很多老師咨詢類器官RNA和蛋白如何提取,,其實類器官可以按微小組織進行RNA和蛋白提取,今天小愛給大家講一講提取方法,。
類器官蛋白提取方法
一,、試劑準備(細胞漿、細胞核及細胞膜蛋白抽提試劑盒(abs9346))
1,、準備溶液
1)室溫融解試劑盒中的各種溶液,,溶解后除結(jié)構(gòu)蛋白提取液外,其他試劑立即置于冰上,;
2)結(jié)構(gòu)蛋白提取液溶解后,,可放置于37℃水浴中溫浴至透明后,常溫放置,。
2,、蛋白提取工作液的準備
1)胞漿蛋白提取工作液的準備:臨用前,根據(jù)處理樣品的量估算實驗時胞漿蛋白提取液的需要量,,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF,;
2)胞核蛋白提取工作液的準備:臨用前,根據(jù)處理樣品的量估算實驗時胞核蛋白提取液的需要量,,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF,;
3)膜蛋白提取工作液的準備:臨用前,根據(jù)處理樣品的量估算實驗時膜蛋白提取液的需要量,,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF,;
4)結(jié)構(gòu)蛋白提取工作液的制備:臨用前,根據(jù)處理樣品的量估算實驗時結(jié)構(gòu)蛋白提取液的需要量,,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF,。
二、類器官收集及洗滌
1,、類器官收集
移液器吸去培養(yǎng)基,,每孔添加1-2mL左右4℃類器官傳代培養(yǎng)緩沖液(abs9730),輕柔吹打基質(zhì)膠,,收集在15mL離心管中(24孔板,,每5孔為一組),4℃靜置10min或-20℃放置5min(目的是使基質(zhì)膠軟化),,300g ,,4℃, 離心5min棄上清,。
2,、類器官清洗
添加1mL類器官傳代培養(yǎng)緩沖液重懸,300g ,4℃,,離心5min棄上清,。
三、類器官蛋白提取
1,、胞漿蛋白提取
1)向含類器官沉淀的EP中加入2mL的胞漿蛋白提取工作液,,在4℃條件下震蕩20min;
2)準備1-5mL的注射器,,用注射器吹打步驟1震蕩過的溶液50-90次,,在4℃條件下,15000g離心10min,。取上清液存于EP管中,,即為胞漿蛋白。
2,、胞核蛋白的提取
取3.1.2步驟獲得的沉淀物加入4mL冰浴的胞漿蛋白提取工作液,,在4℃條件下震蕩5min,4℃條件下15000g離心10min,,棄去上清液,,沉淀物中加入1mL冰凍的胞核蛋白提取工作液,在4℃條件下震蕩5min,,4℃條件下15000g離心10min,,上清液為細胞核蛋白,轉(zhuǎn)入EP管并保存,。
3,、胞膜蛋白的提取
在步驟3.2中的沉淀物中加入1mL冰凍的膜蛋白提取工作液,在4℃條件下震蕩5min,,4℃條件下15000g離心10min,,上清液為細胞膜蛋白,轉(zhuǎn)入EP管并保存,。
4,、結(jié)構(gòu)蛋白的提取
在步驟3.3的沉淀物中加入常溫或37℃水浴過的透明的結(jié)構(gòu)蛋白提取工作液0.5mL,4℃條件下震蕩5min,,4℃條件下15000g離心10min,,保存上清液即為細胞骨架蛋白。
5,、待測蛋白的保存待檢測濃度的蛋白存于-70℃,,可以用于Western,EMSA,,footprinting,,報告基因檢測以及酶活力測定等后續(xù)操作,。
類器官RNA提取方法
一、類器官收集及洗滌
1,、類器官收集
移液器吸去培養(yǎng)基,,每孔添加1-2mL左右4℃類器官傳代培養(yǎng)緩沖液(abs9730),輕柔吹打基質(zhì)膠,,收集在15mL離心管中(24孔板,每5孔為一組),,4℃靜置10min或-20℃放置5min(目的是使基質(zhì)膠軟化),,300g ,4℃,, 離心5min棄上清,。
2、類器官清洗
添加1mL類器官傳代培養(yǎng)緩沖液重懸,,轉(zhuǎn)移到1.5mL EP管,,300g ,4℃,,離心5min棄上清,。
二、類器官RNA提?。ǔ兛俁NA快速提取試劑盒(含DNase I),,貨號abs60026)
1、向含類器官沉淀的EP中加入1mL的RL(試劑盒組分)溶解細胞,,并用移液槍輕輕吹打混勻,,使RL充分和類器官接觸裂解細胞并滅活RNA酶;
2,、將勻漿樣品劇烈震蕩混勻,,在15-30°C條件下孵育5min以使核蛋白體分解;
3,、每1mL RL加0.2mL氯仿,。蓋緊樣品管蓋,劇烈振蕩15sec并將其在室溫下孵育3min,;
4,、于4℃,12000 rpm離心10min,,樣品會分成三層:下層有機相,,中間層和上層無色的水相,RNA存在于水相中,。水相層的容量大約為所加RL體積的60%,,把水相轉(zhuǎn)移到新管中,,進行下一步操作;
5,、加入1倍體積70%乙醇(請先檢查是否已加入無水乙醇!),,顛倒混勻(此時可能會出現(xiàn)沉淀)。得到的溶液和可能沉淀一起轉(zhuǎn)入吸附柱RA中(吸附柱套在收集管內(nèi)),;
6,、12000 rpm 離心45sec,棄廢液,,將吸附柱重新套回收集管,;
7、加400μL去蛋白液RE,,12000 rpm 離心45sec,,棄廢液;
8,、DNase I工作液的配制:取10μL DNase I儲存液放入新的RNase-free離心管中,,加入70μL RDD溶液,輕柔混勻,;
9,、向吸附柱RA中央加入80μL DNase I工作液,室溫放置15min(一般情況下室溫放置可得到較好的消化效果,,如果室溫效果不佳可選擇在37℃放置15min),;
10、加400μL去蛋白液RE,,12000 rpm 離心45sec,,棄掉廢液;
11,、加入500μL漂洗液RW(請先檢查是否已加入無水乙醇?。?2000 rpm離心45sec,, 棄掉廢液,;
12、加入500μL漂洗液RW,,12000 rpm 離心45sec,,棄掉廢液;
13,、將吸附柱RA放回空收集管中,,12000 rpm離心2min,盡量除去漂洗液,,以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng),;
14,、取出吸附柱RA,放入一個RNase free離心管中,,根據(jù)預(yù)期RNA產(chǎn)量往吸附膜的中間部位加50-80μL RNase free H2O(事先在 65℃水浴中加熱效果更好),,室溫放置2min,12000 rpm 離心1min,,所得溶液即為RNA溶液,。如果需要較多RNA,可將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,,離心1min,。
提取得到的RNA溶液,可以直接應(yīng)用于Northern 雜交,、RT-PCR、Real Time RT-PCR,、cDNA文庫構(gòu)建,、體外翻譯等各種常規(guī)分子生物學(xué)實驗。
今天講解就到這了,,大家如有實驗問題,,歡迎公眾號“愛必信生物"后臺交流哦!
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WB相關(guān):ECL發(fā)光液,、預(yù)染marker、預(yù)制膠,;IHC相關(guān):二抗試劑盒,、組化筆;IP/CoIP試劑盒,;激動劑/抑制劑,;血清、BSA,、蛋白酶K,、CTB、TTX,、CEE,;凋亡試劑盒;呼吸爆發(fā)試劑盒,;ELISA試劑盒,;重組蛋白,;抗體: 二抗、標簽抗體,、對照抗體,;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標記/檢測)...
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