很多老師咨詢類器官RNA和蛋白如何提取,,其實類器官可以按微小組織進行RNA和蛋白提取,,今天小愛給大家講一講提取方法。
類器官蛋白提取方法
一,、試劑準備(細胞漿,、細胞核及細胞膜蛋白抽提試劑盒(abs9346))
1、準備溶液
1)室溫融解試劑盒中的各種溶液,溶解后除結構蛋白提取液外,,其他試劑立即置于冰上,;
2)結構蛋白提取液溶解后,可放置于37℃水浴中溫浴至透明后,,常溫放置,。
2、蛋白提取工作液的準備
1)胞漿蛋白提取工作液的準備:臨用前,,根據處理樣品的量估算實驗時胞漿蛋白提取液的需要量,,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF;
2)胞核蛋白提取工作液的準備:臨用前,,根據處理樣品的量估算實驗時胞核蛋白提取液的需要量,,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF;
3)膜蛋白提取工作液的準備:臨用前,,根據處理樣品的量估算實驗時膜蛋白提取液的需要量,,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF;
4)結構蛋白提取工作液的制備:臨用前,,根據處理樣品的量估算實驗時結構蛋白提取液的需要量,,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF。
二,、類器官收集及洗滌
1,、類器官收集
移液器吸去培養(yǎng)基,每孔添加1-2mL左右4℃類器官傳代培養(yǎng)緩沖液(abs9730),,輕柔吹打基質膠,,收集在15mL離心管中(24孔板,每5孔為一組),,4℃靜置10min或-20℃放置5min(目的是使基質膠軟化),,300g ,4℃,, 離心5min棄上清,。
2、類器官清洗
添加1mL類器官傳代培養(yǎng)緩沖液重懸,,300g ,,4℃,離心5min棄上清,。
三,、類器官蛋白提取
1、胞漿蛋白提取
1)向含類器官沉淀的EP中加入2mL的胞漿蛋白提取工作液,,在4℃條件下震蕩20min,;
2)準備1-5mL的注射器,,用注射器吹打步驟1震蕩過的溶液50-90次,在4℃條件下,,15000g離心10min,。取上清液存于EP管中,,即為胞漿蛋白,。
2、胞核蛋白的提取
取3.1.2步驟獲得的沉淀物加入4mL冰浴的胞漿蛋白提取工作液,,在4℃條件下震蕩5min,,4℃條件下15000g離心10min,棄去上清液,,沉淀物中加入1mL冰凍的胞核蛋白提取工作液,,在4℃條件下震蕩5min,4℃條件下15000g離心10min,,上清液為細胞核蛋白,,轉入EP管并保存。
3,、胞膜蛋白的提取
在步驟3.2中的沉淀物中加入1mL冰凍的膜蛋白提取工作液,,在4℃條件下震蕩5min,4℃條件下15000g離心10min,,上清液為細胞膜蛋白,,轉入EP管并保存。
4,、結構蛋白的提取
在步驟3.3的沉淀物中加入常溫或37℃水浴過的透明的結構蛋白提取工作液0.5mL,,4℃條件下震蕩5min,4℃條件下15000g離心10min,,保存上清液即為細胞骨架蛋白,。
5、待測蛋白的保存待檢測濃度的蛋白存于-70℃,,可以用于Western,,EMSA,footprinting,,報告基因檢測以及酶活力測定等后續(xù)操作,。
類器官RNA提取方法
一、類器官收集及洗滌
1,、類器官收集
移液器吸去培養(yǎng)基,,每孔添加1-2mL左右4℃類器官傳代培養(yǎng)緩沖液(abs9730),輕柔吹打基質膠,,收集在15mL離心管中(24孔板,,每5孔為一組),,4℃靜置10min或-20℃放置5min(目的是使基質膠軟化),300g ,,4℃,, 離心5min棄上清。
2,、類器官清洗
添加1mL類器官傳代培養(yǎng)緩沖液重懸,,轉移到1.5mL EP管,300g ,,4℃,,離心5min棄上清。
二,、類器官RNA提?。ǔ兛俁NA快速提取試劑盒(含DNase I),貨號abs60026)
1,、向含類器官沉淀的EP中加入1mL的RL(試劑盒組分)溶解細胞,,并用移液槍輕輕吹打混勻,使RL充分和類器官接觸裂解細胞并滅活RNA酶,;
2,、將勻漿樣品劇烈震蕩混勻,在15-30°C條件下孵育5min以使核蛋白體分解,;
3,、每1mL RL加0.2mL氯仿。蓋緊樣品管蓋,,劇烈振蕩15sec并將其在室溫下孵育3min,;
4、于4℃,,12000 rpm離心10min,,樣品會分成三層:下層有機相,中間層和上層無色的水相,,RNA存在于水相中,。水相層的容量大約為所加RL體積的60%,把水相轉移到新管中,,進行下一步操作,;
5、加入1倍體積70%乙醇(請先檢查是否已加入無水乙醇!),,顛倒混勻(此時可能會出現沉淀),。得到的溶液和可能沉淀一起轉入吸附柱RA中(吸附柱套在收集管內);
6,、12000 rpm 離心45sec,,棄廢液,,將吸附柱重新套回收集管;
7,、加400μL去蛋白液RE,,12000 rpm 離心45sec,棄廢液,;
8,、DNase I工作液的配制:取10μL DNase I儲存液放入新的RNase-free離心管中,加入70μL RDD溶液,,輕柔混勻,;
9,、向吸附柱RA中央加入80μL DNase I工作液,,室溫放置15min(一般情況下室溫放置可得到較好的消化效果,如果室溫效果不佳可選擇在37℃放置15min),;
10,、加400μL去蛋白液RE,12000 rpm 離心45sec,,棄掉廢液,;
11、加入500μL漂洗液RW(請先檢查是否已加入無水乙醇?。?,12000 rpm離心45sec, 棄掉廢液,;
12,、加入500μL漂洗液RW,12000 rpm 離心45sec,,棄掉廢液,;
13、將吸附柱RA放回空收集管中,,12000 rpm離心2min,,盡量除去漂洗液,以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應,;
14,、取出吸附柱RA,放入一個RNase free離心管中,,根據預期RNA產量往吸附膜的中間部位加50-80μL RNase free H2O(事先在 65℃水浴中加熱效果更好),,室溫放置2min,12000 rpm 離心1min,,所得溶液即為RNA溶液,。如果需要較多RNA,,可將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,離心1min,。
提取得到的RNA溶液,,可以直接應用于Northern 雜交、RT-PCR,、Real Time RT-PCR,、cDNA文庫構建、體外翻譯等各種常規(guī)分子生物學實驗,。
今天講解就到這了,,大家如有實驗問題,歡迎公眾號“愛必信生物"后臺交流哦,!
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abs9730 | 類器官傳代培養(yǎng)緩沖液 | 250ml/ 250ml |
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