釋放RNA酶,,因此在冰凍前加入Trizol,,切勿直接凍存新鮮血液,保存好的血液應避免反復凍融,。

 

4,、血清/血漿樣本:


全血不加抗凝劑分離的上清是血清,加入抗凝劑分離的上清是血漿,。取全血后,,靜止1-2h,置于離心機3000rpm離心15min即可獲得血清或血漿,。


三,、樣本前處理利器—RNA樣品保存液(abs9268)

 

RNA樣品保存液是一種無毒的可直接使用的樣品儲存液,能使細胞內的RNARNA酶分離,,防止樣本中RNA表達譜發(fā)生變化。加入樣本保存液的樣本中RNA在室溫可以保存7天4℃可以保存4周,,-20℃,、-80℃標本可以長期保存。在RNA樣品保存液中保存的標本,,反復凍融至室溫20次不影響RNA的質量,。

 

操作步驟:

1)計算保存液用量:根據(jù)要保存的各樣本的體積,計算出所需RNA樣品保存液用量,;a:RNA樣品保存液的用量應當是組織體積的10倍(100mg組織約用1mL RNA樣品保存液),;b:離心收集2×107細胞RNA樣品保存液的用量是1mL;
2)分裝:RNA樣品保存液按需要量分裝入自備保存管中,;
3)切片:快速將較大的組織切成厚度<0.5cm的任意片狀,,較小的組織直接取下,立即浸入RNA樣品保存液中,;
4)保存:保存時先將樣本浸入RNA樣品保存液后置4℃冰箱過夜,,然后轉移到-20℃冰箱或繼續(xù)轉移至-80℃冰箱。


四,、本期小愛產(chǎn)品推薦


貨號

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

abs9268

RNA樣品保存液

100mL

abs9474

組織保存液

100mL

abs60150

RNA酶抑制劑

2000U

abs60154

Trizol

100mL

abs9259

無酶無菌水(DEPC水)

500mL





 



Absin特色產(chǎn)品線:

WB相關:ECL發(fā)光液,、預染marker、預制膠,;IHC相關:二抗試劑盒,、組化筆;IP/CoIP試劑盒,;激動劑/抑制劑,;血清、BSA,、蛋白酶K,、CTB、TTX,、CEE,;凋亡試劑盒;呼吸爆發(fā)試劑盒,;ELISA試劑盒,;重組蛋白;抗體: 二抗,、標簽抗體,、對照抗體;定制服務(抗體/多肽/蛋白/標記/檢測)...

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